RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476467.1

PSMB4-204, Transcript of proteasome subunit beta 4, humanhuman

TSL 2

Gene PSMB4, Length 2,067 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4-204ENST00000476467 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.13■■■□□ 2.57
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.48■■□□□ 1.99
PSMB4-204ENST00000476467 ABCC9O60706 1549 aa26.33■■□□□ 1.81
PSMB4-204ENST00000476467 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PSMB4-204ENST00000476467 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.8■■□□□ 1.72
PSMB4-204ENST00000476467 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.72■■□□□ 1.71
PSMB4-204ENST00000476467 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.71■■□□□ 1.71
PSMB4-204ENST00000476467 NACADO15069 1562 aa25.69■■□□□ 1.7
PSMB4-204ENST00000476467 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.59■■□□□ 1.69
PSMB4-204ENST00000476467 SCRIBQ14160 1630 aa25.09■■□□□ 1.61
PSMB4-204ENST00000476467 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.02■■□□□ 1.6
PSMB4-204ENST00000476467 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.89■■□□□ 1.57
PSMB4-204ENST00000476467 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.79■■□□□ 1.56
PSMB4-204ENST00000476467 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
PSMB4-204ENST00000476467 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.18■■□□□ 1.46
PSMB4-204ENST00000476467 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PSMB4-204ENST00000476467 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PSMB4-204ENST00000476467 SMARCA4P51532 1647 aa24.06■■□□□ 1.44
PSMB4-204ENST00000476467 MROH2BQ7Z745 1585 aa24■■□□□ 1.43
PSMB4-204ENST00000476467 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PSMB4-204ENST00000476467 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.86■■□□□ 1.41
PSMB4-204ENST00000476467 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.82■■□□□ 1.4
PSMB4-204ENST00000476467 SMARCA2P51531 1590 aa23.79■■□□□ 1.4
PSMB4-204ENST00000476467 WIZO95785 1651 aa23.77■■□□□ 1.4
PSMB4-204ENST00000476467 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.77■■□□□ 1.4
PSMB4-204ENST00000476467 NCAPD3P42695 1498 aa23.68■■□□□ 1.38
PSMB4-204ENST00000476467 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PSMB4-204ENST00000476467 HMGXB3Q12766 1538 aa23.64■■□□□ 1.38
PSMB4-204ENST00000476467 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.64■■□□□ 1.37
PSMB4-204ENST00000476467 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PSMB4-204ENST00000476467 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
PSMB4-204ENST00000476467 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.26■■□□□ 1.31
PSMB4-204ENST00000476467 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.01■■□□□ 1.27
PSMB4-204ENST00000476467 CFTRP13569 1480 aa23■■□□□ 1.27
PSMB4-204ENST00000476467 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.99■■□□□ 1.27
PSMB4-204ENST00000476467 NESP48681 1621 aa22.94■■□□□ 1.26
PSMB4-204ENST00000476467 PRDM2Q13029 1718 aa22.91■■□□□ 1.26
PSMB4-204ENST00000476467 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.79■■□□□ 1.24
PSMB4-204ENST00000476467 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.76■■□□□ 1.23
PSMB4-204ENST00000476467 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.71■■□□□ 1.23
PSMB4-204ENST00000476467 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.69■■□□□ 1.22
PSMB4-204ENST00000476467 ERCC6Q03468 1493 aa22.66■■□□□ 1.22
PSMB4-204ENST00000476467 ABCC8Q09428 1581 aa22.58■■□□□ 1.21
PSMB4-204ENST00000476467 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.55■■□□□ 1.2
PSMB4-204ENST00000476467 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
PSMB4-204ENST00000476467 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 CUX1P39880 1505 aa22.5■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.49■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 SYNJ1O43426 1573 aa22.47■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 WDR62O43379 1518 aa22.46■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 TOPBP1Q92547 1522 aa22.46■■□□□ 1.19
PSMB4-204ENST00000476467 TOP2BQ02880 1626 aa22.45■■□□□ 1.18
PSMB4-204ENST00000476467 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.45■■□□□ 1.18
PSMB4-204ENST00000476467 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.42■■□□□ 1.18
PSMB4-204ENST00000476467 TRIM41Q8WV44 630 aa22.34■■□□□ 1.17
PSMB4-204ENST00000476467 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.17
PSMB4-204ENST00000476467 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PSMB4-204ENST00000476467 CUX2O14529 1486 aa22.24■■□□□ 1.15
PSMB4-204ENST00000476467 SOGA1O94964 1423 aa22.2■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 IFT140Q96RY7 1462 aa22.19■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.19■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 WDR97A6NE52 1622 aa22.15■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.14
PSMB4-204ENST00000476467 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.03■■□□□ 1.12
PSMB4-204ENST00000476467 KIF27Q86VH2 1401 aa22.02■■□□□ 1.12
PSMB4-204ENST00000476467 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PSMB4-204ENST00000476467 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PSMB4-204ENST00000476467 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PSMB4-204ENST00000476467 EEA1Q15075 1411 aa21.97■■□□□ 1.11
PSMB4-204ENST00000476467 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.97■■□□□ 1.11
PSMB4-204ENST00000476467 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.97■■□□□ 1.11
PSMB4-204ENST00000476467 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.114e-8■■■■■ 62.9
PSMB4-204ENST00000476467 PBRM1Q86U86 1689 aa21.92■■□□□ 1.1
PSMB4-204ENST00000476467 GRIN2BQ13224 1484 aa21.9■■□□□ 1.1
PSMB4-204ENST00000476467 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.9■■□□□ 1.1
PSMB4-204ENST00000476467 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PSMB4-204ENST00000476467 IGF1RP08069 1367 aa21.85■■□□□ 1.09
PSMB4-204ENST00000476467 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.82■■□□□ 1.08
PSMB4-204ENST00000476467 CUL7Q14999 1698 aa21.81■■□□□ 1.08
PSMB4-204ENST00000476467 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.8■■□□□ 1.08
PSMB4-204ENST00000476467 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PSMB4-204ENST00000476467 ADAMTS12P58397 1594 aa21.78■■□□□ 1.08
PSMB4-204ENST00000476467 PRXQ9BXM0 1461 aa21.74■■□□□ 1.07
PSMB4-204ENST00000476467 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.74■■□□□ 1.07
PSMB4-204ENST00000476467 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.74■■□□□ 1.07
PSMB4-204ENST00000476467 KIF21BO75037 1637 aa21.72■■□□□ 1.07
PSMB4-204ENST00000476467 SYNJ2O15056 1496 aa21.69■■□□□ 1.06
PSMB4-204ENST00000476467 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.69■■□□□ 1.06
PSMB4-204ENST00000476467 GOLGA3Q08378 1498 aa21.62■■□□□ 1.05
PSMB4-204ENST00000476467 GRIN2AQ12879 1464 aa21.62■■□□□ 1.05
PSMB4-204ENST00000476467 CHD1O14646 1710 aa21.62■■□□□ 1.05
PSMB4-204ENST00000476467 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
PSMB4-204ENST00000476467 FBLN2P98095 1184 aa21.57■■□□□ 1.04
PSMB4-204ENST00000476467 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.51■■□□□ 1.03
PSMB4-204ENST00000476467 NUP160Q12769 1436 aa21.5■■□□□ 1.03
PSMB4-204ENST00000476467 CEP170Q5SW79 1584 aa21.5■■□□□ 1.03
PSMB4-204ENST00000476467 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.48■■□□□ 1.03
PSMB4-204ENST00000476467 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.47■■□□□ 1.03
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