Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DDR1-243ENST00000482050 246 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-270ENST00000513043 604 ntTSL 416.5■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-257ENST00000505534 673 ntTSL 416.05■□□□□ 0.162e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-263ENST00000508317 538 ntTSL 415.74■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-256ENST00000505066 556 ntTSL 415.74■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-229ENST00000396342 675 ntTSL 315.74■□□□□ 0.112e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-230ENST00000412274 496 ntTSL 215.51■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-261ENST00000507901 562 ntTSL 415.5■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-268ENST00000512694 623 ntTSL 415.23■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-248ENST00000503180 527 ntTSL 415.07■□□□□ 02e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-250ENST00000503628 570 ntTSL 414.91□□□□□ -0.022e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-278ENST00000515233 580 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-237ENST00000437124 587 ntTSL 414.29□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-253ENST00000504651 571 ntTSL 313.45□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-247ENST00000502955 574 ntTSL 413.06□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-227ENST00000376570 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-240ENST00000454612 3942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.312e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 SLC12A7-205ENST00000514994 586 ntTSL 316.67■□□□□ 0.264e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-8■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ACAP3-212ENST00000492936 5319 ntTSL 1 (best)18.28■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 MLLT10-215ENST00000495130 744 ntTSL 311.81□□□□□ -0.529e-7■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 TBKBP1-203ENST00000578982 733 ntTSL 318.12■□□□□ 0.497e-7■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-223ENST00000617585 737 ntTSL 221.28■■□□□ 12e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 518.85■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-210ENST00000594521 826 ntTSL 516.39■□□□□ 0.212e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 TNRC18-206ENST00000434361 577 ntTSL 315.28■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 GNAZ-202ENST00000492538 652 ntTSL 420.71■□□□□ 0.912e-10■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.522e-10■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 YWHAE-209ENST00000572108 258 ntTSL 39.16□□□□□ -0.949e-8■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.483e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.285e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.245e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.275e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 CPSF7-203ENST00000413184 571 ntTSL 46.95□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.831e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-203ENST00000393400 1831 ntTSL 1 (best)28.45■■■□□ 2.141e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.031e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.021e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.991e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.971e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.961e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-208ENST00000483868 1720 ntTSL 526.79■■□□□ 1.881e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.721e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.621e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.531e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.51e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-209ENST00000567283 835 ntTSL 323.38■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 UBTF-214ENST00000537550 1085 ntTSL 222.71■■□□□ 1.231e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-210ENST00000569601 917 ntTSL 322.29■■□□□ 1.161e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 ABHD12-204ENST00000461204 712 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 NDUFB1-205ENST00000556555 568 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-207ENST00000557810 947 ntTSL 220.69■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.865e-7■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-208ENST00000498067 481 ntTSL 220.38■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-206ENST00000565503 561 ntTSL 320.31■□□□□ 0.841e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-206ENST00000465915 569 ntTSL 319.25■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 RPUSD1-205ENST00000565377 940 ntTSL 219.2■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.631e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-234ENST00000561001 545 ntTSL 418.36■□□□□ 0.531e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-202ENST00000462646 335 ntTSL 317.9■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-211ENST00000494437 976 ntTSL 317.66■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 517.65■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-238ENST00000561375 748 ntTSL 317.14■□□□□ 0.331e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-NBL1-202ENST00000602384 999 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 316.98■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 UBE2Q1-207ENST00000497453 830 ntTSL 516.96■□□□□ 0.315e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-237ENST00000561056 577 ntTSL 416.95■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-NBL1-203ENST00000602450 590 ntTSL 216.7■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-215ENST00000558914 2342 ntTSL 216.66■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PTPRF-206ENST00000429895 6312 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.221e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-216ENST00000559017 849 ntTSL 516.37■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-233ENST00000560901 603 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 PRKAR1B-207ENST00000430040 1006 ntTSL 316.25■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 MINOS1-204ENST00000479642 576 ntTSL 315.7■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.4
PRPF4O43172 DCAF11-226ENST00000559796 476 ntTSL 415.66■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.4
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 302.8 ms