Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-205ENST00000592094 1042 ntTSL 1 (best)16.1■□□□□ 0.172e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.522e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-204ENST00000588654 541 ntTSL 410.99□□□□□ -0.652e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 LINC00910-202ENST00000586231 2890 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.692e-34■■■■■ 284.4
SF3B4Q15427 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.03□□□□□ -2.082e-34■■■■■ 284.4
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SF3B4Q15427 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.234e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.384e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-205ENST00000373568 1037 ntTSL 511.84□□□□□ -0.514e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 HDAC8-216ENST00000470998 329 ntTSL 34.91□□□□□ -1.624e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.964e-73■■■■■ 236.6
SF3B4Q15427 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.49□□□□□ -1.058e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.168e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.088e-41■■■■■ 213
SF3B4Q15427 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 216.08■□□□□ 0.164e-68■■■■■ 210.2
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SF3B4Q15427 RUVBL1-203ENST00000472125 913 ntTSL 39.77□□□□□ -0.854e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RUVBL1-208ENST00000585057 1113 ntTSL 39.58□□□□□ -0.884e-71■■■■■ 209.9
SF3B4Q15427 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.62□□□□□ -1.834e-71■■■■■ 209.9
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SF3B4Q15427 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.046e-130■■■■■ 189.4
SF3B4Q15427 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.03□□□□□ -2.086e-130■■■■■ 189.4
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SF3B4Q15427 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt10□□□□□ -0.813e-34■■■■■ 160.9
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SF3B4Q15427 XAB2-203ENST00000596134 543 ntTSL 215.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 145.6
SF3B4Q15427 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 29.08□□□□□ -0.962e-38■■■■■ 144.8
SF3B4Q15427 PLXNA3-205ENST00000482598 280 ntTSL 316.2■□□□□ 0.184e-39■■■■■ 140.6
SF3B4Q15427 SRSF1-203ENST00000581497 438 ntTSL 37.16□□□□□ -1.264e-66■■■■■ 131.8
SF3B4Q15427 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 38.34□□□□□ -1.076e-35■■■■■ 131.2
SF3B4Q15427 SMPD4-211ENST00000449159 635 ntTSL 59.51□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 130
SF3B4Q15427 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-11■■■■■ 127.1
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SF3B4Q15427 ZDHHC8-205ENST00000468112 524 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.376e-11■■■■■ 127.1
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-227ENST00000435880 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-310ENST00000627181 1099 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-320ENST00000627918 1146 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-313ENST00000627327 1257 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-353ENST00000629836 723 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-367ENST00000630975 931 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-335ENST00000628883 891 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-349ENST00000629533 1227 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-343ENST00000629339 870 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-304ENST00000626898 961 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-328ENST00000628374 766 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-350ENST00000629603 874 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-333ENST00000628757 623 ntTSL 59.21□□□□□ -0.942e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-324ENST00000628263 755 ntTSL 57.31□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-276ENST00000625447 923 ntTSL 57.3□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.262e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-205ENST00000413791 743 ntTSL 27.1□□□□□ -1.272e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-208ENST00000415742 564 ntTSL 46.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-344ENST00000629374 676 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-345ENST00000629407 767 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-11■■■■■ 120.9
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SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-337ENST00000629084 761 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-308ENST00000627074 871 ntTSL 56.84□□□□□ -1.312e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-303ENST00000626842 741 ntTSL 56.75□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-340ENST00000629188 705 ntTSL 56.58□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-298ENST00000626632 708 ntTSL 56.53□□□□□ -1.362e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-369ENST00000631107 840 ntTSL 56.51□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-201ENST00000366234 884 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-218ENST00000421843 664 ntTSL 56.25□□□□□ -1.412e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-204ENST00000413436 602 ntTSL 45.97□□□□□ -1.452e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-226ENST00000434781 565 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-234ENST00000444320 809 ntTSL 55.76□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-216ENST00000420309 573 ntTSL 45.76□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-209ENST00000416068 555 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-238ENST00000456161 880 ntTSL 35.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-317ENST00000627540 662 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-257ENST00000601396 679 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-370ENST00000631110 851 ntTSL 55.72□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-347ENST00000629485 784 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-332ENST00000628667 745 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-245ENST00000594548 692 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
SF3B4Q15427 PCBP1-AS1-295ENST00000626558 699 ntTSL 55.66□□□□□ -1.52e-11■■■■■ 120.9
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