RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411829.6

PIDD1-202, Transcript of p53-induced death domain protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PIDD1, Length 2,886 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIDD1-202ENST00000411829 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.69■■■□□ 2.66
PIDD1-202ENST00000411829 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.46■■□□□ 1.99
PIDD1-202ENST00000411829 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27■■□□□ 1.91
PIDD1-202ENST00000411829 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
PIDD1-202ENST00000411829 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.75■■□□□ 1.87
PIDD1-202ENST00000411829 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PIDD1-202ENST00000411829 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.85■■□□□ 1.73
PIDD1-202ENST00000411829 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.74■■□□□ 1.71
PIDD1-202ENST00000411829 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.67■■□□□ 1.7
PIDD1-202ENST00000411829 SCRIBQ14160 1630 aa25.45■■□□□ 1.66
PIDD1-202ENST00000411829 ABCC9O60706 1549 aa25.42■■□□□ 1.66
PIDD1-202ENST00000411829 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.3■■□□□ 1.64
PIDD1-202ENST00000411829 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PIDD1-202ENST00000411829 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.12■■□□□ 1.61
PIDD1-202ENST00000411829 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
PIDD1-202ENST00000411829 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.95■■□□□ 1.58
PIDD1-202ENST00000411829 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.93■■□□□ 1.58
PIDD1-202ENST00000411829 TRIM41Q8WV44 630 aa24.91■■□□□ 1.58
PIDD1-202ENST00000411829 NACADO15069 1562 aa24.87■■□□□ 1.57
PIDD1-202ENST00000411829 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.86■■□□□ 1.57
PIDD1-202ENST00000411829 HRCP23327 699 aa24.8■■□□□ 1.56
PIDD1-202ENST00000411829 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.74■■□□□ 1.55
PIDD1-202ENST00000411829 WIZO95785 1651 aa24.61■■□□□ 1.53
PIDD1-202ENST00000411829 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
PIDD1-202ENST00000411829 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.47■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 26.3
PIDD1-202ENST00000411829 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
PIDD1-202ENST00000411829 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
PIDD1-202ENST00000411829 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.21■■□□□ 1.47
PIDD1-202ENST00000411829 SMARCA4P51532 1647 aa24.13■■□□□ 1.45
PIDD1-202ENST00000411829 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.12■■□□□ 1.45
PIDD1-202ENST00000411829 ABCC8Q09428 1581 aa24.11■■□□□ 1.45
PIDD1-202ENST00000411829 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PIDD1-202ENST00000411829 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PIDD1-202ENST00000411829 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
PIDD1-202ENST00000411829 SMARCA2P51531 1590 aa23.97■■□□□ 1.43
PIDD1-202ENST00000411829 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
PIDD1-202ENST00000411829 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.93■■□□□ 1.42
PIDD1-202ENST00000411829 SOGA1O94964 1423 aa23.89■■□□□ 1.41
PIDD1-202ENST00000411829 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PIDD1-202ENST00000411829 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.8■■□□□ 1.4
PIDD1-202ENST00000411829 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.74■■□□□ 1.39
PIDD1-202ENST00000411829 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PIDD1-202ENST00000411829 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
PIDD1-202ENST00000411829 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
PIDD1-202ENST00000411829 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PIDD1-202ENST00000411829 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
PIDD1-202ENST00000411829 CEP162Q5TB80 1403 aa23.63■■□□□ 1.37
PIDD1-202ENST00000411829 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.62■■□□□ 1.37
PIDD1-202ENST00000411829 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
PIDD1-202ENST00000411829 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
PIDD1-202ENST00000411829 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.51■■□□□ 1.35
PIDD1-202ENST00000411829 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.5■■□□□ 1.35
PIDD1-202ENST00000411829 SYNJ1O43426 1573 aa23.48■■□□□ 1.35
PIDD1-202ENST00000411829 EEA1Q15075 1411 aa23.43■■□□□ 1.34
PIDD1-202ENST00000411829 GOLGA3Q08378 1498 aa23.4■■□□□ 1.34
PIDD1-202ENST00000411829 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PIDD1-202ENST00000411829 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.26■■□□□ 1.31
PIDD1-202ENST00000411829 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.25■■□□□ 1.31
PIDD1-202ENST00000411829 CLIP1P30622 1438 aa23.24■■□□□ 1.31
PIDD1-202ENST00000411829 APLP2Q06481 763 aa23.2■■□□□ 1.3
PIDD1-202ENST00000411829 MYT1Q01538 1121 aa23.15■■□□□ 1.3
PIDD1-202ENST00000411829 KIF21BO75037 1637 aa23.1■■□□□ 1.29
PIDD1-202ENST00000411829 NCAPD3P42695 1498 aa23.1■■□□□ 1.29
PIDD1-202ENST00000411829 TOP2BQ02880 1626 aa23.08■■□□□ 1.29
PIDD1-202ENST00000411829 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.03■■□□□ 1.28
PIDD1-202ENST00000411829 CUX1P39880 1505 aa23■■□□□ 1.27
PIDD1-202ENST00000411829 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PIDD1-202ENST00000411829 HMGXB3Q12766 1538 aa22.98■■□□□ 1.27
PIDD1-202ENST00000411829 NEUROD1Q13562 356 aa22.95■■□□□ 1.27
PIDD1-202ENST00000411829 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PIDD1-202ENST00000411829 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.93■■□□□ 1.26
PIDD1-202ENST00000411829 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PIDD1-202ENST00000411829 CFTRP13569 1480 aa22.91■■□□□ 1.26
PIDD1-202ENST00000411829 KIF27Q86VH2 1401 aa22.89■■□□□ 1.26
PIDD1-202ENST00000411829 PRXQ9BXM0 1461 aa22.88■■□□□ 1.25
PIDD1-202ENST00000411829 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.84■■□□□ 1.25
PIDD1-202ENST00000411829 ITGAEP38570 1179 aa22.82■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 ARAP1Q96P48 1450 aa22.79■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 CUX2O14529 1486 aa22.78■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.77■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PIDD1-202ENST00000411829 P3H3Q8IVL6 736 aa22.75■■□□□ 1.23
PIDD1-202ENST00000411829 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.75■■□□□ 1.23
PIDD1-202ENST00000411829 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PIDD1-202ENST00000411829 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.71■■□□□ 1.23
PIDD1-202ENST00000411829 IGF1RP08069 1367 aa22.7■■□□□ 1.23
PIDD1-202ENST00000411829 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
PIDD1-202ENST00000411829 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.66■■□□□ 1.22
PIDD1-202ENST00000411829 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
PIDD1-202ENST00000411829 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.63■■□□□ 1.21
PIDD1-202ENST00000411829 NESP48681 1621 aa22.6■■□□□ 1.21
PIDD1-202ENST00000411829 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.57■■□□□ 1.2
PIDD1-202ENST00000411829 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.56■■□□□ 1.2
PIDD1-202ENST00000411829 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PIDD1-202ENST00000411829 MIER1Q8N108 512 aa22.55■■□□□ 1.2
PIDD1-202ENST00000411829 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PIDD1-202ENST00000411829 PRDM2Q13029 1718 aa22.5■■□□□ 1.19
PIDD1-202ENST00000411829 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.47■■□□□ 1.19
PIDD1-202ENST00000411829 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms