RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.36■■■■■ 4.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.49■■■■□ 3.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC9O60706 1549 aa37.74■■■■□ 3.63
UBE2Q1-207ENST00000497453 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.26■■■■□ 3.4
UBE2Q1-207ENST00000497453 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.26■■■■□ 3.39
UBE2Q1-207ENST00000497453 NACADO15069 1562 aa36.22■■■■□ 3.39
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.01■■■■□ 3.36
UBE2Q1-207ENST00000497453 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.87■■■■□ 3.33
UBE2Q1-207ENST00000497453 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.38■■■■□ 3.25
UBE2Q1-207ENST00000497453 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
UBE2Q1-207ENST00000497453 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.17■■■■□ 3.22
UBE2Q1-207ENST00000497453 SCRIBQ14160 1630 aa35.17■■■■□ 3.22
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.79■■■■□ 3.16
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.67■■■■□ 3.14
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
UBE2Q1-207ENST00000497453 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.1■■■■□ 3.05
UBE2Q1-207ENST00000497453 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.9■■■■□ 3.02
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMARCA4P51532 1647 aa33.62■■■□□ 2.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.6■■■□□ 2.97
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.47■■■□□ 2.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 NCAPD3P42695 1498 aa33.45■■■□□ 2.95
UBE2Q1-207ENST00000497453 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.43■■■□□ 2.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 SMARCA2P51531 1590 aa33.4■■■□□ 2.94
UBE2Q1-207ENST00000497453 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.3■■■□□ 2.92
UBE2Q1-207ENST00000497453 HMGXB3Q12766 1538 aa33.26■■■□□ 2.91
UBE2Q1-207ENST00000497453 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
UBE2Q1-207ENST00000497453 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 WIZO95785 1651 aa33.04■■■□□ 2.88
UBE2Q1-207ENST00000497453 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
UBE2Q1-207ENST00000497453 NESP48681 1621 aa32.66■■■□□ 2.82
UBE2Q1-207ENST00000497453 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.53■■■□□ 2.8
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERCC6Q03468 1493 aa32.51■■■□□ 2.79
UBE2Q1-207ENST00000497453 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.49■■■□□ 2.79
UBE2Q1-207ENST00000497453 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.34■■■□□ 2.77
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.34■■■□□ 2.77
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFTRP13569 1480 aa32.29■■■□□ 2.76
UBE2Q1-207ENST00000497453 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.21■■■□□ 2.75
UBE2Q1-207ENST00000497453 CUX2O14529 1486 aa32.16■■■□□ 2.74
UBE2Q1-207ENST00000497453 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.13■■■□□ 2.73
UBE2Q1-207ENST00000497453 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.1■■■□□ 2.73
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.05■■■□□ 2.72
UBE2Q1-207ENST00000497453 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.02■■■□□ 2.72
UBE2Q1-207ENST00000497453 PRDM2Q13029 1718 aa31.94■■■□□ 2.7
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR62O43379 1518 aa31.9■■■□□ 2.7
UBE2Q1-207ENST00000497453 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
UBE2Q1-207ENST00000497453 TOPBP1Q92547 1522 aa31.59■■■□□ 2.65
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC8Q09428 1581 aa31.56■■■□□ 2.64
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.54■■■□□ 2.64
UBE2Q1-207ENST00000497453 IFT140Q96RY7 1462 aa31.4■■■□□ 2.62
UBE2Q1-207ENST00000497453 CUX1P39880 1505 aa31.35■■■□□ 2.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
UBE2Q1-207ENST00000497453 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
UBE2Q1-207ENST00000497453 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.25■■■□□ 2.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 SOGA1O94964 1423 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.21■■■□□ 2.59
UBE2Q1-207ENST00000497453 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.16■■■□□ 2.58
UBE2Q1-207ENST00000497453 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
UBE2Q1-207ENST00000497453 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.572e-7■■■■□ 25.1
UBE2Q1-207ENST00000497453 TOP2BQ02880 1626 aa31.07■■■□□ 2.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYNJ1O43426 1573 aa31.07■■■□□ 2.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.05■■■□□ 2.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
UBE2Q1-207ENST00000497453 WDR97A6NE52 1622 aa30.96■■■□□ 2.55
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.94■■■□□ 2.54
UBE2Q1-207ENST00000497453 OSCARQ8IYS5 282 aa30.86■■■□□ 2.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRIN2BQ13224 1484 aa30.83■■■□□ 2.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.83■■■□□ 2.53
UBE2Q1-207ENST00000497453 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.8■■■□□ 2.52
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.8■■■□□ 2.52
UBE2Q1-207ENST00000497453 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 FBLN2P98095 1184 aa30.73■■■□□ 2.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 PBRM1Q86U86 1689 aa30.71■■■□□ 2.51
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHD1O14646 1710 aa30.68■■■□□ 2.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
UBE2Q1-207ENST00000497453 SYNJ2O15056 1496 aa30.63■■■□□ 2.49
UBE2Q1-207ENST00000497453 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.57■■■□□ 2.48
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADAMTS12P58397 1594 aa30.51■■■□□ 2.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF27Q86VH2 1401 aa30.5■■■□□ 2.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.48■■■□□ 2.47
UBE2Q1-207ENST00000497453 TRIM41Q8WV44 630 aa30.44■■■□□ 2.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 GRIN2AQ12879 1464 aa30.43■■■□□ 2.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 IGF1RP08069 1367 aa30.41■■■□□ 2.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.4■■■□□ 2.46
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGEF11O15085 1522 aa30.34■■■□□ 2.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.33■■■□□ 2.45
UBE2Q1-207ENST00000497453 NUP160Q12769 1436 aa30.3■■■□□ 2.44
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP170Q5SW79 1584 aa30.28■■■□□ 2.44
UBE2Q1-207ENST00000497453 CUL7Q14999 1698 aa30.26■■■□□ 2.43
UBE2Q1-207ENST00000497453 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.26■■■□□ 2.43
UBE2Q1-207ENST00000497453 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.21■■■□□ 2.43
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARAP1Q96P48 1450 aa30.11■■■□□ 2.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.1■■■□□ 2.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.08■■■□□ 2.41
UBE2Q1-207ENST00000497453 SHROOM2Q13796 1616 aa30.04■■■□□ 2.4
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