RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483868.5

TPRA1-208, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene TPRA1, Length 1,720 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-208ENST00000483868 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.41■■■■■ 8.06
TPRA1-208ENST00000483868 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.58■■■■■ 6.81
TPRA1-208ENST00000483868 ABCC9O60706 1549 aa55.66■■■■■ 6.5
TPRA1-208ENST00000483868 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.68■■■■■ 6.34
TPRA1-208ENST00000483868 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.43■■■■■ 6.3
TPRA1-208ENST00000483868 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.05■■■■■ 6.24
TPRA1-208ENST00000483868 NACADO15069 1562 aa53.95■■■■■ 6.23
TPRA1-208ENST00000483868 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.88■■■■■ 6.22
TPRA1-208ENST00000483868 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.78■■■■■ 6.2
TPRA1-208ENST00000483868 SCRIBQ14160 1630 aa52.82■■■■■ 6.05
TPRA1-208ENST00000483868 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.7■■■■■ 6.03
TPRA1-208ENST00000483868 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.49■■■■■ 5.99
TPRA1-208ENST00000483868 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.26■■■■■ 5.96
TPRA1-208ENST00000483868 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.25■■■■■ 5.96
TPRA1-208ENST00000483868 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.98■■■■■ 5.75
TPRA1-208ENST00000483868 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.75■■■■■ 5.72
TPRA1-208ENST00000483868 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.57■■■■■ 5.69
TPRA1-208ENST00000483868 SMARCA4P51532 1647 aa50.54■■■■■ 5.68
TPRA1-208ENST00000483868 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.51■■■■■ 5.68
TPRA1-208ENST00000483868 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.35■■■■■ 5.65
TPRA1-208ENST00000483868 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.33■■■■■ 5.65
TPRA1-208ENST00000483868 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.27■■■■■ 5.64
TPRA1-208ENST00000483868 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.05■■■■■ 5.6
TPRA1-208ENST00000483868 WIZO95785 1651 aa50.02■■■■■ 5.6
TPRA1-208ENST00000483868 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.97■■■■■ 5.59
TPRA1-208ENST00000483868 SMARCA2P51531 1590 aa49.94■■■■■ 5.58
TPRA1-208ENST00000483868 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.84■■■■■ 5.57
TPRA1-208ENST00000483868 NCAPD3P42695 1498 aa49.82■■■■■ 5.57
TPRA1-208ENST00000483868 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
TPRA1-208ENST00000483868 HMGXB3Q12766 1538 aa49.62■■■■■ 5.53
TPRA1-208ENST00000483868 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
TPRA1-208ENST00000483868 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.95■■■■■ 5.43
TPRA1-208ENST00000483868 NESP48681 1621 aa48.49■■■■■ 5.35
TPRA1-208ENST00000483868 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.46■■■■■ 5.35
TPRA1-208ENST00000483868 CFTRP13569 1480 aa48.37■■■■■ 5.33
TPRA1-208ENST00000483868 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.31■■■■■ 5.32
TPRA1-208ENST00000483868 PRDM2Q13029 1718 aa47.98■■■■■ 5.27
TPRA1-208ENST00000483868 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.97■■■■■ 5.27
TPRA1-208ENST00000483868 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.92■■■■■ 5.26
TPRA1-208ENST00000483868 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.86■■■■■ 5.25
TPRA1-208ENST00000483868 ERCC6Q03468 1493 aa47.8■■■■■ 5.24
TPRA1-208ENST00000483868 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.72■■■■■ 5.23
TPRA1-208ENST00000483868 ABCC8Q09428 1581 aa47.51■■■■■ 5.2
TPRA1-208ENST00000483868 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.45■■■■■ 5.19
TPRA1-208ENST00000483868 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
TPRA1-208ENST00000483868 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
TPRA1-208ENST00000483868 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.32■■■■■ 5.17
TPRA1-208ENST00000483868 CUX1P39880 1505 aa47.31■■■■■ 5.16
TPRA1-208ENST00000483868 TOPBP1Q92547 1522 aa47.26■■■■■ 5.16
TPRA1-208ENST00000483868 WDR62O43379 1518 aa47.26■■■■■ 5.16
TPRA1-208ENST00000483868 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.23■■■■■ 5.15
TPRA1-208ENST00000483868 SYNJ1O43426 1573 aa47.21■■■■■ 5.15
TPRA1-208ENST00000483868 TOP2BQ02880 1626 aa47.08■■■■■ 5.13
TPRA1-208ENST00000483868 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.05■■■■■ 5.12
TPRA1-208ENST00000483868 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.05■■■■■ 5.12
TPRA1-208ENST00000483868 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.97■■■■■ 5.11
TPRA1-208ENST00000483868 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.95■■■■■ 5.11
TPRA1-208ENST00000483868 TRIM41Q8WV44 630 aa46.92■■■■■ 5.1
TPRA1-208ENST00000483868 CUX2O14529 1486 aa46.88■■■■■ 5.1
TPRA1-208ENST00000483868 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.81■■■■■ 5.08
TPRA1-208ENST00000483868 SOGA1O94964 1423 aa46.76■■■■■ 5.08
TPRA1-208ENST00000483868 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.67■■■■■ 5.06
TPRA1-208ENST00000483868 IFT140Q96RY7 1462 aa46.66■■■■■ 5.06
TPRA1-208ENST00000483868 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.53■■■■■ 5.04
TPRA1-208ENST00000483868 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.51■■■■■ 5.04
TPRA1-208ENST00000483868 WDR97A6NE52 1622 aa46.48■■■■■ 5.03
TPRA1-208ENST00000483868 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.45■■■■■ 5.03
TPRA1-208ENST00000483868 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.38■■■■■ 5.028e-7■■■■□ 23.8
TPRA1-208ENST00000483868 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.29■■■■■ 5
TPRA1-208ENST00000483868 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.29■■■■■ 5
TPRA1-208ENST00000483868 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.25■■■■■ 4.99
TPRA1-208ENST00000483868 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.22■■■■■ 4.99
TPRA1-208ENST00000483868 KIF27Q86VH2 1401 aa46.21■■■■■ 4.99
TPRA1-208ENST00000483868 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
TPRA1-208ENST00000483868 GRIN2BQ13224 1484 aa46.04■■■■■ 4.96
TPRA1-208ENST00000483868 PBRM1Q86U86 1689 aa46.03■■■■■ 4.96
TPRA1-208ENST00000483868 IGF1RP08069 1367 aa46■■■■■ 4.95
TPRA1-208ENST00000483868 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.93■■■■■ 4.94
TPRA1-208ENST00000483868 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.91■■■■■ 4.94
TPRA1-208ENST00000483868 EEA1Q15075 1411 aa45.89■■■■■ 4.94
TPRA1-208ENST00000483868 CSRNP3Q8WYN3 585 aa45.84■■■■■ 4.93
TPRA1-208ENST00000483868 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
TPRA1-208ENST00000483868 ADAMTS12P58397 1594 aa45.73■■■■■ 4.91
TPRA1-208ENST00000483868 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.71■■■■■ 4.91
TPRA1-208ENST00000483868 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.68■■■■■ 4.9
TPRA1-208ENST00000483868 CUL7Q14999 1698 aa45.67■■■■■ 4.9
TPRA1-208ENST00000483868 FBLN2P98095 1184 aa45.64■■■■■ 4.9
TPRA1-208ENST00000483868 SYNJ2O15056 1496 aa45.63■■■■■ 4.9
TPRA1-208ENST00000483868 PRXQ9BXM0 1461 aa45.62■■■■■ 4.89
TPRA1-208ENST00000483868 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
TPRA1-208ENST00000483868 CHD1O14646 1710 aa45.52■■■■■ 4.88
TPRA1-208ENST00000483868 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.51■■■■■ 4.88
TPRA1-208ENST00000483868 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.49■■■■■ 4.87
TPRA1-208ENST00000483868 GRIN2AQ12879 1464 aa45.48■■■■■ 4.87
TPRA1-208ENST00000483868 KIF21BO75037 1637 aa45.41■■■■■ 4.86
TPRA1-208ENST00000483868 CEP170Q5SW79 1584 aa45.26■■■■■ 4.84
TPRA1-208ENST00000483868 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.23■■■■■ 4.83
TPRA1-208ENST00000483868 GOLGA3Q08378 1498 aa45.23■■■■■ 4.83
TPRA1-208ENST00000483868 NUP160Q12769 1436 aa45.23■■■■■ 4.83
TPRA1-208ENST00000483868 OSCARQ8IYS5 282 aa45.2■■■■■ 4.83
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