RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329286.6

RAB12-201, Transcript of RAB12, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB12, Length 2,137 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12-201ENST00000329286 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.46■■■■■ 8.07
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RAB12-201ENST00000329286 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.16■■■■■ 6.42
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RAB12-201ENST00000329286 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.95■■■■■ 6.23
RAB12-201ENST00000329286 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.68■■■■■ 6.18
RAB12-201ENST00000329286 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.63■■■■■ 6.02
RAB12-201ENST00000329286 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.5■■■■■ 6
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RAB12-201ENST00000329286 SCRIBQ14160 1630 aa52.08■■■■■ 5.93
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RAB12-201ENST00000329286 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.16■■■■■ 5.78
RAB12-201ENST00000329286 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.89■■■■■ 5.74
RAB12-201ENST00000329286 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa50.84■■■■■ 5.73
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RAB12-201ENST00000329286 HRCP23327 699 aa50.68■■■■■ 5.7
RAB12-201ENST00000329286 PCGF6Q9BYE7 350 aa50.6■■■■■ 5.69
RAB12-201ENST00000329286 WIZO95785 1651 aa50.5■■■■■ 5.68
RAB12-201ENST00000329286 TRIM41Q8WV44 630 aa50.45■■■■■ 5.67
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RAB12-201ENST00000329286 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.09■■■■■ 5.61
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RAB12-201ENST00000329286 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP49.9■■■■■ 5.58
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RAB12-201ENST00000329286 SMARCA2P51531 1590 aa49.53■■■■■ 5.52
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RAB12-201ENST00000329286 EHMT2Q96KQ7 1210 aa49.18■■■■■ 5.46
RAB12-201ENST00000329286 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.13■■■■■ 5.45
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RAB12-201ENST00000329286 EEA1Q15075 1411 aa48.69■■■■■ 5.38
RAB12-201ENST00000329286 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.61■■■■■ 5.37
RAB12-201ENST00000329286 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.51■■■■■ 5.36
RAB12-201ENST00000329286 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.46■■■■■ 5.35
RAB12-201ENST00000329286 CEP162Q5TB80 1403 aa48.46■■■■■ 5.35
RAB12-201ENST00000329286 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.45■■■■■ 5.35
RAB12-201ENST00000329286 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.44■■■■■ 5.34
RAB12-201ENST00000329286 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.39■■■■■ 5.34
RAB12-201ENST00000329286 SYNJ1O43426 1573 aa48.31■■■■■ 5.32
RAB12-201ENST00000329286 GOLGA3Q08378 1498 aa48.24■■■■■ 5.31
RAB12-201ENST00000329286 KIF21BO75037 1637 aa48.06■■■■■ 5.28
RAB12-201ENST00000329286 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.02■■■■■ 5.28
RAB12-201ENST00000329286 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.01■■■■■ 5.28
RAB12-201ENST00000329286 HMGXB3Q12766 1538 aa47.85■■■■■ 5.25
RAB12-201ENST00000329286 TOP2BQ02880 1626 aa47.84■■■■■ 5.25
RAB12-201ENST00000329286 NCAPD3P42695 1498 aa47.77■■■■■ 5.24
RAB12-201ENST00000329286 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP47.75■■■■■ 5.24
RAB12-201ENST00000329286 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.73■■■■■ 5.23
RAB12-201ENST00000329286 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP47.67■■■■■ 5.22
RAB12-201ENST00000329286 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.62■■■■■ 5.21
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RAB12-201ENST00000329286 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.58■■■■■ 5.21
RAB12-201ENST00000329286 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.44■■■■■ 5.18
RAB12-201ENST00000329286 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.33■■■■■ 5.17
RAB12-201ENST00000329286 CUX1P39880 1505 aa47.32■■■■■ 5.17
RAB12-201ENST00000329286 CFTRP13569 1480 aa47.32■■■■■ 5.17
RAB12-201ENST00000329286 PRXQ9BXM0 1461 aa47.27■■■■■ 5.16
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RAB12-201ENST00000329286 KIF27Q86VH2 1401 aa47.04■■■■■ 5.12
RAB12-201ENST00000329286 APLP2Q06481 763 aa46.96■■■■■ 5.11
RAB12-201ENST00000329286 ARAP1Q96P48 1450 aa46.92■■■■■ 5.1
RAB12-201ENST00000329286 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.86■■■■■ 5.09
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RAB12-201ENST00000329286 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.48■■■■■ 5.03
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RAB12-201ENST00000329286 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
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RAB12-201ENST00000329286 NESP48681 1621 aa45.9■■■■■ 4.94
RAB12-201ENST00000329286 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.87■■■■■ 4.93
RAB12-201ENST00000329286 CUL7Q14999 1698 aa45.84■■■■■ 4.93
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