RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567283.5

RPUSD1-209, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 835 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-209ENST00000567283 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.41■■■■■ 7.42
RPUSD1-209ENST00000567283 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.21■■■■■ 6.43
RPUSD1-209ENST00000567283 ABCC9O60706 1549 aa55.11■■■■■ 6.41
RPUSD1-209ENST00000567283 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.51■■■■■ 6
RPUSD1-209ENST00000567283 NACADO15069 1562 aa52.1■■■■■ 5.93
RPUSD1-209ENST00000567283 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.84■■■■■ 5.89
RPUSD1-209ENST00000567283 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.45■■■■■ 5.83
RPUSD1-209ENST00000567283 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.37■■■■■ 5.81
RPUSD1-209ENST00000567283 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.32■■■■■ 5.81
RPUSD1-209ENST00000567283 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.24■■■■■ 5.79
RPUSD1-209ENST00000567283 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.93■■■■■ 5.74
RPUSD1-209ENST00000567283 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.89■■■■■ 5.74
RPUSD1-209ENST00000567283 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.7■■■■■ 5.71
RPUSD1-209ENST00000567283 SCRIBQ14160 1630 aa50.34■■■■■ 5.65
RPUSD1-209ENST00000567283 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.24■■■■■ 5.63
RPUSD1-209ENST00000567283 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.79■■■■■ 5.56
RPUSD1-209ENST00000567283 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
RPUSD1-209ENST00000567283 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.62■■■■■ 5.53
RPUSD1-209ENST00000567283 NCAPD3P42695 1498 aa48.01■■■■■ 5.28
RPUSD1-209ENST00000567283 SMARCA4P51532 1647 aa47.97■■■■■ 5.27
RPUSD1-209ENST00000567283 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.91■■■■■ 5.26
RPUSD1-209ENST00000567283 SMARCA2P51531 1590 aa47.86■■■■■ 5.25
RPUSD1-209ENST00000567283 HMGXB3Q12766 1538 aa47.76■■■■■ 5.24
RPUSD1-209ENST00000567283 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
RPUSD1-209ENST00000567283 ERCC6Q03468 1493 aa47.64■■■■■ 5.22
RPUSD1-209ENST00000567283 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
RPUSD1-209ENST00000567283 CUX2O14529 1486 aa47.46■■■■■ 5.19
RPUSD1-209ENST00000567283 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.43■■■■■ 5.18
RPUSD1-209ENST00000567283 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.33■■■■■ 5.17
RPUSD1-209ENST00000567283 NESP48681 1621 aa47.33■■■■■ 5.17
RPUSD1-209ENST00000567283 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.23■■■■■ 5.15
RPUSD1-209ENST00000567283 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.04■■■■■ 5.12
RPUSD1-209ENST00000567283 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.9■■■■■ 5.1
RPUSD1-209ENST00000567283 WIZO95785 1651 aa46.83■■■■■ 5.09
RPUSD1-209ENST00000567283 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.83■■■■■ 5.09
RPUSD1-209ENST00000567283 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.72■■■■■ 5.07
RPUSD1-209ENST00000567283 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.57■■■■■ 5.05
RPUSD1-209ENST00000567283 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.36■■■■■ 5.01
RPUSD1-209ENST00000567283 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.31■■■■■ 5
RPUSD1-209ENST00000567283 WDR62O43379 1518 aa46.23■■■■■ 4.99
RPUSD1-209ENST00000567283 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
RPUSD1-209ENST00000567283 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.21■■■■■ 4.99
RPUSD1-209ENST00000567283 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.12■■■■■ 4.97
RPUSD1-209ENST00000567283 CFTRP13569 1480 aa46.06■■■■■ 4.96
RPUSD1-209ENST00000567283 PRDM2Q13029 1718 aa45.82■■■■■ 4.93
RPUSD1-209ENST00000567283 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
RPUSD1-209ENST00000567283 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.63■■■■■ 4.9
RPUSD1-209ENST00000567283 TRIM41Q8WV44 630 aa45.35■■■■■ 4.85
