RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537550.1

UBTF-214, Transcript of upstream binding transcription factor, humanhuman

TSL 2

Gene UBTF, Length 1,085 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTF-214ENST00000537550 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.27■■■■■ 6.92
UBTF-214ENST00000537550 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.91■■■■■ 5.9
UBTF-214ENST00000537550 ABCC9O60706 1549 aa51.08■■■■■ 5.77
UBTF-214ENST00000537550 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.02■■■■■ 5.44
UBTF-214ENST00000537550 NACADO15069 1562 aa48.9■■■■■ 5.42
UBTF-214ENST00000537550 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.86■■■■■ 5.41
UBTF-214ENST00000537550 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.51■■■■■ 5.36
UBTF-214ENST00000537550 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.47■■■■■ 5.35
UBTF-214ENST00000537550 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.19■■■■■ 5.31
UBTF-214ENST00000537550 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.82■■■■■ 5.25
UBTF-214ENST00000537550 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.7■■■■■ 5.23
UBTF-214ENST00000537550 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.5■■■■■ 5.19
UBTF-214ENST00000537550 SCRIBQ14160 1630 aa47.34■■■■■ 5.17
UBTF-214ENST00000537550 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.12■■■■■ 5.13
UBTF-214ENST00000537550 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.02■■■■■ 5.12
UBTF-214ENST00000537550 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.29■■■■■ 5
UBTF-214ENST00000537550 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.17■■■■■ 4.98
UBTF-214ENST00000537550 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
UBTF-214ENST00000537550 SMARCA4P51532 1647 aa45.26■■■■■ 4.84
UBTF-214ENST00000537550 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
UBTF-214ENST00000537550 NCAPD3P42695 1498 aa45.12■■■■■ 4.81
UBTF-214ENST00000537550 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.1■■■■■ 4.81
UBTF-214ENST00000537550 SMARCA2P51531 1590 aa45.05■■■■■ 4.8
UBTF-214ENST00000537550 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.89■■■■■ 4.78
UBTF-214ENST00000537550 HMGXB3Q12766 1538 aa44.86■■■■■ 4.77
UBTF-214ENST00000537550 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.82■■■■■ 4.76
UBTF-214ENST00000537550 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.72■■■■■ 4.75
UBTF-214ENST00000537550 WIZO95785 1651 aa44.38■■■■■ 4.69
UBTF-214ENST00000537550 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.29■■■■■ 4.68
UBTF-214ENST00000537550 NESP48681 1621 aa44.1■■■■■ 4.65
UBTF-214ENST00000537550 ERCC6Q03468 1493 aa44.08■■■■■ 4.65
UBTF-214ENST00000537550 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.97■■■■■ 4.63
UBTF-214ENST00000537550 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
UBTF-214ENST00000537550 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.8■■■■■ 4.6
UBTF-214ENST00000537550 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.72■■■■■ 4.59
UBTF-214ENST00000537550 CUX2O14529 1486 aa43.7■■■■■ 4.59
UBTF-214ENST00000537550 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.56■■■■■ 4.56
UBTF-214ENST00000537550 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
UBTF-214ENST00000537550 CFTRP13569 1480 aa43.47■■■■■ 4.55
UBTF-214ENST00000537550 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.41■■■■■ 4.54
UBTF-214ENST00000537550 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.29■■■■■ 4.52
UBTF-214ENST00000537550 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.27■■■■■ 4.52
UBTF-214ENST00000537550 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.26■■■■■ 4.52
UBTF-214ENST00000537550 WDR62O43379 1518 aa43.11■■■■■ 4.49
UBTF-214ENST00000537550 PRDM2Q13029 1718 aa43.07■■■■■ 4.49
UBTF-214ENST00000537550 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.48
UBTF-214ENST00000537550 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
