RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461945.1

CARMIL1-202, Transcript of capping protein regulator and myosin 1 linker 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CARMIL1, Length 1,290 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1-202ENST00000461945 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.45■■■■■ 6.79
CARMIL1-202ENST00000461945 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.02■■■■■ 5.76
CARMIL1-202ENST00000461945 ABCC9O60706 1549 aa50.02■■■■■ 5.6
CARMIL1-202ENST00000461945 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.12■■■■■ 5.29
CARMIL1-202ENST00000461945 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.06■■■■■ 5.28
CARMIL1-202ENST00000461945 NACADO15069 1562 aa48■■■■■ 5.28
CARMIL1-202ENST00000461945 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.86■■■■■ 5.25
CARMIL1-202ENST00000461945 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.7■■■■■ 5.23
CARMIL1-202ENST00000461945 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.5■■■■■ 5.19
CARMIL1-202ENST00000461945 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.93■■■■■ 5.1
CARMIL1-202ENST00000461945 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.78■■■■■ 5.08
CARMIL1-202ENST00000461945 SCRIBQ14160 1630 aa46.63■■■■■ 5.06
CARMIL1-202ENST00000461945 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.6■■■■■ 5.05
CARMIL1-202ENST00000461945 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.08■■■■■ 4.97
CARMIL1-202ENST00000461945 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.9■■■■■ 4.94
CARMIL1-202ENST00000461945 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
CARMIL1-202ENST00000461945 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.2■■■■■ 4.83
CARMIL1-202ENST00000461945 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
CARMIL1-202ENST00000461945 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.8■■■■■ 4.76
CARMIL1-202ENST00000461945 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.73
CARMIL1-202ENST00000461945 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
CARMIL1-202ENST00000461945 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.35■■■■■ 4.69
CARMIL1-202ENST00000461945 NCAPD3P42695 1498 aa44.31■■■■■ 4.68
CARMIL1-202ENST00000461945 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.3■■■■■ 4.68
CARMIL1-202ENST00000461945 SMARCA2P51531 1590 aa44.28■■■■■ 4.68
CARMIL1-202ENST00000461945 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.1■■■■■ 4.65
CARMIL1-202ENST00000461945 HMGXB3Q12766 1538 aa44.07■■■■■ 4.65
CARMIL1-202ENST00000461945 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
CARMIL1-202ENST00000461945 WIZO95785 1651 aa43.81■■■■■ 4.6
CARMIL1-202ENST00000461945 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
CARMIL1-202ENST00000461945 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.35■■■■■ 4.53
CARMIL1-202ENST00000461945 NESP48681 1621 aa43.27■■■■■ 4.52
CARMIL1-202ENST00000461945 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.12■■■■■ 4.49
CARMIL1-202ENST00000461945 ERCC6Q03468 1493 aa43.12■■■■■ 4.49
CARMIL1-202ENST00000461945 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.04■■■■■ 4.48
CARMIL1-202ENST00000461945 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.88■■■■■ 4.45
CARMIL1-202ENST00000461945 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.86■■■■■ 4.45
CARMIL1-202ENST00000461945 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.79■■■■■ 4.44
CARMIL1-202ENST00000461945 CFTRP13569 1480 aa42.77■■■■■ 4.44
CARMIL1-202ENST00000461945 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.71■■■■■ 4.43
CARMIL1-202ENST00000461945 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.69■■■■■ 4.42
CARMIL1-202ENST00000461945 CUX2O14529 1486 aa42.61■■■■■ 4.41
CARMIL1-202ENST00000461945 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
CARMIL1-202ENST00000461945 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.55■■■■■ 4.4
CARMIL1-202ENST00000461945 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.49■■■■■ 4.39
CARMIL1-202ENST00000461945 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.43■■■■■ 4.38
