RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589534.2

MKNK2-210, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 2, humanhuman

TSL 2

Gene MKNK2, Length 454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK2-210ENST00000589534 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.66■■■■■ 8.1
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MKNK2-210ENST00000589534 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.97■■■■■ 6.39
MKNK2-210ENST00000589534 NACADO15069 1562 aa54.94■■■■■ 6.39
MKNK2-210ENST00000589534 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.79■■■■■ 6.36
MKNK2-210ENST00000589534 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.7■■■■■ 6.35
MKNK2-210ENST00000589534 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.65■■■■■ 6.34
MKNK2-210ENST00000589534 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.39■■■■■ 6.3
MKNK2-210ENST00000589534 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.59■■■■■ 6.17
MKNK2-210ENST00000589534 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.42■■■■■ 6.14
MKNK2-210ENST00000589534 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.33■■■■■ 6.13
MKNK2-210ENST00000589534 SCRIBQ14160 1630 aa53.11■■■■■ 6.09
MKNK2-210ENST00000589534 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.86■■■■■ 6.05
MKNK2-210ENST00000589534 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.66■■■■■ 6.02
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MKNK2-210ENST00000589534 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.68■■■■■ 5.86
MKNK2-210ENST00000589534 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.39■■■■■ 5.82
MKNK2-210ENST00000589534 SMARCA4P51532 1647 aa50.88■■■■■ 5.74
MKNK2-210ENST00000589534 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.86■■■■■ 5.73
MKNK2-210ENST00000589534 NCAPD3P42695 1498 aa50.78■■■■■ 5.72
MKNK2-210ENST00000589534 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.72■■■■■ 5.71
MKNK2-210ENST00000589534 SMARCA2P51531 1590 aa50.62■■■■■ 5.69
MKNK2-210ENST00000589534 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.55■■■■■ 5.68
MKNK2-210ENST00000589534 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.5■■■■■ 5.67
MKNK2-210ENST00000589534 HMGXB3Q12766 1538 aa50.41■■■■■ 5.66
MKNK2-210ENST00000589534 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
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MKNK2-210ENST00000589534 NESP48681 1621 aa49.42■■■■■ 5.5
MKNK2-210ENST00000589534 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.34■■■■■ 5.49
MKNK2-210ENST00000589534 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.26■■■■■ 5.48
MKNK2-210ENST00000589534 ERCC6Q03468 1493 aa49.23■■■■■ 5.47
MKNK2-210ENST00000589534 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.06■■■■■ 5.44
MKNK2-210ENST00000589534 CFTRP13569 1480 aa48.94■■■■■ 5.43
MKNK2-210ENST00000589534 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.93■■■■■ 5.42
MKNK2-210ENST00000589534 CUX2O14529 1486 aa48.86■■■■■ 5.41
MKNK2-210ENST00000589534 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.75■■■■■ 5.39
MKNK2-210ENST00000589534 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
MKNK2-210ENST00000589534 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.61■■■■■ 5.37
MKNK2-210ENST00000589534 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.56■■■■■ 5.36
MKNK2-210ENST00000589534 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.53■■■■■ 5.36
MKNK2-210ENST00000589534 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.5■■■■■ 5.35
MKNK2-210ENST00000589534 WDR62O43379 1518 aa48.35■■■■■ 5.33
MKNK2-210ENST00000589534 PRDM2Q13029 1718 aa48.35■■■■■ 5.33
MKNK2-210ENST00000589534 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.13■■■■■ 5.3