UBTF-214ENST00000537550 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.69■■■■■ 4.42
UBTF-214ENST00000537550 ABCC8Q09428 1581 aa42.57■■■■■ 4.41
UBTF-214ENST00000537550 TOPBP1Q92547 1522 aa42.56■■■■■ 4.4
UBTF-214ENST00000537550 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.49■■■■■ 4.39
UBTF-214ENST00000537550 IFT140Q96RY7 1462 aa42.38■■■■■ 4.38
UBTF-214ENST00000537550 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
UBTF-214ENST00000537550 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.18■■■■■ 4.34
UBTF-214ENST00000537550 CUX1P39880 1505 aa42.13■■■■■ 4.33
UBTF-214ENST00000537550 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
UBTF-214ENST00000537550 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
UBTF-214ENST00000537550 SOGA1O94964 1423 aa42.03■■■■■ 4.32
UBTF-214ENST00000537550 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42■■■■■ 4.31
UBTF-214ENST00000537550 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
UBTF-214ENST00000537550 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.31e-8■■■■□ 24
UBTF-214ENST00000537550 OSCARQ8IYS5 282 aa41.87■■■■■ 4.29
UBTF-214ENST00000537550 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
UBTF-214ENST00000537550 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
UBTF-214ENST00000537550 WDR97A6NE52 1622 aa41.77■■■■■ 4.28
UBTF-214ENST00000537550 TOP2BQ02880 1626 aa41.69■■■■■ 4.27
UBTF-214ENST00000537550 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.68■■■■■ 4.26
UBTF-214ENST00000537550 SYNJ1O43426 1573 aa41.66■■■■■ 4.26
UBTF-214ENST00000537550 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.62■■■■■ 4.25
UBTF-214ENST00000537550 GRIN2BQ13224 1484 aa41.57■■■■■ 4.25
UBTF-214ENST00000537550 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.53■■■■■ 4.24
UBTF-214ENST00000537550 FBLN2P98095 1184 aa41.53■■■■■ 4.24
UBTF-214ENST00000537550 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.53■■■■■ 4.24
UBTF-214ENST00000537550 CHD1O14646 1710 aa41.51■■■■■ 4.24
UBTF-214ENST00000537550 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
UBTF-214ENST00000537550 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.46■■■■■ 4.23
UBTF-214ENST00000537550 PBRM1Q86U86 1689 aa41.42■■■■■ 4.22
UBTF-214ENST00000537550 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
UBTF-214ENST00000537550 SYNJ2O15056 1496 aa41.33■■■■■ 4.21
UBTF-214ENST00000537550 TRIM41Q8WV44 630 aa41.2■■■■■ 4.19
UBTF-214ENST00000537550 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
UBTF-214ENST00000537550 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
UBTF-214ENST00000537550 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
UBTF-214ENST00000537550 ARHGEF11O15085 1522 aa41.14■■■■■ 4.18
UBTF-214ENST00000537550 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.13■■■■■ 4.17
UBTF-214ENST00000537550 ADAMTS12P58397 1594 aa41.08■■■■■ 4.17
UBTF-214ENST00000537550 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.07■■■■■ 4.16
UBTF-214ENST00000537550 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
UBTF-214ENST00000537550 GRIN2AQ12879 1464 aa41.02■■■■■ 4.16
UBTF-214ENST00000537550 KIF27Q86VH2 1401 aa40.95■■■■■ 4.15
UBTF-214ENST00000537550 NUP160Q12769 1436 aa40.84■■■■■ 4.13
UBTF-214ENST00000537550 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.82■■■■■ 4.13
UBTF-214ENST00000537550 IGF1RP08069 1367 aa40.8■■■■■ 4.12
UBTF-214ENST00000537550 CEP170Q5SW79 1584 aa40.8■■■■■ 4.12
UBTF-214ENST00000537550 ARAP1Q96P48 1450 aa40.79■■■■■ 4.12
UBTF-214ENST00000537550 CUL7Q14999 1698 aa40.69■■■■■ 4.1
UBTF-214ENST00000537550 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.57■■■■■ 4.08
UBTF-214ENST00000537550 SHROOM2Q13796 1616 aa40.55■■■■■ 4.08
UBTF-214ENST00000537550 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.48■■■■■ 4.07
UBTF-214ENST00000537550 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.47■■■■■ 4.07
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