CARMIL1-202ENST00000461945 PRDM2Q13029 1718 aa42.38■■■■■ 4.38
CARMIL1-202ENST00000461945 WDR62O43379 1518 aa42.26■■■■■ 4.36
CARMIL1-202ENST00000461945 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CARMIL1-202ENST00000461945 TOPBP1Q92547 1522 aa41.87■■■■■ 4.29
CARMIL1-202ENST00000461945 ABCC8Q09428 1581 aa41.84■■■■■ 4.29
CARMIL1-202ENST00000461945 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.8■■■■■ 4.28
CARMIL1-202ENST00000461945 IFT140Q96RY7 1462 aa41.6■■■■■ 4.25
CARMIL1-202ENST00000461945 CUX1P39880 1505 aa41.55■■■■■ 4.24
CARMIL1-202ENST00000461945 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
CARMIL1-202ENST00000461945 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
CARMIL1-202ENST00000461945 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.42■■■■■ 4.22
CARMIL1-202ENST00000461945 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CARMIL1-202ENST00000461945 SOGA1O94964 1423 aa41.37■■■■■ 4.21
CARMIL1-202ENST00000461945 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.36■■■■■ 4.21
CARMIL1-202ENST00000461945 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.32■■■■■ 4.21
CARMIL1-202ENST00000461945 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
CARMIL1-202ENST00000461945 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1-202ENST00000461945 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1-202ENST00000461945 SYNJ1O43426 1573 aa41.18■■■■■ 4.18
CARMIL1-202ENST00000461945 TOP2BQ02880 1626 aa41.18■■■■■ 4.18
CARMIL1-202ENST00000461945 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.16■■■■■ 4.18
CARMIL1-202ENST00000461945 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CARMIL1-202ENST00000461945 WDR97A6NE52 1622 aa41.03■■■■■ 4.16
CARMIL1-202ENST00000461945 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.01■■■■■ 4.16
CARMIL1-202ENST00000461945 OSCARQ8IYS5 282 aa40.9■■■■■ 4.14
CARMIL1-202ENST00000461945 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.88■■■■■ 4.13
CARMIL1-202ENST00000461945 GRIN2BQ13224 1484 aa40.87■■■■■ 4.13
CARMIL1-202ENST00000461945 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.83■■■■■ 4.13
CARMIL1-202ENST00000461945 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.82■■■■■ 4.13
CARMIL1-202ENST00000461945 FBLN2P98095 1184 aa40.77■■■■■ 4.12
CARMIL1-202ENST00000461945 PBRM1Q86U86 1689 aa40.75■■■■■ 4.11
CARMIL1-202ENST00000461945 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CARMIL1-202ENST00000461945 CHD1O14646 1710 aa40.7■■■■■ 4.11
CARMIL1-202ENST00000461945 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
CARMIL1-202ENST00000461945 SYNJ2O15056 1496 aa40.59■■■■■ 4.09
CARMIL1-202ENST00000461945 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.5■■■■■ 4.07
CARMIL1-202ENST00000461945 KIF27Q86VH2 1401 aa40.45■■■■■ 4.07
CARMIL1-202ENST00000461945 ADAMTS12P58397 1594 aa40.44■■■■■ 4.06
CARMIL1-202ENST00000461945 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.41■■■■■ 4.06
CARMIL1-202ENST00000461945 TRIM41Q8WV44 630 aa40.39■■■■■ 4.06
CARMIL1-202ENST00000461945 GRIN2AQ12879 1464 aa40.33■■■■■ 4.05
CARMIL1-202ENST00000461945 IGF1RP08069 1367 aa40.28■■■■■ 4.04
CARMIL1-202ENST00000461945 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.26■■■■■ 4.04
CARMIL1-202ENST00000461945 ARHGEF11O15085 1522 aa40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1-202ENST00000461945 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1-202ENST00000461945 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1-202ENST00000461945 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1-202ENST00000461945 NUP160Q12769 1436 aa40.15■■■■■ 4.02
CARMIL1-202ENST00000461945 CUL7Q14999 1698 aa40.13■■■■■ 4.01
CARMIL1-202ENST00000461945 CEP170Q5SW79 1584 aa40.13■■■■■ 4.01
CARMIL1-202ENST00000461945 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1-202ENST00000461945 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.06■■■■■ 4
CARMIL1-202ENST00000461945 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.89■■■■□ 3.98
CARMIL1-202ENST00000461945 ARAP1Q96P48 1450 aa39.88■■■■□ 3.98
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