Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 DMKN-243ENST00000478648 768 ntTSL 211.97□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-248ENST00000484064 658 ntTSL 211.97□□□□□ -0.493e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-238ENST00000472365 606 ntTSL 211.1□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-218ENST00000460327 762 ntTSL 58.81□□□□□ -13e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 DMKN-266ENST00000601650 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.6□□□□□ -1.033e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MED28-203ENST00000503945 879 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.656e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.26e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-206ENST00000546764 581 ntTSL 420.1■□□□□ 0.814e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-225ENST00000552004 530 ntTSL 419.28■□□□□ 0.684e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBXN1-212ENST00000531625 542 ntTSL 217.46■□□□□ 0.394e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBXN1-211ENST00000531056 560 ntTSL 417.2■□□□□ 0.344e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBXN1-203ENST00000436354 592 ntTSL 216.85■□□□□ 0.294e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBXN1-216ENST00000533908 739 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.144e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-220ENST00000550651 551 ntTSL 414.82□□□□□ -0.044e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IRF9-204ENST00000559229 567 ntTSL 213.97□□□□□ -0.174e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IRF9-210ENST00000560542 819 ntTSL 213.14□□□□□ -0.314e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 UBXN1-209ENST00000528907 861 ntTSL 212.97□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KANSL2-214ENST00000550931 461 ntTSL 512.84□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 212.03□□□□□ -0.481e-9■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-211ENST00000548247 564 ntTSL 412□□□□□ -0.494e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 211.63□□□□□ -0.551e-9■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-215ENST00000519824 3798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.584e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IRF9-213ENST00000561342 1066 ntTSL 510.86□□□□□ -0.674e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.724e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IRF9-207ENST00000560275 841 ntTSL 510.36□□□□□ -0.754e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-224ENST00000551876 539 ntTSL 49.27□□□□□ -0.934e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RRP7BP-202ENST00000421116 729 ntTSL 39.11□□□□□ -0.954e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KANSL2-205ENST00000547582 581 ntTSL 57.31□□□□□ -1.244e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.294e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-218ENST00000549777 570 ntTSL 46.7□□□□□ -1.344e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.394e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ZCCHC8-209ENST00000546149 657 ntTSL 36.36□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.454e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-204ENST00000517801 791 ntTSL 25.1□□□□□ -1.594e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 RACGAP1-226ENST00000552157 386 ntTSL 35.04□□□□□ -1.64e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 PLRG1-208ENST00000506918 543 ntTSL 34.87□□□□□ -1.634e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 SMNDC1-205ENST00000477763 778 ntTSL 24.5□□□□□ -1.694e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.764e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 KANSL2-204ENST00000547536 509 ntTSL 23.97□□□□□ -1.774e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 23.97□□□□□ -1.774e-7■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IPO4-215ENST00000560935 701 ntTSL 318.25■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 9.1
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SF3B4Q15427 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 IPO4-219ENST00000561379 624 ntTSL 413.6□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ERBB3-205ENST00000546884 660 ntTSL 213.22□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ERBB3-207ENST00000549061 560 ntTSL 413.21□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.33e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ZNF549-201ENST00000240719 3969 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 CCDC142-206ENST00000473278 810 ntTSL 211.41□□□□□ -0.583e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ZNF549-202ENST00000376233 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 CCDC142-208ENST00000486335 566 ntTSL 58.26□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ERBB3-212ENST00000549672 676 ntTSL 47.56□□□□□ -1.23e-6■□□□□ 9.1
SF3B4Q15427 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.243e-6■□□□□ 9.1
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SF3B4Q15427 CYTH3-209ENST00000488964 606 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.232e-7■□□□□ 9
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SF3B4Q15427 NSD2-213ENST00000503207 812 ntTSL 312.84□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PSMD11-207ENST00000578397 1178 ntTSL 212.76□□□□□ -0.377e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.392e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-207ENST00000510106 818 ntTSL 311.84□□□□□ -0.512e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-213ENST00000515391 809 ntTSL 211.81□□□□□ -0.522e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-205ENST00000506789 477 ntTSL 511.67□□□□□ -0.542e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-206ENST00000454195 569 ntTSL 411.54□□□□□ -0.562e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-204ENST00000506563 728 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 ZNF124-205ENST00000491848 701 ntTSL 311.24□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.692e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CYTH3-203ENST00000461891 566 ntTSL 410.29□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 KNL1-206ENST00000528975 578 ntTSL 49.76□□□□□ -0.852e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 UCHL5-210ENST00000421683 834 ntTSL 39.57□□□□□ -0.882e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.912e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 KNL1-208ENST00000532056 259 ntTSL 39.08□□□□□ -0.962e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.982e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-203ENST00000504147 722 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-209ENST00000457011 2171 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PPWD1-213ENST00000515447 580 ntTSL 48.66□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-210ENST00000513629 885 ntTSL 38.43□□□□□ -1.062e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 PPWD1-203ENST00000503435 592 ntTSL 48.29□□□□□ -1.082e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.172e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 UBE2Q1-206ENST00000491572 235 ntTSL 27.62□□□□□ -1.192e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.262e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 RPS4X-204ENST00000486733 1820 ntTSL 57.08□□□□□ -1.282e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 CDK7-206ENST00000508726 531 ntTSL 56.55□□□□□ -1.362e-7■□□□□ 9
SF3B4Q15427 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.372e-7■□□□□ 9
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