RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, human

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPRA1-208	ENST00000483868	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		65.41	■■■■■ 8.06
TPRA1-208	ENST00000483868	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		57.58	■■■■■ 6.81
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC9	O60706	1549 aa		55.66	■■■■■ 6.5
TPRA1-208	ENST00000483868	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	54.68	■■■■■ 6.34
TPRA1-208	ENST00000483868	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		54.43	■■■■■ 6.3
TPRA1-208	ENST00000483868	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		54.05	■■■■■ 6.24
TPRA1-208	ENST00000483868	NACAD	O15069	1562 aa		53.95	■■■■■ 6.23
TPRA1-208	ENST00000483868	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		53.88	■■■■■ 6.22
TPRA1-208	ENST00000483868	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		53.78	■■■■■ 6.2
TPRA1-208	ENST00000483868	SCRIB	Q14160	1630 aa		52.82	■■■■■ 6.05
TPRA1-208	ENST00000483868	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		52.7	■■■■■ 6.03
TPRA1-208	ENST00000483868	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		52.49	■■■■■ 5.99
TPRA1-208	ENST00000483868	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	52.26	■■■■■ 5.96
TPRA1-208	ENST00000483868	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		52.25	■■■■■ 5.96
TPRA1-208	ENST00000483868	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		50.98	■■■■■ 5.75
TPRA1-208	ENST00000483868	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	50.75	■■■■■ 5.72
TPRA1-208	ENST00000483868	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	50.57	■■■■■ 5.69
TPRA1-208	ENST00000483868	SMARCA4	P51532	1647 aa		50.54	■■■■■ 5.68
TPRA1-208	ENST00000483868	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		50.51	■■■■■ 5.68
TPRA1-208	ENST00000483868	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		50.35	■■■■■ 5.65
TPRA1-208	ENST00000483868	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		50.33	■■■■■ 5.65
TPRA1-208	ENST00000483868	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	50.27	■■■■■ 5.64
TPRA1-208	ENST00000483868	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		50.05	■■■■■ 5.6
TPRA1-208	ENST00000483868	WIZ	O95785	1651 aa		50.02	■■■■■ 5.6
TPRA1-208	ENST00000483868	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		49.97	■■■■■ 5.59
TPRA1-208	ENST00000483868	SMARCA2	P51531	1590 aa		49.94	■■■■■ 5.58
TPRA1-208	ENST00000483868	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	49.84	■■■■■ 5.57
TPRA1-208	ENST00000483868	NCAPD3	P42695	1498 aa		49.82	■■■■■ 5.57
TPRA1-208	ENST00000483868	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	49.66	■■■■■ 5.54
TPRA1-208	ENST00000483868	HMGXB3	Q12766	1538 aa		49.62	■■■■■ 5.53
TPRA1-208	ENST00000483868	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	49.44	■■■■■ 5.5
TPRA1-208	ENST00000483868	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		48.95	■■■■■ 5.43
TPRA1-208	ENST00000483868	NES	P48681	1621 aa		48.49	■■■■■ 5.35
TPRA1-208	ENST00000483868	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		48.46	■■■■■ 5.35
TPRA1-208	ENST00000483868	CFTR	P13569	1480 aa		48.37	■■■■■ 5.33
TPRA1-208	ENST00000483868	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		48.31	■■■■■ 5.32
TPRA1-208	ENST00000483868	PRDM2	Q13029	1718 aa		47.98	■■■■■ 5.27
TPRA1-208	ENST00000483868	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		47.97	■■■■■ 5.27
TPRA1-208	ENST00000483868	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		47.92	■■■■■ 5.26
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		47.86	■■■■■ 5.25
TPRA1-208	ENST00000483868	ERCC6	Q03468	1493 aa		47.8	■■■■■ 5.24
TPRA1-208	ENST00000483868	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		47.72	■■■■■ 5.23
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCC8	Q09428	1581 aa		47.51	■■■■■ 5.2
TPRA1-208	ENST00000483868	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		47.45	■■■■■ 5.19
TPRA1-208	ENST00000483868	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	47.42	■■■■■ 5.18
TPRA1-208	ENST00000483868	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	47.42	■■■■■ 5.18
TPRA1-208	ENST00000483868	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	47.32	■■■■■ 5.17
TPRA1-208	ENST00000483868	CUX1	P39880	1505 aa		47.31	■■■■■ 5.16
