Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.557e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.387e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.277e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 GIGYF2-228ENST00000469843 550 ntTSL 410.89□□□□□ -0.673e-8■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.996e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 227.39■■□□□ 1.986e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 326.57■■□□□ 1.846e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 226.37■■□□□ 1.816e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 RALY-207ENST00000481580 773 ntTSL 224.99■■□□□ 1.596e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 323.4■■□□□ 1.346e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 523.31■■□□□ 1.326e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 522.96■■□□□ 1.276e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-208ENST00000598059 611 ntTSL 422.81■■□□□ 1.246e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 522.47■■□□□ 1.196e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 522.47■■□□□ 1.196e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-215ENST00000580784 1081 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.196e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-216ENST00000581108 607 ntTSL 222.47■■□□□ 1.196e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 222.19■■□□□ 1.146e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-212ENST00000598896 1899 ntTSL 1 (best)21.65■■□□□ 1.066e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MRTO4-203ENST00000493700 578 ntTSL 221.31■■□□□ 16e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-232ENST00000610893 578 ntTSL 421.15■□□□□ 0.986e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.976e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-231ENST00000602251 671 ntTSL 220.87■□□□□ 0.936e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-206ENST00000546155 1285 ntTSL 220.69■□□□□ 0.96e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.896e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.896e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.886e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 519.42■□□□□ 0.76e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 RECQL4-207ENST00000534538 725 ntTSL 319.23■□□□□ 0.676e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-205ENST00000594293 623 ntTSL 419.21■□□□□ 0.676e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-201ENST00000269361 1088 ntTSL 518.75■□□□□ 0.596e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-214ENST00000580565 566 ntTSL 418.75■□□□□ 0.596e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-209ENST00000531286 1937 ntTSL 218.52■□□□□ 0.566e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 218.28■□□□□ 0.526e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CDC34-202ENST00000586283 1147 ntTSL 318.05■□□□□ 0.486e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 NCAPD3-205ENST00000526787 1226 ntTSL 317.87■□□□□ 0.456e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.416e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-233ENST00000612121 755 ntTSL 317.53■□□□□ 0.46e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TTLL3-227ENST00000482269 882 ntTSL 217.51■□□□□ 0.396e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 217.45■□□□□ 0.386e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-204ENST00000593959 546 ntTSL 417.44■□□□□ 0.386e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.387e-11■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-218ENST00000519397 583 ntTSL 417.35■□□□□ 0.376e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 ANKMY2-202ENST00000421746 591 ntTSL 417.34■□□□□ 0.376e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.356e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.316e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.36e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.297e-11■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.264e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LZTR1-216ENST00000495142 720 ntTSL 316.63■□□□□ 0.256e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-226ENST00000599724 910 ntTSL 516.51■□□□□ 0.236e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.26e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MSL1-205ENST00000578826 962 ntTSL 216.09■□□□□ 0.176e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.166e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 DNM2-222ENST00000593220 561 ntTSL 315.81■□□□□ 0.126e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.084e-7■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-234ENST00000612845 527 ntTSL 415.53■□□□□ 0.086e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 NCAPD3-213ENST00000534532 5539 ntTSL 215.3■□□□□ 0.046e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SLC6A6-202ENST00000452775 458 ntTSL 415.16■□□□□ 0.026e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 POLR1A-210ENST00000496892 546 ntTSL 415.11■□□□□ 0.016e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.016e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 AKAP8L-219ENST00000601147 583 ntTSL 215.08■□□□□ 06e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LZTR1-213ENST00000491432 527 ntTSL 315.08■□□□□ 06e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.016e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 AGAP3-203ENST00000461065 1707 ntTSL 1 (best)14.9□□□□□ -0.026e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.046e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.046e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-211ENST00000496908 342 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.066e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-208ENST00000578501 1124 ntTSL 214.61□□□□□ -0.076e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 AKAP8L-205ENST00000595067 548 ntTSL 414.56□□□□□ -0.086e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.086e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-228ENST00000600499 580 ntTSL 214.47□□□□□ -0.096e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 214.4□□□□□ -0.16e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 214.23□□□□□ -0.136e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.146e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 NCAPD3-203ENST00000525964 5025 ntTSL 1 (best)14.12□□□□□ -0.156e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.166e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CHAF1A-204ENST00000587368 564 ntTSL 513.96□□□□□ -0.176e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LTBP4-216ENST00000597071 670 ntTSL 213.69□□□□□ -0.226e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 213.62□□□□□ -0.236e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.246e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.276e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)13.3□□□□□ -0.286e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-226ENST00000640414 897 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.296e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.296e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 POLR1A-209ENST00000492034 588 ntTSL 412.89□□□□□ -0.356e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 LZTR1-203ENST00000415354 648 ntTSL 312.74□□□□□ -0.376e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 212.55□□□□□ -0.46e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 TTLL3-215ENST00000438141 1743 ntTSL 212.33□□□□□ -0.446e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 212.27□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SERPINH1-208ENST00000526638 719 ntTSL 212.24□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.456e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 211.93□□□□□ -0.56e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SEC16A-207ENST00000453963 4834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.6□□□□□ -0.556e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 DNM2-210ENST00000587830 868 ntTSL 511.47□□□□□ -0.576e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 SEC16A-206ENST00000431893 6465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.66e-6■■□□□ 13.7
PUM1Q14671 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 511.28□□□□□ -0.66e-6■■□□□ 13.7
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