RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296210.11

TPRA1-201, Transcript of transmembrane protein adipocyte associated 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPRA1, Length 1,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1-201ENST00000296210 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.41■■■■■ 7.42
TPRA1-201ENST00000296210 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.91■■■■■ 6.22
TPRA1-201ENST00000296210 ABCC9O60706 1549 aa51.74■■■■■ 5.87
TPRA1-201ENST00000296210 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.39■■■■■ 5.82
TPRA1-201ENST00000296210 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.16■■■■■ 5.78
TPRA1-201ENST00000296210 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.79■■■■■ 5.72
TPRA1-201ENST00000296210 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.51■■■■■ 5.68
TPRA1-201ENST00000296210 NACADO15069 1562 aa50.47■■■■■ 5.67
TPRA1-201ENST00000296210 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.24■■■■■ 5.63
TPRA1-201ENST00000296210 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.54■■■■■ 5.52
TPRA1-201ENST00000296210 SCRIBQ14160 1630 aa49.45■■■■■ 5.51
TPRA1-201ENST00000296210 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.96■■■■■ 5.43
TPRA1-201ENST00000296210 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.66■■■■■ 5.38
TPRA1-201ENST00000296210 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.57■■■■■ 5.37
TPRA1-201ENST00000296210 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.73■■■■■ 5.23
TPRA1-201ENST00000296210 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
TPRA1-201ENST00000296210 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.36■■■■■ 5.17
TPRA1-201ENST00000296210 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
TPRA1-201ENST00000296210 SMARCA4P51532 1647 aa47.35■■■■■ 5.17
TPRA1-201ENST00000296210 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.32■■■■■ 5.17
TPRA1-201ENST00000296210 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.26■■■■■ 5.16
TPRA1-201ENST00000296210 WIZO95785 1651 aa46.91■■■■■ 5.1
TPRA1-201ENST00000296210 SMARCA2P51531 1590 aa46.81■■■■■ 5.08
TPRA1-201ENST00000296210 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.81■■■■■ 5.08
TPRA1-201ENST00000296210 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.8■■■■■ 5.08
TPRA1-201ENST00000296210 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.76■■■■■ 5.08
TPRA1-201ENST00000296210 NCAPD3P42695 1498 aa46.57■■■■■ 5.05
TPRA1-201ENST00000296210 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.56■■■■■ 5.04
TPRA1-201ENST00000296210 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.48■■■■■ 5.03
TPRA1-201ENST00000296210 HMGXB3Q12766 1538 aa46.42■■■■■ 5.02
TPRA1-201ENST00000296210 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.28■■■■■ 5
TPRA1-201ENST00000296210 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.99■■■■■ 4.95
TPRA1-201ENST00000296210 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.68■■■■■ 4.9
TPRA1-201ENST00000296210 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.36■■■■■ 4.85
TPRA1-201ENST00000296210 CFTRP13569 1480 aa45.3■■■■■ 4.84
TPRA1-201ENST00000296210 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.12■■■■■ 4.81
TPRA1-201ENST00000296210 NESP48681 1621 aa45.1■■■■■ 4.81
TPRA1-201ENST00000296210 PRDM2Q13029 1718 aa44.91■■■■■ 4.78
TPRA1-201ENST00000296210 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.89■■■■■ 4.78
TPRA1-201ENST00000296210 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.83■■■■■ 4.77
TPRA1-201ENST00000296210 ABCC8Q09428 1581 aa44.7■■■■■ 4.75
TPRA1-201ENST00000296210 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.65■■■■■ 4.74
TPRA1-201ENST00000296210 TRIM41Q8WV44 630 aa44.64■■■■■ 4.74
TPRA1-201ENST00000296210 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.63■■■■■ 4.74
TPRA1-201ENST00000296210 ERCC6Q03468 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
TPRA1-201ENST00000296210 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.51■■■■■ 4.72
TPRA1-201ENST00000296210 SYNJ1O43426 1573 aa44.36■■■■■ 4.69
