RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.26■■■■□ 3.08
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POLR1A-210ENST00000496892 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.89■■■□□ 2.54
POLR1A-210ENST00000496892 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.75■■■□□ 2.35
POLR1A-210ENST00000496892 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.6■■■□□ 2.33
POLR1A-210ENST00000496892 NACADO15069 1562 aa29.3■■■□□ 2.28
POLR1A-210ENST00000496892 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.11■■■□□ 2.25
POLR1A-210ENST00000496892 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
POLR1A-210ENST00000496892 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.94■■■□□ 2.22
POLR1A-210ENST00000496892 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.78■■■□□ 2.2
POLR1A-210ENST00000496892 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.76■■■□□ 2.19
POLR1A-210ENST00000496892 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
POLR1A-210ENST00000496892 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.32■■■□□ 2.12
POLR1A-210ENST00000496892 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.26■■■□□ 2.11
POLR1A-210ENST00000496892 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.25■■■□□ 2.11
POLR1A-210ENST00000496892 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.25■■■□□ 2.11
POLR1A-210ENST00000496892 SCRIBQ14160 1630 aa28.15■■■□□ 2.1
POLR1A-210ENST00000496892 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
POLR1A-210ENST00000496892 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.58■■■□□ 2.01
POLR1A-210ENST00000496892 CUX2O14529 1486 aa27.13■■□□□ 1.93
POLR1A-210ENST00000496892 NCAPD3P42695 1498 aa27.07■■□□□ 1.92
POLR1A-210ENST00000496892 ERCC6Q03468 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
POLR1A-210ENST00000496892 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.94■■□□□ 1.9
POLR1A-210ENST00000496892 SMARCA2P51531 1590 aa26.84■■□□□ 1.89
POLR1A-210ENST00000496892 HMGXB3Q12766 1538 aa26.82■■□□□ 1.88
POLR1A-210ENST00000496892 SMARCA4P51532 1647 aa26.8■■□□□ 1.88
POLR1A-210ENST00000496892 NESP48681 1621 aa26.79■■□□□ 1.88
POLR1A-210ENST00000496892 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
POLR1A-210ENST00000496892 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
POLR1A-210ENST00000496892 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
POLR1A-210ENST00000496892 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.54■■□□□ 1.84
POLR1A-210ENST00000496892 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.5■■□□□ 1.83
POLR1A-210ENST00000496892 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.41■■□□□ 1.82
POLR1A-210ENST00000496892 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.41■■□□□ 1.82
POLR1A-210ENST00000496892 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.38■■□□□ 1.81
POLR1A-210ENST00000496892 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.23■■□□□ 1.79
POLR1A-210ENST00000496892 TRIM41Q8WV44 630 aa26.22■■□□□ 1.79
POLR1A-210ENST00000496892 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.19■■□□□ 1.78
POLR1A-210ENST00000496892 WDR62O43379 1518 aa26.14■■□□□ 1.77
POLR1A-210ENST00000496892 WIZO95785 1651 aa26.06■■□□□ 1.76
POLR1A-210ENST00000496892 CEP164Q9UPV0 1460 aa26■■□□□ 1.75
POLR1A-210ENST00000496892 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.94■■□□□ 1.74
POLR1A-210ENST00000496892 CFTRP13569 1480 aa25.85■■□□□ 1.73
POLR1A-210ENST00000496892 OSCARQ8IYS5 282 aa25.83■■□□□ 1.73
POLR1A-210ENST00000496892 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
POLR1A-210ENST00000496892 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
POLR1A-210ENST00000496892 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
POLR1A-210ENST00000496892 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
POLR1A-210ENST00000496892 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
POLR1A-210ENST00000496892 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.55■■□□□ 1.68
POLR1A-210ENST00000496892 PRDM2Q13029 1718 aa25.53■■□□□ 1.68
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
POLR1A-210ENST00000496892 IFT140Q96RY7 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.43■■□□□ 1.66
POLR1A-210ENST00000496892 ARHGEF11O15085 1522 aa25.42■■□□□ 1.66
POLR1A-210ENST00000496892 TOPBP1Q92547 1522 aa25.41■■□□□ 1.66
POLR1A-210ENST00000496892 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
POLR1A-210ENST00000496892 ABCC8Q09428 1581 aa25.3■■□□□ 1.64
POLR1A-210ENST00000496892 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.28■■□□□ 1.64
POLR1A-210ENST00000496892 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.27■■□□□ 1.64
POLR1A-210ENST00000496892 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
POLR1A-210ENST00000496892 CHD1O14646 1710 aa25.22■■□□□ 1.63
POLR1A-210ENST00000496892 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
POLR1A-210ENST00000496892 ARAP1Q96P48 1450 aa25.16■■□□□ 1.62
POLR1A-210ENST00000496892 FBLN2P98095 1184 aa25.15■■□□□ 1.62
POLR1A-210ENST00000496892 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
POLR1A-210ENST00000496892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
POLR1A-210ENST00000496892 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.06■■□□□ 1.6
POLR1A-210ENST00000496892 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
POLR1A-210ENST00000496892 SOGA1O94964 1423 aa25.01■■□□□ 1.59
POLR1A-210ENST00000496892 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.96■■□□□ 1.59
POLR1A-210ENST00000496892 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.92■■□□□ 1.58
POLR1A-210ENST00000496892 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
POLR1A-210ENST00000496892 WDR97A6NE52 1622 aa24.9■■□□□ 1.58
POLR1A-210ENST00000496892 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
POLR1A-210ENST00000496892 SYNJ1O43426 1573 aa24.87■■□□□ 1.57
POLR1A-210ENST00000496892 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
POLR1A-210ENST00000496892 CUX1P39880 1505 aa24.83■■□□□ 1.57
POLR1A-210ENST00000496892 GRIN2BQ13224 1484 aa24.83■■□□□ 1.56
POLR1A-210ENST00000496892 SYNJ2O15056 1496 aa24.79■■□□□ 1.56
POLR1A-210ENST00000496892 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
POLR1A-210ENST00000496892 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.69■■□□□ 1.54
POLR1A-210ENST00000496892 PBRM1Q86U86 1689 aa24.69■■□□□ 1.54
POLR1A-210ENST00000496892 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
POLR1A-210ENST00000496892 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.61■■□□□ 1.53
POLR1A-210ENST00000496892 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.6■■□□□ 1.53
POLR1A-210ENST00000496892 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.53■■□□□ 1.52
POLR1A-210ENST00000496892 GRIN2AQ12879 1464 aa24.51■■□□□ 1.51
POLR1A-210ENST00000496892 CEP170Q5SW79 1584 aa24.45■■□□□ 1.5
POLR1A-210ENST00000496892 NUP160Q12769 1436 aa24.44■■□□□ 1.5
POLR1A-210ENST00000496892 ADAMTS12P58397 1594 aa24.44■■□□□ 1.5
POLR1A-210ENST00000496892 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
POLR1A-210ENST00000496892 SHROOM2Q13796 1616 aa24.37■■□□□ 1.49
POLR1A-210ENST00000496892 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
POLR1A-210ENST00000496892 TOP2BQ02880 1626 aa24.32■■□□□ 1.48
POLR1A-210ENST00000496892 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.31■■□□□ 1.48
POLR1A-210ENST00000496892 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.27■■□□□ 1.48
POLR1A-210ENST00000496892 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.26■■□□□ 1.47
POLR1A-210ENST00000496892 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
POLR1A-210ENST00000496892 JPH4Q96JJ6 628 aa24.19■■□□□ 1.46
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