Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 SLC25A3-205ENST00000547444 517 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.065e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC25A3-208ENST00000547908 893 ntTSL 26.26□□□□□ -1.415e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-216ENST00000490796 698 ntTSL 219.66■□□□□ 0.742e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 218.25■□□□□ 0.512e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-203ENST00000395751 4653 ntTSL 217.1■□□□□ 0.332e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 314.26□□□□□ -0.132e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SREBF1-223ENST00000584760 564 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-10■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SETD5-208ENST00000421188 1323 ntTSL 59.41□□□□□ -0.91e-6■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 NKD1-203ENST00000566396 748 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 24.1
RBM22Q9NW64 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.721e-8■■■■□ 24
RBM22Q9NW64 EIF4G1-228ENST00000456033 694 ntTSL 511.61□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 24
RBM22Q9NW64 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-7■■■■□ 24
RBM22Q9NW64 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.063e-7■■■■□ 24
RBM22Q9NW64 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.663e-6■■■■□ 24
RBM22Q9NW64 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.582e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 514.55□□□□□ -0.084e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.796e-18■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.126e-18■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TRA2B-206ENST00000456380 1697 ntTSL 512.26□□□□□ -0.456e-18■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 PFKFB4-214ENST00000490404 849 ntTSL 310.08□□□□□ -0.81e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.458e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 USP7-208ENST00000563961 4533 ntTSL 514.62□□□□□ -0.078e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.538e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 USP7-210ENST00000565455 3554 ntTSL 25.39□□□□□ -1.558e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-208ENST00000450000 574 ntTSL 421.96■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-209ENST00000463244 545 ntTSL 420.48■□□□□ 0.871e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-204ENST00000413232 727 ntTSL 319.13■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-225ENST00000545934 565 ntTSL 416.45■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC12A4-218ENST00000576513 412 ntTSL 513.68□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 413.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-223ENST00000544669 1800 ntTSL 513.18□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-218ENST00000537641 1728 ntTSL 512.14□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-211ENST00000477890 1234 ntTSL 511.65□□□□□ -0.541e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 411.19□□□□□ -0.621e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-221ENST00000543545 495 ntTSL 510.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-217ENST00000537162 801 ntTSL 38.85□□□□□ -0.991e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.011e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-206ENST00000448745 1749 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-216ENST00000536548 598 ntTSL 47.65□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-224ENST00000544990 646 ntTSL 37.41□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-214ENST00000535222 940 ntTSL 36.92□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.83□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-215ENST00000536145 546 ntTSL 46.81□□□□□ -1.321e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-222ENST00000544585 722 ntTSL 25.77□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-219ENST00000539952 953 ntTSL 55.77□□□□□ -1.491e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.561e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 531.66■■■□□ 2.661e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.351e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.591e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.951e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-204ENST00000570310 595 ntTSL 315□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-208ENST00000574884 726 ntTSL 514.69□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 SLC25A10-206ENST00000573246 898 ntTSL 314.17□□□□□ -0.141e-6■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 BMP2K-203ENST00000502613 6902 ntTSL 1 (best)5.12□□□□□ -1.595e-7■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-204ENST00000525928 1710 ntTSL 27.03□□□□□ -1.288e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-222ENST00000546088 1728 ntTSL 36.5□□□□□ -1.378e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-210ENST00000529435 1011 ntTSL 55.47□□□□□ -1.538e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-215ENST00000530769 4358 ntTSL 24.81□□□□□ -1.648e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-214ENST00000530089 1429 ntTSL 32.8□□□□□ -1.968e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 31.81□□□□□ -2.128e-13■■■■□ 23.9
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 523.75■■□□□ 1.393e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.33e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.223e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.453e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.733e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.113e-8■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 519.08■□□□□ 0.642e-7■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 416.88■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 515.52■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 415.07■□□□□ 02e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 413.5□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 413.37□□□□□ -0.272e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 512.74□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 512.74□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 410.01□□□□□ -0.812e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.056e-9■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 COL9A3-213ENST00000489045 838 ntTSL 523.01■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 COL9A3-211ENST00000477612 635 ntTSL 321.81■■□□□ 1.082e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 COL9A3-202ENST00000452372 596 ntTSL 520.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.052e-12■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-12■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 212.21□□□□□ -0.462e-12■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 ARID1A-203ENST00000430291 580 ntTSL 48.97□□□□□ -0.975e-7■■■■□ 23.8
RBM22Q9NW64 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.887e-15■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.717e-15■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.597e-15■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 GAMT-204ENST00000640164 520 ntTSL 215.91■□□□□ 0.147e-15■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 GAMT-203ENST00000591788 401 ntTSL 57.18□□□□□ -1.267e-15■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 AFG3L1P-207ENST00000423742 1012 ntTSL 322.85■■□□□ 1.253e-11■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.24■□□□□ 0.833e-11■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 AFG3L1P-215ENST00000457926 2919 ntTSL 218.82■□□□□ 0.63e-11■■■■□ 23.7
RBM22Q9NW64 AFG3L1P-211ENST00000436447 3003 ntTSL 518.82■□□□□ 0.63e-11■■■■□ 23.7
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