RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.21■■■■■ 5.47
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.96■■■■■ 4.63
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC9O60706 1549 aa43.75■■■■■ 4.59
LTBP4-232ENST00000610893 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.78■■■■■ 4.28
LTBP4-232ENST00000610893 NACADO15069 1562 aa41.59■■■■■ 4.25
LTBP4-232ENST00000610893 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.51■■■■■ 4.24
LTBP4-232ENST00000610893 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.17■■■■■ 4.18
LTBP4-232ENST00000610893 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.87■■■■■ 4.13
LTBP4-232ENST00000610893 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.84■■■■■ 4.13
LTBP4-232ENST00000610893 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
LTBP4-232ENST00000610893 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.71■■■■■ 4.11
LTBP4-232ENST00000610893 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.64■■■■■ 4.1
LTBP4-232ENST00000610893 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.5■■■■■ 4.07
LTBP4-232ENST00000610893 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.11■■■■■ 4.01
LTBP4-232ENST00000610893 SCRIBQ14160 1630 aa40.04■■■■■ 4
LTBP4-232ENST00000610893 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
LTBP4-232ENST00000610893 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.5■■■■□ 3.91
LTBP4-232ENST00000610893 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.43■■■■□ 3.9
LTBP4-232ENST00000610893 NCAPD3P42695 1498 aa38.45■■■■□ 3.75
LTBP4-232ENST00000610893 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.32■■■■□ 3.72
LTBP4-232ENST00000610893 SMARCA4P51532 1647 aa38.27■■■■□ 3.72
LTBP4-232ENST00000610893 SMARCA2P51531 1590 aa38.22■■■■□ 3.71
LTBP4-232ENST00000610893 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.19■■■■□ 3.7
LTBP4-232ENST00000610893 HMGXB3Q12766 1538 aa38.11■■■■□ 3.69
LTBP4-232ENST00000610893 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.95■■■■□ 3.67
LTBP4-232ENST00000610893 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.95■■■■□ 3.67
LTBP4-232ENST00000610893 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.89■■■■□ 3.66
LTBP4-232ENST00000610893 ERCC6Q03468 1493 aa37.79■■■■□ 3.64
LTBP4-232ENST00000610893 CUX2O14529 1486 aa37.65■■■■□ 3.62
LTBP4-232ENST00000610893 NESP48681 1621 aa37.64■■■■□ 3.62
LTBP4-232ENST00000610893 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.46■■■■□ 3.59
LTBP4-232ENST00000610893 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.41■■■■□ 3.58
LTBP4-232ENST00000610893 WIZO95785 1651 aa37.38■■■■□ 3.57
LTBP4-232ENST00000610893 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.33■■■■□ 3.57
LTBP4-232ENST00000610893 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.3■■■■□ 3.56
LTBP4-232ENST00000610893 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
LTBP4-232ENST00000610893 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
LTBP4-232ENST00000610893 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.06■■■■□ 3.52
LTBP4-232ENST00000610893 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
LTBP4-232ENST00000610893 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.91■■■■□ 3.5
LTBP4-232ENST00000610893 CFTRP13569 1480 aa36.9■■■■□ 3.5
LTBP4-232ENST00000610893 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.82■■■■□ 3.48
LTBP4-232ENST00000610893 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.81■■■■□ 3.48
LTBP4-232ENST00000610893 WDR62O43379 1518 aa36.78■■■■□ 3.48
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.62■■■■□ 3.45
LTBP4-232ENST00000610893 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
LTBP4-232ENST00000610893 PRDM2Q13029 1718 aa36.34■■■■□ 3.41
LTBP4-232ENST00000610893 ABCC8Q09428 1581 aa36.16■■■■□ 3.38
LTBP4-232ENST00000610893 TOPBP1Q92547 1522 aa36.13■■■■□ 3.37
LTBP4-232ENST00000610893 IFT140Q96RY7 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
LTBP4-232ENST00000610893 OSCARQ8IYS5 282 aa36.09■■■■□ 3.37
LTBP4-232ENST00000610893 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36■■■■□ 3.35
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
LTBP4-232ENST00000610893 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
LTBP4-232ENST00000610893 TRIM41Q8WV44 630 aa35.8■■■■□ 3.32
LTBP4-232ENST00000610893 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
LTBP4-232ENST00000610893 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
LTBP4-232ENST00000610893 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.312e-9■■□□□ 14.4
LTBP4-232ENST00000610893 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
LTBP4-232ENST00000610893 SOGA1O94964 1423 aa35.69■■■■□ 3.3
LTBP4-232ENST00000610893 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.63■■■■□ 3.29
LTBP4-232ENST00000610893 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.58■■■■□ 3.29
LTBP4-232ENST00000610893 CUX1P39880 1505 aa35.57■■■■□ 3.29
LTBP4-232ENST00000610893 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
LTBP4-232ENST00000610893 FBLN2P98095 1184 aa35.48■■■■□ 3.27
LTBP4-232ENST00000610893 WDR97A6NE52 1622 aa35.45■■■■□ 3.27
LTBP4-232ENST00000610893 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.37■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.37■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.37■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGEF11O15085 1522 aa35.35■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 CHD1O14646 1710 aa35.34■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 GRIN2BQ13224 1484 aa35.33■■■■□ 3.25
LTBP4-232ENST00000610893 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.31■■■■□ 3.24
LTBP4-232ENST00000610893 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
LTBP4-232ENST00000610893 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
LTBP4-232ENST00000610893 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.23■■■■□ 3.23
LTBP4-232ENST00000610893 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
LTBP4-232ENST00000610893 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
LTBP4-232ENST00000610893 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.18■■■■□ 3.22
LTBP4-232ENST00000610893 SYNJ2O15056 1496 aa35.16■■■■□ 3.22
LTBP4-232ENST00000610893 TOP2BQ02880 1626 aa35.08■■■■□ 3.21
LTBP4-232ENST00000610893 SYNJ1O43426 1573 aa35.08■■■■□ 3.21
LTBP4-232ENST00000610893 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.06■■■■□ 3.2
LTBP4-232ENST00000610893 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.04■■■■□ 3.2
LTBP4-232ENST00000610893 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.04■■■■□ 3.2
LTBP4-232ENST00000610893 PBRM1Q86U86 1689 aa35.02■■■■□ 3.2
LTBP4-232ENST00000610893 ARAP1Q96P48 1450 aa35.01■■■■□ 3.19
LTBP4-232ENST00000610893 GRIN2AQ12879 1464 aa34.84■■■■□ 3.17
LTBP4-232ENST00000610893 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.82■■■■□ 3.17
LTBP4-232ENST00000610893 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.79■■■■□ 3.16
LTBP4-232ENST00000610893 ADAMTS12P58397 1594 aa34.78■■■■□ 3.16
LTBP4-232ENST00000610893 NUP160Q12769 1436 aa34.73■■■■□ 3.15
LTBP4-232ENST00000610893 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
LTBP4-232ENST00000610893 CEP170Q5SW79 1584 aa34.63■■■■□ 3.13
LTBP4-232ENST00000610893 KIF27Q86VH2 1401 aa34.51■■■■□ 3.12
LTBP4-232ENST00000610893 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.48■■■■□ 3.11
LTBP4-232ENST00000610893 IGF1RP08069 1367 aa34.48■■■■□ 3.11
LTBP4-232ENST00000610893 JPH4Q96JJ6 628 aa34.47■■■■□ 3.11
LTBP4-232ENST00000610893 SHROOM2Q13796 1616 aa34.47■■■■□ 3.11
LTBP4-232ENST00000610893 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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