RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452372.1

COL9A3-202, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 5

Gene COL9A3, Length 596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-202ENST00000452372 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.42■■■■■ 5.34
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COL9A3-202ENST00000452372 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.13■■■■■ 4.18
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COL9A3-202ENST00000452372 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.44■■■■■ 4.06
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COL9A3-202ENST00000452372 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.88■■■■□ 3.81
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COL9A3-202ENST00000452372 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.35■■■■□ 3.57
COL9A3-202ENST00000452372 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.34■■■■□ 3.57
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COL9A3-202ENST00000452372 ERCC6Q03468 1493 aa37.19■■■■□ 3.54
COL9A3-202ENST00000452372 CUX2O14529 1486 aa37.11■■■■□ 3.53
COL9A3-202ENST00000452372 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.03■■■■□ 3.52
COL9A3-202ENST00000452372 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.87■■■■□ 3.49
COL9A3-202ENST00000452372 WIZO95785 1651 aa36.87■■■■□ 3.49
COL9A3-202ENST00000452372 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
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COL9A3-202ENST00000452372 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.67■■■■□ 3.46
COL9A3-202ENST00000452372 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.66■■■■□ 3.46
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COL9A3-202ENST00000452372 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.34■■■■□ 3.41
COL9A3-202ENST00000452372 CFTRP13569 1480 aa36.31■■■■□ 3.4
COL9A3-202ENST00000452372 WDR62O43379 1518 aa36.25■■■■□ 3.39
COL9A3-202ENST00000452372 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.23■■■■□ 3.39
COL9A3-202ENST00000452372 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.21■■■■□ 3.39
COL9A3-202ENST00000452372 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.04■■■■□ 3.36
COL9A3-202ENST00000452372 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
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COL9A3-202ENST00000452372 PRDM2Q13029 1718 aa35.86■■■■□ 3.33
COL9A3-202ENST00000452372 TOPBP1Q92547 1522 aa35.57■■■■□ 3.29
COL9A3-202ENST00000452372 OSCARQ8IYS5 282 aa35.52■■■■□ 3.28
COL9A3-202ENST00000452372 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
COL9A3-202ENST00000452372 IFT140Q96RY7 1462 aa35.5■■■■□ 3.27
COL9A3-202ENST00000452372 ABCC8Q09428 1581 aa35.47■■■■□ 3.27
COL9A3-202ENST00000452372 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.42■■■■□ 3.26
COL9A3-202ENST00000452372 TRIM41Q8WV44 630 aa35.38■■■■□ 3.25
COL9A3-202ENST00000452372 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
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COL9A3-202ENST00000452372 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
COL9A3-202ENST00000452372 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
COL9A3-202ENST00000452372 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
COL9A3-202ENST00000452372 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
COL9A3-202ENST00000452372 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.99■■■■□ 3.19
COL9A3-202ENST00000452372 CHD1O14646 1710 aa34.95■■■■□ 3.19
COL9A3-202ENST00000452372 ARHGEF11O15085 1522 aa34.9■■■■□ 3.18
COL9A3-202ENST00000452372 FBLN2P98095 1184 aa34.88■■■■□ 3.17
COL9A3-202ENST00000452372 WDR97A6NE52 1622 aa34.82■■■■□ 3.16
COL9A3-202ENST00000452372 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.78■■■■□ 3.16
COL9A3-202ENST00000452372 GRIN2BQ13224 1484 aa34.72■■■■□ 3.15
COL9A3-202ENST00000452372 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.69■■■■□ 3.14
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COL9A3-202ENST00000452372 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.55■■■■□ 3.12
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COL9A3-202ENST00000452372 CEP170Q5SW79 1584 aa34.17■■■■□ 3.06
COL9A3-202ENST00000452372 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.11■■■■□ 3.05
COL9A3-202ENST00000452372 SHROOM2Q13796 1616 aa34.01■■■■□ 3.03
COL9A3-202ENST00000452372 KIF27Q86VH2 1401 aa33.95■■■■□ 3.02
COL9A3-202ENST00000452372 IGF1RP08069 1367 aa33.9■■■■□ 3.02
COL9A3-202ENST00000452372 JPH4Q96JJ6 628 aa33.89■■■■□ 3.02
COL9A3-202ENST00000452372 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
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