MKNK2-210ENST00000589534 ABCC8Q09428 1581 aa47.9■■■■■ 5.26
MKNK2-210ENST00000589534 TOPBP1Q92547 1522 aa47.82■■■■■ 5.25
MKNK2-210ENST00000589534 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.74■■■■■ 5.23
MKNK2-210ENST00000589534 IFT140Q96RY7 1462 aa47.58■■■■■ 5.21
MKNK2-210ENST00000589534 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.54■■■■■ 5.2
MKNK2-210ENST00000589534 CUX1P39880 1505 aa47.42■■■■■ 5.18
MKNK2-210ENST00000589534 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
MKNK2-210ENST00000589534 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
MKNK2-210ENST00000589534 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.31■■■■■ 5.16
MKNK2-210ENST00000589534 SOGA1O94964 1423 aa47.26■■■■■ 5.16
MKNK2-210ENST00000589534 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.26■■■■■ 5.16
MKNK2-210ENST00000589534 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.19■■■■■ 5.14
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MKNK2-210ENST00000589534 TOP2BQ02880 1626 aa47■■■■■ 5.11
MKNK2-210ENST00000589534 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.98■■■■■ 5.11
MKNK2-210ENST00000589534 WDR97A6NE52 1622 aa46.97■■■■■ 5.11
MKNK2-210ENST00000589534 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.96■■■■■ 5.11
MKNK2-210ENST00000589534 SYNJ1O43426 1573 aa46.93■■■■■ 5.1
MKNK2-210ENST00000589534 OSCARQ8IYS5 282 aa46.87■■■■■ 5.09
MKNK2-210ENST00000589534 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.87■■■■■ 5.09
MKNK2-210ENST00000589534 GRIN2BQ13224 1484 aa46.7■■■■■ 5.07
MKNK2-210ENST00000589534 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.69■■■■■ 5.06
MKNK2-210ENST00000589534 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.61■■■■■ 5.05
MKNK2-210ENST00000589534 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
MKNK2-210ENST00000589534 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.58■■■■■ 5.05
MKNK2-210ENST00000589534 FBLN2P98095 1184 aa46.46■■■■■ 5.03
MKNK2-210ENST00000589534 PBRM1Q86U86 1689 aa46.43■■■■■ 5.02
MKNK2-210ENST00000589534 CHD1O14646 1710 aa46.42■■■■■ 5.02
MKNK2-210ENST00000589534 SYNJ2O15056 1496 aa46.41■■■■■ 5.02
MKNK2-210ENST00000589534 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.41■■■■■ 5.02
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MKNK2-210ENST00000589534 KIF27Q86VH2 1401 aa46.15■■■■■ 4.98
MKNK2-210ENST00000589534 ADAMTS12P58397 1594 aa46.14■■■■■ 4.98
MKNK2-210ENST00000589534 GRIN2AQ12879 1464 aa46.07■■■■■ 4.97
MKNK2-210ENST00000589534 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.07■■■■■ 4.97
MKNK2-210ENST00000589534 IGF1RP08069 1367 aa46.06■■■■■ 4.96
MKNK2-210ENST00000589534 ARHGEF11O15085 1522 aa45.99■■■■■ 4.95
MKNK2-210ENST00000589534 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
MKNK2-210ENST00000589534 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
MKNK2-210ENST00000589534 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.96■■■■■ 4.95
MKNK2-210ENST00000589534 TRIM41Q8WV44 630 aa45.94■■■■■ 4.94
MKNK2-210ENST00000589534 NUP160Q12769 1436 aa45.94■■■■■ 4.94
MKNK2-210ENST00000589534 CEP170Q5SW79 1584 aa45.8■■■■■ 4.92
MKNK2-210ENST00000589534 CUL7Q14999 1698 aa45.77■■■■■ 4.92
MKNK2-210ENST00000589534 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.72■■■■■ 4.91
MKNK2-210ENST00000589534 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.67■■■■■ 4.9
MKNK2-210ENST00000589534 ARAP1Q96P48 1450 aa45.62■■■■■ 4.89
MKNK2-210ENST00000589534 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.62■■■■■ 4.89
MKNK2-210ENST00000589534 SHROOM2Q13796 1616 aa45.53■■■■■ 4.88
MKNK2-210ENST00000589534 JPH4Q96JJ6 628 aa45.5■■■■■ 4.87
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