RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491036.2

LAMA5-210, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 2

Gene LAMA5, Length 728 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-210ENST00000491036 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.09■■■■■ 4.01
LAMA5-210ENST00000491036 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.92■■■■□ 3.34
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC9O60706 1549 aa35.8■■■■□ 3.32
LAMA5-210ENST00000491036 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.13■■■■□ 3.05
LAMA5-210ENST00000491036 NACADO15069 1562 aa33.92■■■■□ 3.02
LAMA5-210ENST00000491036 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.9■■■■□ 3.02
LAMA5-210ENST00000491036 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.44■■■□□ 2.94
LAMA5-210ENST00000491036 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.42■■■□□ 2.94
LAMA5-210ENST00000491036 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.41■■■□□ 2.94
LAMA5-210ENST00000491036 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.38■■■□□ 2.937e-7■■□□□ 13.1
LAMA5-210ENST00000491036 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
LAMA5-210ENST00000491036 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.1■■■□□ 2.89
LAMA5-210ENST00000491036 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.08■■■□□ 2.89
LAMA5-210ENST00000491036 SCRIBQ14160 1630 aa32.78■■■□□ 2.84
LAMA5-210ENST00000491036 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
LAMA5-210ENST00000491036 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.34■■■□□ 2.77
LAMA5-210ENST00000491036 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
LAMA5-210ENST00000491036 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.22■■■□□ 2.75
LAMA5-210ENST00000491036 NCAPD3P42695 1498 aa31.28■■■□□ 2.6
LAMA5-210ENST00000491036 SMARCA4P51532 1647 aa31.26■■■□□ 2.59
LAMA5-210ENST00000491036 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.22■■■□□ 2.59
LAMA5-210ENST00000491036 SMARCA2P51531 1590 aa31.17■■■□□ 2.58
LAMA5-210ENST00000491036 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
LAMA5-210ENST00000491036 HMGXB3Q12766 1538 aa31.07■■■□□ 2.56
LAMA5-210ENST00000491036 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
LAMA5-210ENST00000491036 ERCC6Q03468 1493 aa30.91■■■□□ 2.54
LAMA5-210ENST00000491036 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.91■■■□□ 2.54
LAMA5-210ENST00000491036 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.91■■■□□ 2.54
LAMA5-210ENST00000491036 NESP48681 1621 aa30.79■■■□□ 2.52
LAMA5-210ENST00000491036 CUX2O14529 1486 aa30.76■■■□□ 2.51
LAMA5-210ENST00000491036 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
LAMA5-210ENST00000491036 WIZO95785 1651 aa30.58■■■□□ 2.49
LAMA5-210ENST00000491036 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.57■■■□□ 2.48
LAMA5-210ENST00000491036 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.44■■■□□ 2.46
LAMA5-210ENST00000491036 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
LAMA5-210ENST00000491036 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.4■■■□□ 2.46
LAMA5-210ENST00000491036 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.36■■■□□ 2.45
LAMA5-210ENST00000491036 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
LAMA5-210ENST00000491036 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
LAMA5-210ENST00000491036 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.13■■■□□ 2.41
LAMA5-210ENST00000491036 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.06■■■□□ 2.4
LAMA5-210ENST00000491036 WDR62O43379 1518 aa30.04■■■□□ 2.4
LAMA5-210ENST00000491036 CFTRP13569 1480 aa30.03■■■□□ 2.4
LAMA5-210ENST00000491036 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.03■■■□□ 2.4
LAMA5-210ENST00000491036 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.84■■■□□ 2.37
LAMA5-210ENST00000491036 PRDM2Q13029 1718 aa29.83■■■□□ 2.37
