Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 FLOT1-212ENST00000487376 1583 ntTSL 519.14■□□□□ 0.656e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.618e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-211ENST00000620895 583 ntTSL 318.61■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 BTG3-204ENST00000464058 531 ntTSL 217.42■□□□□ 0.386e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-208ENST00000466694 1854 ntTSL 517.25■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.326e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.276e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.236e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.186e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-204ENST00000577901 917 ntTSL 216.06■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-219ENST00000570273 1425 ntTSL 1 (best)15.71■□□□□ 0.116e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-204ENST00000418160 457 ntTSL 315.65■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-215ENST00000568676 571 ntTSL 215.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-205ENST00000562914 570 ntTSL 215.54■□□□□ 0.086e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.076e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 215.4■□□□□ 0.066e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-209ENST00000476729 562 ntTSL 215.17■□□□□ 0.026e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-209ENST00000585042 567 ntTSL 414.9□□□□□ -0.026e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-214ENST00000495460 947 ntTSL 514.83□□□□□ -0.046e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-207ENST00000454845 629 ntTSL 314.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-217ENST00000487346 578 ntTSL 214.17□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNRK-205ENST00000462810 1903 ntTSL 214.15□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 314.13□□□□□ -0.156e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-210ENST00000565966 798 ntTSL 513.94□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-218ENST00000569569 1125 ntTSL 213.92□□□□□ -0.186e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.26e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-205ENST00000438162 888 ntTSL 513.73□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.236e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.266e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.316e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-225ENST00000534190 1980 ntTSL 212.61□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.396e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 SNRK-202ENST00000429705 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.46e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-204ENST00000396099 3228 ntTSL 512.1□□□□□ -0.476e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-206ENST00000445853 792 ntTSL 1 (best)12.07□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-217ENST00000570001 4828 ntTSL 211.95□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-204ENST00000393801 5069 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 MDM4-210ENST00000470797 909 ntTSL 211.85□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-202ENST00000396410 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FLOT1-203ENST00000416018 592 ntTSL 311.74□□□□□ -0.536e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.556e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.576e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-205ENST00000524845 2771 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-216ENST00000569715 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.626e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-226ENST00000534534 2968 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-201ENST00000265636 4794 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HIPK1-202ENST00000361587 5766 ntTSL 1 (best)10.83□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.755e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.86e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-205ENST00000404113 4005 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.846e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.878e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.926e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 RAD21-201ENST00000297338 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.936e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 IGF2BP2-210ENST00000494906 918 ntTSL 59.17□□□□□ -0.941e-10■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-218ENST00000529710 3228 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.025e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ACTB-208ENST00000464611 715 ntTSL 58.6□□□□□ -1.036e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.066e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FRYL-201ENST00000302806 2365 ntTSL 28.34□□□□□ -1.076e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.086e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 VPS39-213ENST00000570062 842 ntTSL 38.12□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.126e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.136e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 AC068547.1-202ENST00000637224 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.92□□□□□ -1.148e-19■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 ACACA-228ENST00000613146 3974 ntTSL 1 (best)7.8□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.195e-7■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-215ENST00000567306 980 ntTSL 57.61□□□□□ -1.196e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.26e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PDXDC1-201ENST00000325823 1113 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.26e-8■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 HERPUD1-206ENST00000563343 567 ntTSL 47.43□□□□□ -1.228e-10■■■■■ 33.4
RBM22Q9NW64 PMPCA-206ENST00000610649 756 ntTSL 57.42□□□□□ -1.226e-8■■■■■ 33.4
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