RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491572.1

UBE2Q1-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 235 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-206ENST00000491572 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.28■□□□□ 0.2
UBE2Q1-206ENST00000491572 ABCC9O60706 1549 aa15.98■□□□□ 0.15
UBE2Q1-206ENST00000491572 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.85■□□□□ 0.13
UBE2Q1-206ENST00000491572 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa15.36■□□□□ 0.05
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.07■□□□□ 0
UBE2Q1-206ENST00000491572 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.83□□□□□ -0.04
UBE2Q1-206ENST00000491572 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
UBE2Q1-206ENST00000491572 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2Q1-206ENST00000491572 NACADO15069 1562 aa14.5□□□□□ -0.09
UBE2Q1-206ENST00000491572 BICRAQ9NZM4 1560 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2Q1-206ENST00000491572 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.41□□□□□ -0.1
UBE2Q1-206ENST00000491572 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.39□□□□□ -0.11
UBE2Q1-206ENST00000491572 CUX2O14529 1486 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2Q1-206ENST00000491572 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRIM41Q8WV44 630 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2Q1-206ENST00000491572 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
UBE2Q1-206ENST00000491572 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.02□□□□□ -0.16
UBE2Q1-206ENST00000491572 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.02□□□□□ -0.17
UBE2Q1-206ENST00000491572 ERCC6Q03468 1493 aa13.9□□□□□ -0.18
UBE2Q1-206ENST00000491572 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
UBE2Q1-206ENST00000491572 SCRIBQ14160 1630 aa13.64□□□□□ -0.23
UBE2Q1-206ENST00000491572 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2Q1-206ENST00000491572 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa13.45□□□□□ -0.26
UBE2Q1-206ENST00000491572 NESP48681 1621 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2Q1-206ENST00000491572 NCAPD3P42695 1498 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2Q1-206ENST00000491572 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
UBE2Q1-206ENST00000491572 OSCARQ8IYS5 282 aa13.37□□□□□ -0.27
UBE2Q1-206ENST00000491572 SMARCA2P51531 1590 aa13.33□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.32□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa13.32□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa13.32□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRHP20396 242 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
UBE2Q1-206ENST00000491572 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.25□□□□□ -0.29
UBE2Q1-206ENST00000491572 HMGXB3Q12766 1538 aa13.22□□□□□ -0.29
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.21□□□□□ -0.29
UBE2Q1-206ENST00000491572 ARHGEF11O15085 1522 aa13.21□□□□□ -0.29
UBE2Q1-206ENST00000491572 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.21□□□□□ -0.3
UBE2Q1-206ENST00000491572 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.19□□□□□ -0.3
UBE2Q1-206ENST00000491572 WDR62O43379 1518 aa13.17□□□□□ -0.3
UBE2Q1-206ENST00000491572 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.15□□□□□ -0.3
UBE2Q1-206ENST00000491572 CYB5RLQ6IPT4 315 aa13.09□□□□□ -0.31
UBE2Q1-206ENST00000491572 ARAP1Q96P48 1450 aa13□□□□□ -0.33
UBE2Q1-206ENST00000491572 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
UBE2Q1-206ENST00000491572 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2Q1-206ENST00000491572 SMARCA4P51532 1647 aa12.91□□□□□ -0.34
UBE2Q1-206ENST00000491572 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-206ENST00000491572 HRCP23327 699 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-206ENST00000491572 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-206ENST00000491572 PEG3Q9GZU2 1588 aa12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-206ENST00000491572 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.77□□□□□ -0.37
UBE2Q1-206ENST00000491572 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
UBE2Q1-206ENST00000491572 IFT140Q96RY7 1462 aa12.67□□□□□ -0.38
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHD1O14646 1710 aa12.65□□□□□ -0.38
UBE2Q1-206ENST00000491572 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.64□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.64□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 FBXO41Q8TF61 875 aa12.61□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.59□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.59□□□□□ -0.39
UBE2Q1-206ENST00000491572 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
UBE2Q1-206ENST00000491572 CFTRP13569 1480 aa12.58□□□□□ -0.4
UBE2Q1-206ENST00000491572 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.57□□□□□ -0.4
UBE2Q1-206ENST00000491572 SOCS7O14512 581 aa12.54□□□□□ -0.4
UBE2Q1-206ENST00000491572 FBLN2P98095 1184 aa12.52□□□□□ -0.41
UBE2Q1-206ENST00000491572 HECW2Q9P2P5 1572 aa12.5□□□□□ -0.41
UBE2Q1-206ENST00000491572 MROH2BQ7Z745 1585 aa12.49□□□□□ -0.41
UBE2Q1-206ENST00000491572 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.49□□□□□ -0.41
UBE2Q1-206ENST00000491572 SYNJ1O43426 1573 aa12.45□□□□□ -0.42
UBE2Q1-206ENST00000491572 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.45□□□□□ -0.429e-8■■■■■ 30.5
UBE2Q1-206ENST00000491572 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.44□□□□□ -0.42
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.42□□□□□ -0.42
UBE2Q1-206ENST00000491572 TOPBP1Q92547 1522 aa12.41□□□□□ -0.42
UBE2Q1-206ENST00000491572 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 ILDR2Q71H61 639 aa12.37□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 KDM6BO15054 1643 aa12.36□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 ABCC8Q09428 1581 aa12.35□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 ADGRL1O94910 1474 aa12.34□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 SYNJ2O15056 1496 aa12.34□□□□□ -0.43
UBE2Q1-206ENST00000491572 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.33□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 PRDM2Q13029 1718 aa12.31□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.29□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 ABCC10Q5T3U5 1492 aa12.28□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.28□□□□□ -0.44
UBE2Q1-206ENST00000491572 MYT1Q01538 1121 aa12.27□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 WDR97A6NE52 1622 aa12.26□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 WIZO95785 1651 aa12.26□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 FAM69CQ0P6D2 419 aa12.25□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 DIP2BQ9P265 1576 aa12.22□□□□□ -0.45
UBE2Q1-206ENST00000491572 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
UBE2Q1-206ENST00000491572 MAPKBP1O60336 1514 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 120.3 ms