RPUSD1-209ENST00000567283 TOPBP1Q92547 1522 aa45.25■■■■■ 4.83
RPUSD1-209ENST00000567283 IFT140Q96RY7 1462 aa45.23■■■■■ 4.83
RPUSD1-209ENST00000567283 OSCARQ8IYS5 282 aa45.21■■■■■ 4.83
RPUSD1-209ENST00000567283 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.15■■■■■ 4.82
RPUSD1-209ENST00000567283 ABCC8Q09428 1581 aa45.13■■■■■ 4.82
RPUSD1-209ENST00000567283 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.13■■■■■ 4.82
RPUSD1-209ENST00000567283 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
RPUSD1-209ENST00000567283 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
RPUSD1-209ENST00000567283 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
RPUSD1-209ENST00000567283 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
RPUSD1-209ENST00000567283 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
RPUSD1-209ENST00000567283 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.76■■■■■ 4.76
RPUSD1-209ENST00000567283 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.72■■■■■ 4.758e-8■■■■■ 39.5
RPUSD1-209ENST00000567283 CHD1O14646 1710 aa44.7■■■■■ 4.75
RPUSD1-209ENST00000567283 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.61■■■■■ 4.73
RPUSD1-209ENST00000567283 ARHGEF11O15085 1522 aa44.59■■■■■ 4.73
RPUSD1-209ENST00000567283 SOGA1O94964 1423 aa44.55■■■■■ 4.72
RPUSD1-209ENST00000567283 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.54■■■■■ 4.72
RPUSD1-209ENST00000567283 CUX1P39880 1505 aa44.49■■■■■ 4.71
RPUSD1-209ENST00000567283 FBLN2P98095 1184 aa44.48■■■■■ 4.71
RPUSD1-209ENST00000567283 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.45■■■■■ 4.71
RPUSD1-209ENST00000567283 WDR97A6NE52 1622 aa44.43■■■■■ 4.7
RPUSD1-209ENST00000567283 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
RPUSD1-209ENST00000567283 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.35■■■■■ 4.69
RPUSD1-209ENST00000567283 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
RPUSD1-209ENST00000567283 GRIN2BQ13224 1484 aa44.2■■■■■ 4.67
RPUSD1-209ENST00000567283 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.19■■■■■ 4.66
RPUSD1-209ENST00000567283 PBRM1Q86U86 1689 aa44.16■■■■■ 4.66
RPUSD1-209ENST00000567283 ARAP1Q96P48 1450 aa44.14■■■■■ 4.66
RPUSD1-209ENST00000567283 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.12■■■■■ 4.65
RPUSD1-209ENST00000567283 SYNJ1O43426 1573 aa44.12■■■■■ 4.65
RPUSD1-209ENST00000567283 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.08■■■■■ 4.65
RPUSD1-209ENST00000567283 SYNJ2O15056 1496 aa44.05■■■■■ 4.64
RPUSD1-209ENST00000567283 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.04■■■■■ 4.64
RPUSD1-209ENST00000567283 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44■■■■■ 4.63
RPUSD1-209ENST00000567283 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.99■■■■■ 4.63
RPUSD1-209ENST00000567283 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.84■■■■■ 4.61
RPUSD1-209ENST00000567283 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.84■■■■■ 4.61
RPUSD1-209ENST00000567283 TOP2BQ02880 1626 aa43.81■■■■■ 4.6
RPUSD1-209ENST00000567283 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
RPUSD1-209ENST00000567283 ADAMTS12P58397 1594 aa43.69■■■■■ 4.58
RPUSD1-209ENST00000567283 GRIN2AQ12879 1464 aa43.64■■■■■ 4.58
RPUSD1-209ENST00000567283 CEP170Q5SW79 1584 aa43.51■■■■■ 4.56
RPUSD1-209ENST00000567283 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.48■■■■■ 4.55
RPUSD1-209ENST00000567283 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.47■■■■■ 4.55
RPUSD1-209ENST00000567283 NUP160Q12769 1436 aa43.43■■■■■ 4.54
RPUSD1-209ENST00000567283 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.4■■■■■ 4.54
RPUSD1-209ENST00000567283 SHROOM2Q13796 1616 aa43.3■■■■■ 4.52
RPUSD1-209ENST00000567283 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.08■■■■■ 4.49
RPUSD1-209ENST00000567283 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
RPUSD1-209ENST00000567283 JPH4Q96JJ6 628 aa42.94■■■■■ 4.46
RPUSD1-209ENST00000567283 CUL7Q14999 1698 aa42.94■■■■■ 4.46
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