RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597071.5

LTBP4-216, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene LTBP4, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-216ENST00000597071 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.42■■■□□ 2.78
LTBP4-216ENST00000597071 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.03■■■□□ 2.24
LTBP4-216ENST00000597071 ABCC9O60706 1549 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBP4-216ENST00000597071 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
LTBP4-216ENST00000597071 NACADO15069 1562 aa27.33■■□□□ 1.97
LTBP4-216ENST00000597071 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.1■■□□□ 1.93
LTBP4-216ENST00000597071 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.05■■□□□ 1.92
LTBP4-216ENST00000597071 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
LTBP4-216ENST00000597071 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.85■■□□□ 1.89
LTBP4-216ENST00000597071 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.85■■□□□ 1.89
LTBP4-216ENST00000597071 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.64■■□□□ 1.86
LTBP4-216ENST00000597071 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
LTBP4-216ENST00000597071 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.53■■□□□ 1.84
LTBP4-216ENST00000597071 SCRIBQ14160 1630 aa26.41■■□□□ 1.82
LTBP4-216ENST00000597071 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.36■■□□□ 1.81
LTBP4-216ENST00000597071 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
LTBP4-216ENST00000597071 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.92■■□□□ 1.74
LTBP4-216ENST00000597071 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.77■■□□□ 1.72
LTBP4-216ENST00000597071 SMARCA4P51532 1647 aa25.25■■□□□ 1.63
LTBP4-216ENST00000597071 NCAPD3P42695 1498 aa25.21■■□□□ 1.63
LTBP4-216ENST00000597071 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.17■■□□□ 1.62
LTBP4-216ENST00000597071 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LTBP4-216ENST00000597071 SMARCA2P51531 1590 aa25.14■■□□□ 1.61
LTBP4-216ENST00000597071 HMGXB3Q12766 1538 aa25.09■■□□□ 1.61
LTBP4-216ENST00000597071 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.03■■□□□ 1.6
LTBP4-216ENST00000597071 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.97■■□□□ 1.59
LTBP4-216ENST00000597071 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
LTBP4-216ENST00000597071 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.75■■□□□ 1.55
LTBP4-216ENST00000597071 ERCC6Q03468 1493 aa24.7■■□□□ 1.54
LTBP4-216ENST00000597071 WIZO95785 1651 aa24.69■■□□□ 1.54
LTBP4-216ENST00000597071 NESP48681 1621 aa24.68■■□□□ 1.54
LTBP4-216ENST00000597071 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.62■■□□□ 1.53
LTBP4-216ENST00000597071 CUX2O14529 1486 aa24.6■■□□□ 1.53
LTBP4-216ENST00000597071 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LTBP4-216ENST00000597071 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LTBP4-216ENST00000597071 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LTBP4-216ENST00000597071 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBP4-216ENST00000597071 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.43■■□□□ 1.5
LTBP4-216ENST00000597071 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.42■■□□□ 1.5
LTBP4-216ENST00000597071 CFTRP13569 1480 aa24.25■■□□□ 1.47
LTBP4-216ENST00000597071 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.21■■□□□ 1.47
LTBP4-216ENST00000597071 WDR62O43379 1518 aa24.18■■□□□ 1.46
LTBP4-216ENST00000597071 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.18■■□□□ 1.46
LTBP4-216ENST00000597071 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.17■■□□□ 1.46
LTBP4-216ENST00000597071 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.1■■□□□ 1.45
LTBP4-216ENST00000597071 PRDM2Q13029 1718 aa24.1■■□□□ 1.45
LTBP4-216ENST00000597071 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
LTBP4-216ENST00000597071 TOPBP1Q92547 1522 aa23.75■■□□□ 1.39
LTBP4-216ENST00000597071 ABCC8Q09428 1581 aa23.72■■□□□ 1.39
LTBP4-216ENST00000597071 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.72■■□□□ 1.39
LTBP4-216ENST00000597071 IFT140Q96RY7 1462 aa23.68■■□□□ 1.38
LTBP4-216ENST00000597071 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
LTBP4-216ENST00000597071 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
LTBP4-216ENST00000597071 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
LTBP4-216ENST00000597071 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
LTBP4-216ENST00000597071 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
LTBP4-216ENST00000597071 CUX1P39880 1505 aa23.46■■□□□ 1.35
LTBP4-216ENST00000597071 TRIM41Q8WV44 630 aa23.44■■□□□ 1.34
LTBP4-216ENST00000597071 OSCARQ8IYS5 282 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBP4-216ENST00000597071 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.42■■□□□ 1.34
LTBP4-216ENST00000597071 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.4■■□□□ 1.34
LTBP4-216ENST00000597071 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.344e-9■■□□□ 13.9
LTBP4-216ENST00000597071 SOGA1O94964 1423 aa23.38■■□□□ 1.33
LTBP4-216ENST00000597071 WDR97A6NE52 1622 aa23.37■■□□□ 1.33
LTBP4-216ENST00000597071 CHD1O14646 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
LTBP4-216ENST00000597071 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LTBP4-216ENST00000597071 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.21■■□□□ 1.31
LTBP4-216ENST00000597071 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.2■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.19■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 GRIN2BQ13224 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 TOP2BQ02880 1626 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.18■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.16■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 PBRM1Q86U86 1689 aa23.16■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 SYNJ1O43426 1573 aa23.15■■□□□ 1.3
LTBP4-216ENST00000597071 ARHGEF11O15085 1522 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBP4-216ENST00000597071 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.13■■□□□ 1.29
LTBP4-216ENST00000597071 FBLN2P98095 1184 aa23.1■■□□□ 1.29
LTBP4-216ENST00000597071 SYNJ2O15056 1496 aa23.08■■□□□ 1.29
LTBP4-216ENST00000597071 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.04■■□□□ 1.28
LTBP4-216ENST00000597071 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LTBP4-216ENST00000597071 ADAMTS12P58397 1594 aa22.97■■□□□ 1.27
LTBP4-216ENST00000597071 ARAP1Q96P48 1450 aa22.93■■□□□ 1.26
LTBP4-216ENST00000597071 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.92■■□□□ 1.26
LTBP4-216ENST00000597071 GRIN2AQ12879 1464 aa22.9■■□□□ 1.26
LTBP4-216ENST00000597071 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.86■■□□□ 1.25
LTBP4-216ENST00000597071 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.83■■□□□ 1.25
LTBP4-216ENST00000597071 NUP160Q12769 1436 aa22.82■■□□□ 1.24
LTBP4-216ENST00000597071 CEP170Q5SW79 1584 aa22.81■■□□□ 1.24
LTBP4-216ENST00000597071 SHROOM2Q13796 1616 aa22.71■■□□□ 1.23
LTBP4-216ENST00000597071 KIF27Q86VH2 1401 aa22.7■■□□□ 1.22
LTBP4-216ENST00000597071 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.67■■□□□ 1.22
LTBP4-216ENST00000597071 CUL7Q14999 1698 aa22.65■■□□□ 1.22
LTBP4-216ENST00000597071 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.64■■□□□ 1.21
LTBP4-216ENST00000597071 IGF1RP08069 1367 aa22.63■■□□□ 1.21
LTBP4-216ENST00000597071 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms