RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.81■■■□□ 2.2
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PTPRN2-201ENST00000389413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.85■■□□□ 1.89
PTPRN2-201ENST00000389413 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRN2-201ENST00000389413 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM41Q8WV44 630 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRN2-201ENST00000389413 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRN2-201ENST00000389413 APLP2Q06481 763 aa25■■□□□ 1.59
PTPRN2-201ENST00000389413 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.91■■□□□ 1.58
PTPRN2-201ENST00000389413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
PTPRN2-201ENST00000389413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
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PTPRN2-201ENST00000389413 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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PTPRN2-201ENST00000389413 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
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PTPRN2-201ENST00000389413 ABCC9O60706 1549 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
PTPRN2-201ENST00000389413 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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PTPRN2-201ENST00000389413 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.6■■□□□ 1.37
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PTPRN2-201ENST00000389413 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.38■■□□□ 1.33
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PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRN2-201ENST00000389413 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.2■■□□□ 1.3
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PTPRN2-201ENST00000389413 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PTPRN2-201ENST00000389413 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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PTPRN2-201ENST00000389413 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.97■■□□□ 1.27
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM52Q96A61 297 aa22.82■■□□□ 1.24
PTPRN2-201ENST00000389413 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
PTPRN2-201ENST00000389413 ANP32CO43423 234 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRN2-201ENST00000389413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2-201ENST00000389413 P3H3Q8IVL6 736 aa22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2-201ENST00000389413 EEA1Q15075 1411 aa22.7■■□□□ 1.23
PTPRN2-201ENST00000389413 BCANQ96GW7 911 aa22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2-201ENST00000389413 CEP162Q5TB80 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRN2-201ENST00000389413 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.6■■□□□ 1.21
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PTPRN2-201ENST00000389413 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-201ENST00000389413 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN2-201ENST00000389413 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN2-201ENST00000389413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
PTPRN2-201ENST00000389413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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PTPRN2-201ENST00000389413 TONSLQ96HA7 1378 aa22.42■■□□□ 1.18
PTPRN2-201ENST00000389413 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PTPRN2-201ENST00000389413 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ARID3CA6NKF2 412 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2-201ENST00000389413 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRN2-201ENST00000389413 FBLN2P98095 1184 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2-201ENST00000389413 FKBP8Q14318 412 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2-201ENST00000389413 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRN2-201ENST00000389413 SOGA1O94964 1423 aa22.28■■□□□ 1.16
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PTPRN2-201ENST00000389413 ABCC8Q09428 1581 aa22.12■■□□□ 1.13
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PTPRN2-201ENST00000389413 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.04■■□□□ 1.12
PTPRN2-201ENST00000389413 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
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PTPRN2-201ENST00000389413 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11
PTPRN2-201ENST00000389413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN2-201ENST00000389413 MRS2Q9HD23 443 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN2-201ENST00000389413 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TMC1Q8TDI8 760 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPY4P0CV99 314 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPY10P0CW01 314 aa21.84■■□□□ 1.09
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