TPRA1-201ENST00000296210 CUX1P39880 1505 aa44.34■■■■■ 4.69
TPRA1-201ENST00000296210 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.3■■■■■ 4.68
TPRA1-201ENST00000296210 TOP2BQ02880 1626 aa44.29■■■■■ 4.68
TPRA1-201ENST00000296210 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.26■■■■■ 4.68
TPRA1-201ENST00000296210 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
TPRA1-201ENST00000296210 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.23■■■■■ 4.67
TPRA1-201ENST00000296210 TOPBP1Q92547 1522 aa44.22■■■■■ 4.67
TPRA1-201ENST00000296210 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.04■■■■■ 4.64
TPRA1-201ENST00000296210 WDR62O43379 1518 aa44.03■■■■■ 4.64
TPRA1-201ENST00000296210 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
TPRA1-201ENST00000296210 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
TPRA1-201ENST00000296210 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.93■■■■■ 4.62
TPRA1-201ENST00000296210 SOGA1O94964 1423 aa43.87■■■■■ 4.61
TPRA1-201ENST00000296210 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.78■■■■■ 4.6
TPRA1-201ENST00000296210 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
TPRA1-201ENST00000296210 CUX2O14529 1486 aa43.68■■■■■ 4.58
TPRA1-201ENST00000296210 IFT140Q96RY7 1462 aa43.65■■■■■ 4.58
TPRA1-201ENST00000296210 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.64■■■■■ 4.58
TPRA1-201ENST00000296210 EEA1Q15075 1411 aa43.62■■■■■ 4.57
TPRA1-201ENST00000296210 KIF27Q86VH2 1401 aa43.62■■■■■ 4.57
TPRA1-201ENST00000296210 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.57■■■■■ 4.56
TPRA1-201ENST00000296210 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
TPRA1-201ENST00000296210 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
TPRA1-201ENST00000296210 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.47■■■■■ 4.55
TPRA1-201ENST00000296210 WDR97A6NE52 1622 aa43.45■■■■■ 4.55
TPRA1-201ENST00000296210 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.34■■■■■ 4.53
TPRA1-201ENST00000296210 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
TPRA1-201ENST00000296210 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.31■■■■■ 4.528e-7■■■■□ 23.8
TPRA1-201ENST00000296210 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.28■■■■■ 4.52
TPRA1-201ENST00000296210 IGF1RP08069 1367 aa43.25■■■■■ 4.51
TPRA1-201ENST00000296210 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
TPRA1-201ENST00000296210 GRIN2BQ13224 1484 aa43.15■■■■■ 4.5
TPRA1-201ENST00000296210 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.14■■■■■ 4.5
TPRA1-201ENST00000296210 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.14■■■■■ 4.5
TPRA1-201ENST00000296210 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.07■■■■■ 4.49
TPRA1-201ENST00000296210 PBRM1Q86U86 1689 aa43.05■■■■■ 4.48
TPRA1-201ENST00000296210 PRXQ9BXM0 1461 aa43.02■■■■■ 4.48
TPRA1-201ENST00000296210 KIF21BO75037 1637 aa42.98■■■■■ 4.47
TPRA1-201ENST00000296210 CUL7Q14999 1698 aa42.98■■■■■ 4.47
TPRA1-201ENST00000296210 GOLGA3Q08378 1498 aa42.94■■■■■ 4.46
TPRA1-201ENST00000296210 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.92■■■■■ 4.46
TPRA1-201ENST00000296210 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.91■■■■■ 4.46
TPRA1-201ENST00000296210 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
TPRA1-201ENST00000296210 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.89■■■■■ 4.46
TPRA1-201ENST00000296210 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
TPRA1-201ENST00000296210 ADAMTS12P58397 1594 aa42.81■■■■■ 4.44
TPRA1-201ENST00000296210 PCGF6Q9BYE7 350 aa42.78■■■■■ 4.44
TPRA1-201ENST00000296210 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
TPRA1-201ENST00000296210 FBLN2P98095 1184 aa42.74■■■■■ 4.43
TPRA1-201ENST00000296210 SYNJ2O15056 1496 aa42.7■■■■■ 4.43
TPRA1-201ENST00000296210 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.65■■■■■ 4.42
TPRA1-201ENST00000296210 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
TPRA1-201ENST00000296210 GRIN2AQ12879 1464 aa42.57■■■■■ 4.41
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