RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457926.5

AFG3L1P-215, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,919 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		37.62	■■■■□ 3.61
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.01	■■■□□ 2.87
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.15	■■■□□ 2.74
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		31.52	■■■□□ 2.64
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		31.28	■■■□□ 2.6
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		31.16	■■■□□ 2.58
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		30.8	■■■□□ 2.52
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		30.68	■■■□□ 2.5
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HRC	P23327	699 aa		30.58	■■■□□ 2.49
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		30.5	■■■□□ 2.47
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	30.33	■■■□□ 2.45
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SCRIB	Q14160	1630 aa		30.18	■■■□□ 2.42
AFG3L1P-215	ENST00000457926	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		30.17	■■■□□ 2.42
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	30.12	■■■□□ 2.41
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30	■■■□□ 2.39
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30	■■■□□ 2.39
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ABCC9	O60706	1549 aa		29.98	■■■□□ 2.39
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		29.73	■■■□□ 2.35
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		29.62	■■■□□ 2.33
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.42	■■■□□ 2.3
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NACAD	O15069	1562 aa		29.29	■■■□□ 2.28
AFG3L1P-215	ENST00000457926	WIZ	O95785	1651 aa		29.26	■■■□□ 2.27
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.17	■■■□□ 2.26
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	28.86	■■■□□ 2.21
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.83	■■■□□ 2.21
AFG3L1P-215	ENST00000457926	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.75	■■■□□ 2.19
AFG3L1P-215	ENST00000457926	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.68	■■■□□ 2.18
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SOGA1	O94964	1423 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
AFG3L1P-215	ENST00000457926	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SMARCA4	P51532	1647 aa		28.58	■■■□□ 2.17
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SMARCA2	P51531	1590 aa		28.51	■■■□□ 2.15
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.51	■■■□□ 2.15
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.49	■■■□□ 2.15
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.49	■■■□□ 2.15
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
AFG3L1P-215	ENST00000457926	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		28.38	■■■□□ 2.13
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.29	■■■□□ 2.12
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
AFG3L1P-215	ENST00000457926	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.22	■■■□□ 2.11
AFG3L1P-215	ENST00000457926	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		28.11	■■■□□ 2.09
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.11	■■■□□ 2.09
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NEUROD1	Q13562	356 aa		28.1	■■■□□ 2.09
AFG3L1P-215	ENST00000457926	EEA1	Q15075	1411 aa		28.1	■■■□□ 2.09
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
AFG3L1P-215	ENST00000457926	APLP2	Q06481	763 aa		28	■■■□□ 2.07
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.99	■■■□□ 2.07
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CLIP1	P30622	1438 aa		27.95	■■■□□ 2.06
AFG3L1P-215	ENST00000457926	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
AFG3L1P-215	ENST00000457926	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		27.92	■■■□□ 2.06
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		27.9	■■■□□ 2.06
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		27.87	■■■□□ 2.05
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		27.86	■■■□□ 2.05
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		27.77	■■■□□ 2.04
AFG3L1P-215	ENST00000457926	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		27.72	■■■□□ 2.03
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KIF21B	O75037	1637 aa		27.66	■■■□□ 2.02
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MIER1	Q8N108	512 aa		27.64	■■■□□ 2.02
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ITGAE	P38570	1179 aa		27.56	■■■□□ 2
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.46	■■□□□ 1.99
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ARAP1	Q96P48	1450 aa		27.34	■■□□□ 1.97
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.34	■■□□□ 1.97
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CUX1	P39880	1505 aa		27.32	■■□□□ 1.96
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.3	■■□□□ 1.96
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.27	■■□□□ 1.96
AFG3L1P-215	ENST00000457926	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.23	■■□□□ 1.95
AFG3L1P-215	ENST00000457926	P3H3	Q8IVL6	736 aa		27.23	■■□□□ 1.95
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NCAPD3	P42695	1498 aa		27.22	■■□□□ 1.95
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.19	■■□□□ 1.94
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CUX2	O14529	1486 aa		27.12	■■□□□ 1.93
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CFTR	P13569	1480 aa		27.12	■■□□□ 1.93
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.11	■■□□□ 1.93
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.1	■■□□□ 1.93
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HMGXB3	Q12766	1538 aa		27.09	■■□□□ 1.93
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.07	■■□□□ 1.92
AFG3L1P-215	ENST00000457926	IGF1R	P08069	1367 aa		27.04	■■□□□ 1.92
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.01	■■□□□ 1.91
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27	■■□□□ 1.91
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		26.98	■■□□□ 1.91
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		26.94	■■□□□ 1.9
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		26.91	■■□□□ 1.9
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		26.91	■■□□□ 1.9
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		26.89	■■□□□ 1.89
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KCNH8	Q96L42	1107 aa		26.88	■■□□□ 1.89
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	26.86	■■□□□ 1.89
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		26.83	■■□□□ 1.89

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