RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409483.5

PTPRN2-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,711 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-205ENST00000409483 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRN2-205ENST00000409483 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPRN2-205ENST00000409483 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PTPRN2-205ENST00000409483 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRN2-205ENST00000409483 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PTPRN2-205ENST00000409483 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRN2-205ENST00000409483 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PTPRN2-205ENST00000409483 TRIM41Q8WV44 630 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRN2-205ENST00000409483 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRN2-205ENST00000409483 APLP2Q06481 763 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRN2-205ENST00000409483 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRN2-205ENST00000409483 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2-205ENST00000409483 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRN2-205ENST00000409483 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
PTPRN2-205ENST00000409483 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PTPRN2-205ENST00000409483 HRCP23327 699 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRN2-205ENST00000409483 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2-205ENST00000409483 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRN2-205ENST00000409483 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2-205ENST00000409483 ABCC9O60706 1549 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRN2-205ENST00000409483 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.58
PTPRN2-205ENST00000409483 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
PTPRN2-205ENST00000409483 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
PTPRN2-205ENST00000409483 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
PTPRN2-205ENST00000409483 ITGAEP38570 1179 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2-205ENST00000409483 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
PTPRN2-205ENST00000409483 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PTPRN2-205ENST00000409483 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRN2-205ENST00000409483 SCRIBQ14160 1630 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRN2-205ENST00000409483 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRN2-205ENST00000409483 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.15■■□□□ 1.46
PTPRN2-205ENST00000409483 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PTPRN2-205ENST00000409483 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.06■■□□□ 1.44
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2-205ENST00000409483 NEFLP07196 543 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2-205ENST00000409483 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2-205ENST00000409483 P3H3Q8IVL6 736 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2-205ENST00000409483 NEUROD1Q13562 356 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRN2-205ENST00000409483 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.83■■□□□ 1.4
PTPRN2-205ENST00000409483 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
PTPRN2-205ENST00000409483 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN2-205ENST00000409483 ARID3CA6NKF2 412 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN2-205ENST00000409483 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.72■■□□□ 1.39
PTPRN2-205ENST00000409483 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-205ENST00000409483 TRIM52Q96A61 297 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN2-205ENST00000409483 FBLN2P98095 1184 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRN2-205ENST00000409483 BCANQ96GW7 911 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRN2-205ENST00000409483 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.49■■□□□ 1.35
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PTPRN2-205ENST00000409483 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRN2-205ENST00000409483 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-205ENST00000409483 ANP32CO43423 234 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-205ENST00000409483 CEP162Q5TB80 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
PTPRN2-205ENST00000409483 CLIP1P30622 1438 aa23.26■■□□□ 1.31
PTPRN2-205ENST00000409483 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
PTPRN2-205ENST00000409483 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRN2-205ENST00000409483 NACADO15069 1562 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRN2-205ENST00000409483 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2-205ENST00000409483 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.17■■□□□ 1.3
PTPRN2-205ENST00000409483 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2-205ENST00000409483 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PTPRN2-205ENST00000409483 MIER1Q8N108 512 aa23.14■■□□□ 1.29
PTPRN2-205ENST00000409483 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2-205ENST00000409483 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
PTPRN2-205ENST00000409483 SOGA1O94964 1423 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2-205ENST00000409483 GOLGA3Q08378 1498 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRN2-205ENST00000409483 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PTPRN2-205ENST00000409483 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.01■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 TONSLQ96HA7 1378 aa23■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 MYT1Q01538 1121 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 EEA1Q15075 1411 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 ABCC8Q09428 1581 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRN2-205ENST00000409483 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRN2-205ENST00000409483 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRN2-205ENST00000409483 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN2-205ENST00000409483 FKBP8Q14318 412 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRN2-205ENST00000409483 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTPRN2-205ENST00000409483 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRN2-205ENST00000409483 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2-205ENST00000409483 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.84■■□□□ 1.25
PTPRN2-205ENST00000409483 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.83■■□□□ 1.24
PTPRN2-205ENST00000409483 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2-205ENST00000409483 WIZO95785 1651 aa22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2-205ENST00000409483 KIF27Q86VH2 1401 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRN2-205ENST00000409483 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2-205ENST00000409483 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2-205ENST00000409483 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.234e-7■■■□□ 15.2
PTPRN2-205ENST00000409483 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2-205ENST00000409483 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
PTPRN2-205ENST00000409483 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2-205ENST00000409483 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2-205ENST00000409483 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2-205ENST00000409483 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN2-205ENST00000409483 BCL11AQ9H165 835 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2-205ENST00000409483 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PTPRN2-205ENST00000409483 CUX2O14529 1486 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms