RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347755.9

PIDD1-201, Transcript of p53-induced death domain protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PIDD1, Length 2,998 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIDD1-201ENST00000347755 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.74■■■□□ 2.51
PIDD1-201ENST00000347755 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.75■■□□□ 1.87
PIDD1-201ENST00000347755 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.28■■□□□ 1.8
PIDD1-201ENST00000347755 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
PIDD1-201ENST00000347755 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PIDD1-201ENST00000347755 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.89■■□□□ 1.73
PIDD1-201ENST00000347755 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.14■■□□□ 1.62
PIDD1-201ENST00000347755 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.99■■□□□ 1.59
PIDD1-201ENST00000347755 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.93■■□□□ 1.58
PIDD1-201ENST00000347755 SCRIBQ14160 1630 aa24.7■■□□□ 1.54
PIDD1-201ENST00000347755 ABCC9O60706 1549 aa24.68■■□□□ 1.54
PIDD1-201ENST00000347755 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.65■■□□□ 1.54
PIDD1-201ENST00000347755 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.5■■□□□ 1.51
PIDD1-201ENST00000347755 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PIDD1-201ENST00000347755 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.34■■□□□ 1.49
PIDD1-201ENST00000347755 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
PIDD1-201ENST00000347755 TRIM41Q8WV44 630 aa24.24■■□□□ 1.47
PIDD1-201ENST00000347755 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.21■■□□□ 1.47
PIDD1-201ENST00000347755 HRCP23327 699 aa24.16■■□□□ 1.46
PIDD1-201ENST00000347755 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.15■■□□□ 1.46
PIDD1-201ENST00000347755 NACADO15069 1562 aa24.09■■□□□ 1.45
PIDD1-201ENST00000347755 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.02■■□□□ 1.44
PIDD1-201ENST00000347755 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PIDD1-201ENST00000347755 WIZO95785 1651 aa23.88■■□□□ 1.41
PIDD1-201ENST00000347755 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PIDD1-201ENST00000347755 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.41e-6■■■■□ 26.3
PIDD1-201ENST00000347755 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
PIDD1-201ENST00000347755 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PIDD1-201ENST00000347755 ABCC8Q09428 1581 aa23.44■■□□□ 1.34
PIDD1-201ENST00000347755 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.42■■□□□ 1.34
PIDD1-201ENST00000347755 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.41■■□□□ 1.34
PIDD1-201ENST00000347755 SMARCA4P51532 1647 aa23.4■■□□□ 1.34
PIDD1-201ENST00000347755 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PIDD1-201ENST00000347755 SMARCA2P51531 1590 aa23.26■■□□□ 1.31
PIDD1-201ENST00000347755 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PIDD1-201ENST00000347755 SOGA1O94964 1423 aa23.23■■□□□ 1.31
PIDD1-201ENST00000347755 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
PIDD1-201ENST00000347755 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.19■■□□□ 1.3
PIDD1-201ENST00000347755 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PIDD1-201ENST00000347755 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.14■■□□□ 1.29
PIDD1-201ENST00000347755 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.08■■□□□ 1.29
PIDD1-201ENST00000347755 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PIDD1-201ENST00000347755 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
PIDD1-201ENST00000347755 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PIDD1-201ENST00000347755 CEP162Q5TB80 1403 aa22.99■■□□□ 1.27
PIDD1-201ENST00000347755 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
PIDD1-201ENST00000347755 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.92■■□□□ 1.26
PIDD1-201ENST00000347755 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PIDD1-201ENST00000347755 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.85■■□□□ 1.25
PIDD1-201ENST00000347755 SYNJ1O43426 1573 aa22.79■■□□□ 1.24
PIDD1-201ENST00000347755 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.77■■□□□ 1.24
PIDD1-201ENST00000347755 EEA1Q15075 1411 aa22.74■■□□□ 1.23
PIDD1-201ENST00000347755 GOLGA3Q08378 1498 aa22.74■■□□□ 1.23
PIDD1-201ENST00000347755 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
PIDD1-201ENST00000347755 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.61■■□□□ 1.21
PIDD1-201ENST00000347755 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.6■■□□□ 1.21
PIDD1-201ENST00000347755 CLIP1P30622 1438 aa22.6■■□□□ 1.21
PIDD1-201ENST00000347755 APLP2Q06481 763 aa22.57■■□□□ 1.2
PIDD1-201ENST00000347755 KIF21BO75037 1637 aa22.42■■□□□ 1.18
PIDD1-201ENST00000347755 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PIDD1-201ENST00000347755 NCAPD3P42695 1498 aa22.39■■□□□ 1.18
PIDD1-201ENST00000347755 TOP2BQ02880 1626 aa22.39■■□□□ 1.17
PIDD1-201ENST00000347755 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.39■■□□□ 1.17
PIDD1-201ENST00000347755 CUX1P39880 1505 aa22.32■■□□□ 1.16
PIDD1-201ENST00000347755 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PIDD1-201ENST00000347755 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PIDD1-201ENST00000347755 HMGXB3Q12766 1538 aa22.27■■□□□ 1.16
PIDD1-201ENST00000347755 ITGAEP38570 1179 aa22.23■■□□□ 1.15
PIDD1-201ENST00000347755 KIF27Q86VH2 1401 aa22.23■■□□□ 1.15
PIDD1-201ENST00000347755 CFTRP13569 1480 aa22.23■■□□□ 1.15
PIDD1-201ENST00000347755 PRXQ9BXM0 1461 aa22.22■■□□□ 1.15
PIDD1-201ENST00000347755 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.22■■□□□ 1.15
PIDD1-201ENST00000347755 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PIDD1-201ENST00000347755 NEUROD1Q13562 356 aa22.17■■□□□ 1.14
PIDD1-201ENST00000347755 ARAP1Q96P48 1450 aa22.16■■□□□ 1.14
PIDD1-201ENST00000347755 P3H3Q8IVL6 736 aa22.14■■□□□ 1.14
PIDD1-201ENST00000347755 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PIDD1-201ENST00000347755 CUX2O14529 1486 aa22.14■■□□□ 1.13
PIDD1-201ENST00000347755 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PIDD1-201ENST00000347755 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.1■■□□□ 1.13
PIDD1-201ENST00000347755 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.07■■□□□ 1.12
PIDD1-201ENST00000347755 IGF1RP08069 1367 aa22.05■■□□□ 1.12
PIDD1-201ENST00000347755 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
PIDD1-201ENST00000347755 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22■■□□□ 1.11
PIDD1-201ENST00000347755 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22■■□□□ 1.11
PIDD1-201ENST00000347755 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.99■■□□□ 1.11
PIDD1-201ENST00000347755 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.99■■□□□ 1.11
PIDD1-201ENST00000347755 MIER1Q8N108 512 aa21.98■■□□□ 1.11
PIDD1-201ENST00000347755 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.94■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 NESP48681 1621 aa21.94■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.93■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.91■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.91■■□□□ 1.1
PIDD1-201ENST00000347755 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PIDD1-201ENST00000347755 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PIDD1-201ENST00000347755 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
PIDD1-201ENST00000347755 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PIDD1-201ENST00000347755 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.76■■□□□ 1.07
PIDD1-201ENST00000347755 PRDM2Q13029 1718 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms