Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 214.6□□□□□ -0.074e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.594e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.134e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.596e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CALR-202ENST00000586760 913 ntTSL 211.34□□□□□ -0.593e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 NDRG1-213ENST00000519580 550 ntTSL 512.25□□□□□ -0.454e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 510.74□□□□□ -0.694e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 39.5□□□□□ -0.897e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.279e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-210ENST00000586944 4661 ntTSL 217.7■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 PTBP1-213ENST00000587191 357 ntTSL 511.08□□□□□ -0.642e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RPL38-205ENST00000530646 2450 ntTSL 1 (best)19.25■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 11.5
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PRPF4O43172 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.53e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.623e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RPL38-204ENST00000529123 576 ntTSL 210.1□□□□□ -0.793e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RPL38-207ENST00000534490 429 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.833e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.683e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 SLC16A3-220ENST00000584781 562 ntTSL 421.58■■□□□ 1.051e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 SLC16A3-208ENST00000579572 863 ntTSL 319.16■□□□□ 0.661e-7■■□□□ 11.5
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PRPF4O43172 SLC16A3-203ENST00000577650 545 ntTSL 316.04■□□□□ 0.161e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 TAF15-206ENST00000603967 656 ntTSL 316.17■□□□□ 0.182e-10■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 ERICH1-209ENST00000523415 3630 ntTSL 28.48□□□□□ -1.058e-7■■□□□ 11.5
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PRPF4O43172 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-10■■□□□ 11.5
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PRPF4O43172 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.951e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 SLC16A3-213ENST00000582715 279 ntTSL 514.52□□□□□ -0.091e-7■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.723e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 224■■□□□ 1.432e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.22e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 218.24■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 312.09□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-225ENST00000622850 1987 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-6■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 527.01■■□□□ 1.915e-13■■□□□ 11.5
PRPF4O43172 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 524.95■■□□□ 1.585e-13■■□□□ 11.5
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