RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466559.1

REPIN1-204, Transcript of replication initiator 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene REPIN1, Length 1,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1-204ENST00000466559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.3■■■■■ 7.88
REPIN1-204ENST00000466559 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.53■■■■■ 6.8
REPIN1-204ENST00000466559 ABCC9O60706 1549 aa57.02■■■■■ 6.72
REPIN1-204ENST00000466559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.55■■■■■ 6.32
REPIN1-204ENST00000466559 NACADO15069 1562 aa54.28■■■■■ 6.28
REPIN1-204ENST00000466559 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.16■■■■■ 6.26
REPIN1-204ENST00000466559 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.68■■■■■ 6.18
REPIN1-204ENST00000466559 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.39■■■■■ 6.14
REPIN1-204ENST00000466559 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.22■■■■■ 6.11
REPIN1-204ENST00000466559 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.17■■■■■ 6.1
REPIN1-204ENST00000466559 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.16■■■■■ 6.1
REPIN1-204ENST00000466559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.93■■■■■ 6.06
REPIN1-204ENST00000466559 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.82■■■■■ 6.05
REPIN1-204ENST00000466559 SCRIBQ14160 1630 aa52.43■■■■■ 5.98
REPIN1-204ENST00000466559 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.29■■■■■ 5.96
REPIN1-204ENST00000466559 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.54■■■■■ 5.84
REPIN1-204ENST00000466559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.53■■■■■ 5.84
REPIN1-204ENST00000466559 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.34■■■■■ 5.81
REPIN1-204ENST00000466559 NCAPD3P42695 1498 aa50.07■■■■■ 5.61
REPIN1-204ENST00000466559 SMARCA4P51532 1647 aa50.07■■■■■ 5.61
REPIN1-204ENST00000466559 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.98■■■■■ 5.59
REPIN1-204ENST00000466559 SMARCA2P51531 1590 aa49.93■■■■■ 5.58
REPIN1-204ENST00000466559 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.93■■■■■ 5.58
REPIN1-204ENST00000466559 HMGXB3Q12766 1538 aa49.76■■■■■ 5.56
REPIN1-204ENST00000466559 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.58■■■■■ 5.53
REPIN1-204ENST00000466559 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.56■■■■■ 5.52
REPIN1-204ENST00000466559 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.53■■■■■ 5.52
REPIN1-204ENST00000466559 ERCC6Q03468 1493 aa49.28■■■■■ 5.48
REPIN1-204ENST00000466559 NESP48681 1621 aa49.08■■■■■ 5.45
REPIN1-204ENST00000466559 CUX2O14529 1486 aa48.98■■■■■ 5.43
REPIN1-204ENST00000466559 WIZO95785 1651 aa48.97■■■■■ 5.43
REPIN1-204ENST00000466559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.9■■■■■ 5.42
REPIN1-204ENST00000466559 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.7■■■■■ 5.39
REPIN1-204ENST00000466559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.63■■■■■ 5.38
REPIN1-204ENST00000466559 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.59■■■■■ 5.37
REPIN1-204ENST00000466559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.5■■■■■ 5.35
REPIN1-204ENST00000466559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.5■■■■■ 5.35
REPIN1-204ENST00000466559 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.42■■■■■ 5.34
REPIN1-204ENST00000466559 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.34■■■■■ 5.33
REPIN1-204ENST00000466559 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.15■■■■■ 5.3
REPIN1-204ENST00000466559 CFTRP13569 1480 aa48.12■■■■■ 5.29
REPIN1-204ENST00000466559 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.08■■■■■ 5.29
REPIN1-204ENST00000466559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.04■■■■■ 5.28
REPIN1-204ENST00000466559 WDR62O43379 1518 aa47.98■■■■■ 5.27
REPIN1-204ENST00000466559 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.84■■■■■ 5.25
REPIN1-204ENST00000466559 PRDM2Q13029 1718 aa47.72■■■■■ 5.23
REPIN1-204ENST00000466559 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.57■■■■■ 5.21
