RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.81■■■□□ 2.2
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PTPRN2-201ENST00000389413 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.85■■□□□ 1.89
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PTPRN2-201ENST00000389413 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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PTPRN2-201ENST00000389413 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
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PTPRN2-201ENST00000389413 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PTPRN2-201ENST00000389413 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRN2-201ENST00000389413 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.73■■□□□ 1.23
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PTPRN2-201ENST00000389413 CEP162Q5TB80 1403 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRN2-201ENST00000389413 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.56■■□□□ 1.2
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PTPRN2-201ENST00000389413 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
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PTPRN2-201ENST00000389413 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.39■■□□□ 1.18
PTPRN2-201ENST00000389413 ARID3CA6NKF2 412 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2-201ENST00000389413 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.35■■□□□ 1.17
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PTPRN2-201ENST00000389413 FBLN2P98095 1184 aa22.32■■□□□ 1.16
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PTPRN2-201ENST00000389413 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.11
PTPRN2-201ENST00000389413 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRN2-201ENST00000389413 MRS2Q9HD23 443 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRN2-201ENST00000389413 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TMC1Q8TDI8 760 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPY4P0CV99 314 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRN2-201ENST00000389413 TSPY10P0CW01 314 aa21.84■■□□□ 1.09
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