TPRA1-208	ENST00000483868	TOPBP1	Q92547	1522 aa		47.26	■■■■■ 5.16
TPRA1-208	ENST00000483868	WDR62	O43379	1518 aa		47.26	■■■■■ 5.16
TPRA1-208	ENST00000483868	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		47.23	■■■■■ 5.15
TPRA1-208	ENST00000483868	SYNJ1	O43426	1573 aa		47.21	■■■■■ 5.15
TPRA1-208	ENST00000483868	TOP2B	Q02880	1626 aa		47.08	■■■■■ 5.13
TPRA1-208	ENST00000483868	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		47.05	■■■■■ 5.12
TPRA1-208	ENST00000483868	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		47.05	■■■■■ 5.12
TPRA1-208	ENST00000483868	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		46.97	■■■■■ 5.11
TPRA1-208	ENST00000483868	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	46.95	■■■■■ 5.11
TPRA1-208	ENST00000483868	TRIM41	Q8WV44	630 aa		46.92	■■■■■ 5.1
TPRA1-208	ENST00000483868	CUX2	O14529	1486 aa		46.88	■■■■■ 5.1
TPRA1-208	ENST00000483868	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		46.81	■■■■■ 5.08
TPRA1-208	ENST00000483868	SOGA1	O94964	1423 aa		46.76	■■■■■ 5.08
TPRA1-208	ENST00000483868	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	46.67	■■■■■ 5.06
TPRA1-208	ENST00000483868	IFT140	Q96RY7	1462 aa		46.66	■■■■■ 5.06
TPRA1-208	ENST00000483868	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	46.53	■■■■■ 5.04
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		46.51	■■■■■ 5.04
TPRA1-208	ENST00000483868	WDR97	A6NE52	1622 aa		46.48	■■■■■ 5.03
TPRA1-208	ENST00000483868	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	46.45	■■■■■ 5.03
TPRA1-208	ENST00000483868	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	46.38	■■■■■ 5.02	8e-7	■■■■□ 23.8
TPRA1-208	ENST00000483868	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		46.29	■■■■■ 5
TPRA1-208	ENST00000483868	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	46.29	■■■■■ 5
TPRA1-208	ENST00000483868	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		46.25	■■■■■ 4.99
TPRA1-208	ENST00000483868	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		46.22	■■■■■ 4.99
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF27	Q86VH2	1401 aa		46.21	■■■■■ 4.99
TPRA1-208	ENST00000483868	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	46.07	■■■■■ 4.97
TPRA1-208	ENST00000483868	GRIN2B	Q13224	1484 aa		46.04	■■■■■ 4.96
TPRA1-208	ENST00000483868	PBRM1	Q86U86	1689 aa		46.03	■■■■■ 4.96
TPRA1-208	ENST00000483868	IGF1R	P08069	1367 aa		46	■■■■■ 4.95
TPRA1-208	ENST00000483868	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		45.93	■■■■■ 4.94
TPRA1-208	ENST00000483868	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		45.91	■■■■■ 4.94
TPRA1-208	ENST00000483868	EEA1	Q15075	1411 aa		45.89	■■■■■ 4.94
TPRA1-208	ENST00000483868	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		45.84	■■■■■ 4.93
TPRA1-208	ENST00000483868	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	45.79	■■■■■ 4.92
TPRA1-208	ENST00000483868	ADAMTS12	P58397	1594 aa		45.73	■■■■■ 4.91
TPRA1-208	ENST00000483868	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		45.71	■■■■■ 4.91
TPRA1-208	ENST00000483868	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		45.68	■■■■■ 4.9
TPRA1-208	ENST00000483868	CUL7	Q14999	1698 aa		45.67	■■■■■ 4.9
TPRA1-208	ENST00000483868	FBLN2	P98095	1184 aa		45.64	■■■■■ 4.9
TPRA1-208	ENST00000483868	SYNJ2	O15056	1496 aa		45.63	■■■■■ 4.9
TPRA1-208	ENST00000483868	PRX	Q9BXM0	1461 aa		45.62	■■■■■ 4.89
TPRA1-208	ENST00000483868	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	45.6	■■■■■ 4.89
TPRA1-208	ENST00000483868	CHD1	O14646	1710 aa		45.52	■■■■■ 4.88
TPRA1-208	ENST00000483868	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		45.51	■■■■■ 4.88
TPRA1-208	ENST00000483868	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		45.49	■■■■■ 4.87
TPRA1-208	ENST00000483868	GRIN2A	Q12879	1464 aa		45.48	■■■■■ 4.87
TPRA1-208	ENST00000483868	KIF21B	O75037	1637 aa		45.41	■■■■■ 4.86
TPRA1-208	ENST00000483868	CEP170	Q5SW79	1584 aa		45.26	■■■■■ 4.84
TPRA1-208	ENST00000483868	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		45.23	■■■■■ 4.83
TPRA1-208	ENST00000483868	GOLGA3	Q08378	1498 aa		45.23	■■■■■ 4.83
TPRA1-208	ENST00000483868	NUP160	Q12769	1436 aa		45.23	■■■■■ 4.83
TPRA1-208	ENST00000483868	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		45.2	■■■■■ 4.83

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