RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569601.5

RPUSD1-210, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPUSD1, Length 917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-210ENST00000569601 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.35■■■■■ 6.93
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RPUSD1-210ENST00000569601 ABCC9O60706 1549 aa51.88■■■■■ 5.9
RPUSD1-210ENST00000569601 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.53■■■■■ 5.52
RPUSD1-210ENST00000569601 NACADO15069 1562 aa49.26■■■■■ 5.48
RPUSD1-210ENST00000569601 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.09■■■■■ 5.45
RPUSD1-210ENST00000569601 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.68■■■■■ 5.38
RPUSD1-210ENST00000569601 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.52■■■■■ 5.36
RPUSD1-210ENST00000569601 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.43■■■■■ 5.34
RPUSD1-210ENST00000569601 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.35■■■■■ 5.33
RPUSD1-210ENST00000569601 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.34■■■■■ 5.33
RPUSD1-210ENST00000569601 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.2■■■■■ 5.31
RPUSD1-210ENST00000569601 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.1■■■■■ 5.29
RPUSD1-210ENST00000569601 SCRIBQ14160 1630 aa47.63■■■■■ 5.21
RPUSD1-210ENST00000569601 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.42■■■■■ 5.18
RPUSD1-210ENST00000569601 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.9■■■■■ 5.1
RPUSD1-210ENST00000569601 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.87■■■■■ 5.09
RPUSD1-210ENST00000569601 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.68■■■■■ 5.06
RPUSD1-210ENST00000569601 SMARCA4P51532 1647 aa45.47■■■■■ 4.87
RPUSD1-210ENST00000569601 NCAPD3P42695 1498 aa45.46■■■■■ 4.87
RPUSD1-210ENST00000569601 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.39■■■■■ 4.86
RPUSD1-210ENST00000569601 SMARCA2P51531 1590 aa45.28■■■■■ 4.84
RPUSD1-210ENST00000569601 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.27■■■■■ 4.84
RPUSD1-210ENST00000569601 HMGXB3Q12766 1538 aa45.18■■■■■ 4.82
RPUSD1-210ENST00000569601 PEG3Q9GZU2 1588 aa45■■■■■ 4.79
RPUSD1-210ENST00000569601 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.99■■■■■ 4.79
RPUSD1-210ENST00000569601 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.98■■■■■ 4.79
RPUSD1-210ENST00000569601 ERCC6Q03468 1493 aa44.74■■■■■ 4.75
RPUSD1-210ENST00000569601 NESP48681 1621 aa44.68■■■■■ 4.74
RPUSD1-210ENST00000569601 CUX2O14529 1486 aa44.53■■■■■ 4.72
RPUSD1-210ENST00000569601 WIZO95785 1651 aa44.49■■■■■ 4.71
RPUSD1-210ENST00000569601 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.41■■■■■ 4.7
RPUSD1-210ENST00000569601 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.17■■■■■ 4.66
RPUSD1-210ENST00000569601 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.16■■■■■ 4.66
RPUSD1-210ENST00000569601 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.16■■■■■ 4.66
RPUSD1-210ENST00000569601 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.1■■■■■ 4.65
RPUSD1-210ENST00000569601 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.1■■■■■ 4.65
RPUSD1-210ENST00000569601 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.09■■■■■ 4.65
RPUSD1-210ENST00000569601 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
RPUSD1-210ENST00000569601 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.73■■■■■ 4.59
RPUSD1-210ENST00000569601 CFTRP13569 1480 aa43.68■■■■■ 4.58
RPUSD1-210ENST00000569601 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.63■■■■■ 4.57
RPUSD1-210ENST00000569601 WDR62O43379 1518 aa43.62■■■■■ 4.57
RPUSD1-210ENST00000569601 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.61■■■■■ 4.57
RPUSD1-210ENST00000569601 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.41■■■■■ 4.54
RPUSD1-210ENST00000569601 PRDM2Q13029 1718 aa43.37■■■■■ 4.53
RPUSD1-210ENST00000569601 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
RPUSD1-210ENST00000569601 TOPBP1Q92547 1522 aa42.84■■■■■ 4.45
RPUSD1-210ENST00000569601 ABCC8Q09428 1581 aa42.73■■■■■ 4.43
RPUSD1-210ENST00000569601 IFT140Q96RY7 1462 aa42.73■■■■■ 4.43
RPUSD1-210ENST00000569601 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.72■■■■■ 4.43
RPUSD1-210ENST00000569601 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
RPUSD1-210ENST00000569601 OSCARQ8IYS5 282 aa42.55■■■■■ 4.4
RPUSD1-210ENST00000569601 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
RPUSD1-210ENST00000569601 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
RPUSD1-210ENST00000569601 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
RPUSD1-210ENST00000569601 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
RPUSD1-210ENST00000569601 TRIM41Q8WV44 630 aa42.34■■■■■ 4.37
RPUSD1-210ENST00000569601 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.368e-8■■■■■ 39.5
RPUSD1-210ENST00000569601 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.27■■■■■ 4.36
RPUSD1-210ENST00000569601 CUX1P39880 1505 aa42.24■■■■■ 4.35
RPUSD1-210ENST00000569601 SOGA1O94964 1423 aa42.21■■■■■ 4.35
RPUSD1-210ENST00000569601 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.21■■■■■ 4.35
RPUSD1-210ENST00000569601 CHD1O14646 1710 aa42.12■■■■■ 4.33
RPUSD1-210ENST00000569601 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
RPUSD1-210ENST00000569601 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
RPUSD1-210ENST00000569601 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
RPUSD1-210ENST00000569601 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.02■■■■■ 4.32
RPUSD1-210ENST00000569601 WDR97A6NE52 1622 aa42.02■■■■■ 4.32
RPUSD1-210ENST00000569601 FBLN2P98095 1184 aa41.95■■■■■ 4.31
RPUSD1-210ENST00000569601 ARHGEF11O15085 1522 aa41.9■■■■■ 4.3
RPUSD1-210ENST00000569601 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.89■■■■■ 4.3
RPUSD1-210ENST00000569601 GRIN2BQ13224 1484 aa41.81■■■■■ 4.28
RPUSD1-210ENST00000569601 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
RPUSD1-210ENST00000569601 PBRM1Q86U86 1689 aa41.75■■■■■ 4.27
RPUSD1-210ENST00000569601 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.74■■■■■ 4.27
RPUSD1-210ENST00000569601 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.72■■■■■ 4.27
RPUSD1-210ENST00000569601 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.68■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.68■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 TOP2BQ02880 1626 aa41.66■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.64■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 SYNJ2O15056 1496 aa41.64■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 SYNJ1O43426 1573 aa41.63■■■■■ 4.26
RPUSD1-210ENST00000569601 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.59■■■■■ 4.25
RPUSD1-210ENST00000569601 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.55■■■■■ 4.24
RPUSD1-210ENST00000569601 ARAP1Q96P48 1450 aa41.52■■■■■ 4.24
RPUSD1-210ENST00000569601 ADAMTS12P58397 1594 aa41.33■■■■■ 4.21
RPUSD1-210ENST00000569601 GRIN2AQ12879 1464 aa41.28■■■■■ 4.2
RPUSD1-210ENST00000569601 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.23■■■■■ 4.19
RPUSD1-210ENST00000569601 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.19■■■■■ 4.18
RPUSD1-210ENST00000569601 CEP170Q5SW79 1584 aa41.15■■■■■ 4.18
RPUSD1-210ENST00000569601 NUP160Q12769 1436 aa41.12■■■■■ 4.17
RPUSD1-210ENST00000569601 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.99■■■■■ 4.15
RPUSD1-210ENST00000569601 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
RPUSD1-210ENST00000569601 SHROOM2Q13796 1616 aa40.94■■■■■ 4.14
RPUSD1-210ENST00000569601 KIF27Q86VH2 1401 aa40.82■■■■■ 4.12
RPUSD1-210ENST00000569601 IGF1RP08069 1367 aa40.76■■■■■ 4.12
RPUSD1-210ENST00000569601 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.74■■■■■ 4.11
RPUSD1-210ENST00000569601 CUL7Q14999 1698 aa40.72■■■■■ 4.11
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