LAMA5-210ENST00000491036 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
LAMA5-210ENST00000491036 TOPBP1Q92547 1522 aa29.48■■■□□ 2.31
LAMA5-210ENST00000491036 IFT140Q96RY7 1462 aa29.44■■■□□ 2.3
LAMA5-210ENST00000491036 ABCC8Q09428 1581 aa29.43■■■□□ 2.3
LAMA5-210ENST00000491036 OSCARQ8IYS5 282 aa29.42■■■□□ 2.3
LAMA5-210ENST00000491036 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.39■■■□□ 2.29
LAMA5-210ENST00000491036 TRIM41Q8WV44 630 aa29.38■■■□□ 2.29
LAMA5-210ENST00000491036 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
LAMA5-210ENST00000491036 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
LAMA5-210ENST00000491036 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
LAMA5-210ENST00000491036 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
LAMA5-210ENST00000491036 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
LAMA5-210ENST00000491036 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
LAMA5-210ENST00000491036 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.1■■■□□ 2.25
LAMA5-210ENST00000491036 SOGA1O94964 1423 aa29.08■■■□□ 2.25
LAMA5-210ENST00000491036 CHD1O14646 1710 aa29.04■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.04■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 CUX1P39880 1505 aa29.03■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.02■■■□□ 2.24
LAMA5-210ENST00000491036 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
LAMA5-210ENST00000491036 FBLN2P98095 1184 aa28.99■■■□□ 2.23
LAMA5-210ENST00000491036 ARHGEF11O15085 1522 aa28.91■■■□□ 2.22
LAMA5-210ENST00000491036 WDR97A6NE52 1622 aa28.9■■■□□ 2.22
LAMA5-210ENST00000491036 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.85■■■□□ 2.21
LAMA5-210ENST00000491036 GRIN2BQ13224 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
LAMA5-210ENST00000491036 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
LAMA5-210ENST00000491036 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
LAMA5-210ENST00000491036 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.75■■■□□ 2.19
LAMA5-210ENST00000491036 PBRM1Q86U86 1689 aa28.74■■■□□ 2.19
LAMA5-210ENST00000491036 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.72■■■□□ 2.19
LAMA5-210ENST00000491036 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.69■■■□□ 2.18
LAMA5-210ENST00000491036 SYNJ1O43426 1573 aa28.67■■■□□ 2.18
LAMA5-210ENST00000491036 SYNJ2O15056 1496 aa28.67■■■□□ 2.18
LAMA5-210ENST00000491036 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.65■■■□□ 2.18
LAMA5-210ENST00000491036 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.64■■■□□ 2.17
LAMA5-210ENST00000491036 ARAP1Q96P48 1450 aa28.63■■■□□ 2.17
LAMA5-210ENST00000491036 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.62■■■□□ 2.17
LAMA5-210ENST00000491036 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.62■■■□□ 2.17
LAMA5-210ENST00000491036 TOP2BQ02880 1626 aa28.61■■■□□ 2.17
LAMA5-210ENST00000491036 ADAMTS12P58397 1594 aa28.42■■■□□ 2.14
LAMA5-210ENST00000491036 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
LAMA5-210ENST00000491036 GRIN2AQ12879 1464 aa28.41■■■□□ 2.14
LAMA5-210ENST00000491036 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.35■■■□□ 2.13
LAMA5-210ENST00000491036 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.34■■■□□ 2.13
LAMA5-210ENST00000491036 CEP170Q5SW79 1584 aa28.32■■■□□ 2.12
LAMA5-210ENST00000491036 NUP160Q12769 1436 aa28.29■■■□□ 2.12
LAMA5-210ENST00000491036 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.24■■■□□ 2.11
LAMA5-210ENST00000491036 SHROOM2Q13796 1616 aa28.16■■■□□ 2.1
LAMA5-210ENST00000491036 KIF27Q86VH2 1401 aa28.07■■■□□ 2.08
LAMA5-210ENST00000491036 JPH4Q96JJ6 628 aa28.06■■■□□ 2.08
LAMA5-210ENST00000491036 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
LAMA5-210ENST00000491036 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.02■■■□□ 2.08
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