Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 215.25■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 AC004922.1-202ENST00000441989 1702 ntTSL 215.14■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-229ENST00000396342 675 ntTSL 315.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-263ENST00000508317 538 ntTSL 415.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-256ENST00000505066 556 ntTSL 415.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 03e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-248ENST00000503180 527 ntTSL 415.06■□□□□ 06e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-205ENST00000493673 1650 ntTSL 515.06■□□□□ 03e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 314.96□□□□□ -0.013e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 214.94□□□□□ -0.024e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CDK18-202ENST00000419301 949 ntTSL 514.93□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LAMA5-210ENST00000491036 728 ntTSL 214.9□□□□□ -0.023e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-268ENST00000512694 623 ntTSL 414.84□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IFT140-204ENST00000439987 2580 ntTSL 214.67□□□□□ -0.063e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-250ENST00000503628 570 ntTSL 414.6□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ARPC1B-209ENST00000443222 669 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MAP4-212ENST00000468075 487 ntTSL 514.53□□□□□ -0.084e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 514.34□□□□□ -0.113e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-237ENST00000437124 587 ntTSL 413.88□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-278ENST00000515233 580 ntTSL 413.74□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 313.71□□□□□ -0.213e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LYPLA2-206ENST00000420982 614 ntTSL 313.64□□□□□ -0.233e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMC4-205ENST00000601194 650 ntTSL 313.52□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-253ENST00000504651 571 ntTSL 313.44□□□□□ -0.266e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-206ENST00000475078 490 ntTSL 413.26□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 213.24□□□□□ -0.293e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-204ENST00000472351 791 ntTSL 413.15□□□□□ -0.33e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.353e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-207ENST00000495805 811 ntTSL 212.8□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-204ENST00000476467 2067 ntTSL 212.79□□□□□ -0.363e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SMOC1-204ENST00000555917 570 ntTSL 412.77□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PDS5A-205ENST00000506262 559 ntTSL 312.7□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 DDR1-247ENST00000502955 574 ntTSL 412.56□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 TOR1A-204ENST00000474192 947 ntTSL 312.46□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.443e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 RBFOX2-214ENST00000495377 733 ntTSL 511.84□□□□□ -0.513e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 411.65□□□□□ -0.543e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NCAPG2-210ENST00000491792 581 ntTSL 311.58□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-219ENST00000581250 578 ntTSL 411.17□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 RBFOX2-203ENST00000397303 1354 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IFT140-202ENST00000397417 4023 ntTSL 511.06□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MBD1-218ENST00000589541 836 ntTSL 310.82□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 310.7□□□□□ -0.73e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-207ENST00000475554 583 ntTSL 310.6□□□□□ -0.713e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-209ENST00000486763 549 ntTSL 410.34□□□□□ -0.753e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-218ENST00000580745 535 ntTSL 410.27□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-208ENST00000578178 468 ntTSL 410.26□□□□□ -0.773e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 RNF144A-203ENST00000432850 805 ntTSL 39.7□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 49.68□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-220ENST00000581835 379 ntTSL 29.66□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-201ENST00000285124 2917 ntTSL 59.51□□□□□ -0.893e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-224ENST00000583092 554 ntTSL 49.46□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 GALNT10-209ENST00000521781 703 ntTSL 59.31□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.933e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-201ENST00000265745 769 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 38.7□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 LIMK2-201ENST00000331728 3670 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 IQSEC1-203ENST00000474467 436 ntTSL 37.7□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-211ENST00000578875 580 ntTSL 47.61□□□□□ -1.193e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-212ENST00000579415 563 ntTSL 47.57□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 CCNI-207ENST00000513774 517 ntTSL 47.54□□□□□ -1.23e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 SZRD1-208ENST00000476423 567 ntTSL 47.52□□□□□ -1.213e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 56.93□□□□□ -1.33e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-216ENST00000580283 378 ntTSL 26.73□□□□□ -1.333e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP4R1-226ENST00000583903 549 ntTSL 46.61□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-209ENST00000457055 465 ntTSL 45.65□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.563e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-205ENST00000414632 548 ntTSL 45.18□□□□□ -1.583e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 VPS41-206ENST00000418457 532 ntTSL 53.52□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PLEKHM2-203ENST00000462455 509 ntTSL 512.15□□□□□ -0.467e-9■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 ZFP36L1-204ENST00000555997 3094 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.722e-12■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 34.3
PCBP2Q15366 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.798e-7■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.032e-6■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 316.17■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 PRKAR1B-208ENST00000456696 518 ntTSL 515.88■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-16■■■■■ 34.2
PCBP2Q15366 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-16■■■■■ 34.2
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