REPIN1-204ENST00000466559 ABCC8Q09428 1581 aa47.19■■■■■ 5.14
REPIN1-204ENST00000466559 TOPBP1Q92547 1522 aa47.18■■■■■ 5.14
REPIN1-204ENST00000466559 IFT140Q96RY7 1462 aa47.09■■■■■ 5.13
REPIN1-204ENST00000466559 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.07■■■■■ 5.13
REPIN1-204ENST00000466559 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
REPIN1-204ENST00000466559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.89■■■■■ 5.1
REPIN1-204ENST00000466559 OSCARQ8IYS5 282 aa46.85■■■■■ 5.09
REPIN1-204ENST00000466559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.72■■■■■ 5.07
REPIN1-204ENST00000466559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
REPIN1-204ENST00000466559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
REPIN1-204ENST00000466559 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.56■■■■■ 5.042e-10■■■■■ 52.5
REPIN1-204ENST00000466559 SOGA1O94964 1423 aa46.55■■■■■ 5.04
REPIN1-204ENST00000466559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.52■■■■■ 5.04
REPIN1-204ENST00000466559 CUX1P39880 1505 aa46.52■■■■■ 5.04
REPIN1-204ENST00000466559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.51■■■■■ 5.04
REPIN1-204ENST00000466559 TRIM41Q8WV44 630 aa46.49■■■■■ 5.03
REPIN1-204ENST00000466559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.36■■■■■ 5.01
REPIN1-204ENST00000466559 WDR97A6NE52 1622 aa46.33■■■■■ 5.01
REPIN1-204ENST00000466559 FBLN2P98095 1184 aa46.26■■■■■ 5
REPIN1-204ENST00000466559 CHD1O14646 1710 aa46.25■■■■■ 5
REPIN1-204ENST00000466559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.12■■■■■ 4.97
REPIN1-204ENST00000466559 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.12■■■■■ 4.97
REPIN1-204ENST00000466559 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.12■■■■■ 4.97
REPIN1-204ENST00000466559 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.12■■■■■ 4.97
REPIN1-204ENST00000466559 GRIN2BQ13224 1484 aa46.1■■■■■ 4.97
REPIN1-204ENST00000466559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.06■■■■■ 4.96
REPIN1-204ENST00000466559 ARHGEF11O15085 1522 aa46.04■■■■■ 4.96
REPIN1-204ENST00000466559 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.02■■■■■ 4.96
REPIN1-204ENST00000466559 GAPVD1Q14C86 1478 aa46■■■■■ 4.95
REPIN1-204ENST00000466559 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.99■■■■■ 4.95
REPIN1-204ENST00000466559 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.99■■■■■ 4.957e-10■■■■■ 33.4
REPIN1-204ENST00000466559 TOP2BQ02880 1626 aa45.94■■■■■ 4.94
REPIN1-204ENST00000466559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.93■■■■■ 4.94
REPIN1-204ENST00000466559 PBRM1Q86U86 1689 aa45.93■■■■■ 4.94
REPIN1-204ENST00000466559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.88■■■■■ 4.94
REPIN1-204ENST00000466559 SYNJ2O15056 1496 aa45.88■■■■■ 4.94
REPIN1-204ENST00000466559 SYNJ1O43426 1573 aa45.86■■■■■ 4.93
REPIN1-204ENST00000466559 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.71■■■■■ 4.91
REPIN1-204ENST00000466559 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.71■■■■■ 4.91
REPIN1-204ENST00000466559 ARAP1Q96P48 1450 aa45.59■■■■■ 4.89
REPIN1-204ENST00000466559 ADAMTS12P58397 1594 aa45.51■■■■■ 4.88
REPIN1-204ENST00000466559 GRIN2AQ12879 1464 aa45.49■■■■■ 4.87
REPIN1-204ENST00000466559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
REPIN1-204ENST00000466559 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.44■■■■■ 4.87
REPIN1-204ENST00000466559 NUP160Q12769 1436 aa45.29■■■■■ 4.84
REPIN1-204ENST00000466559 CEP170Q5SW79 1584 aa45.26■■■■■ 4.84
REPIN1-204ENST00000466559 KIF27Q86VH2 1401 aa45.12■■■■■ 4.81
REPIN1-204ENST00000466559 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.1■■■■■ 4.81
REPIN1-204ENST00000466559 SHROOM2Q13796 1616 aa45.02■■■■■ 4.8
REPIN1-204ENST00000466559 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45■■■■■ 4.79
REPIN1-204ENST00000466559 IGF1RP08069 1367 aa44.96■■■■■ 4.79
REPIN1-204ENST00000466559 CUL7Q14999 1698 aa44.93■■■■■ 4.78
REPIN1-204ENST00000466559 JPH4Q96JJ6 628 aa44.87■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms