RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.73■■■■■ 5.55
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.39■■■■■ 4.7
SCAF8-204ENST00000461219 ABCC9O60706 1549 aa43.53■■■■■ 4.56
SCAF8-204ENST00000461219 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.85■■■■■ 4.29
SCAF8-204ENST00000461219 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.81■■■■■ 4.28
SCAF8-204ENST00000461219 NACADO15069 1562 aa41.71■■■■■ 4.27
SCAF8-204ENST00000461219 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
SCAF8-204ENST00000461219 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.3■■■■■ 4.2
SCAF8-204ENST00000461219 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.09■■■■■ 4.17
SCAF8-204ENST00000461219 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.96■■■■■ 4.15
SCAF8-204ENST00000461219 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
SCAF8-204ENST00000461219 SCRIBQ14160 1630 aa40.52■■■■■ 4.08
SCAF8-204ENST00000461219 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.44■■■■■ 4.06
SCAF8-204ENST00000461219 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.05■■■■■ 4
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.91■■■■□ 3.98
SCAF8-204ENST00000461219 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
SCAF8-204ENST00000461219 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.39■■■■□ 3.9
SCAF8-204ENST00000461219 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.12■■■■□ 3.85
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCA4P51532 1647 aa38.68■■■■□ 3.78
SCAF8-204ENST00000461219 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.62■■■■□ 3.77
SCAF8-204ENST00000461219 SMARCA2P51531 1590 aa38.47■■■■□ 3.75
SCAF8-204ENST00000461219 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.43■■■■□ 3.74
SCAF8-204ENST00000461219 NCAPD3P42695 1498 aa38.39■■■■□ 3.74
SCAF8-204ENST00000461219 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.31■■■■□ 3.72
SCAF8-204ENST00000461219 HMGXB3Q12766 1538 aa38.27■■■■□ 3.72
SCAF8-204ENST00000461219 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.21■■■■□ 3.71
SCAF8-204ENST00000461219 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
SCAF8-204ENST00000461219 WIZO95785 1651 aa37.99■■■■□ 3.67
SCAF8-204ENST00000461219 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
SCAF8-204ENST00000461219 ERCC6Q03468 1493 aa37.64■■■■□ 3.62
SCAF8-204ENST00000461219 NESP48681 1621 aa37.58■■■■□ 3.61
SCAF8-204ENST00000461219 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
SCAF8-204ENST00000461219 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.53■■■■□ 3.6
SCAF8-204ENST00000461219 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
SCAF8-204ENST00000461219 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.27■■■■□ 3.56
SCAF8-204ENST00000461219 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.27■■■■□ 3.56
SCAF8-204ENST00000461219 CUX2O14529 1486 aa37.17■■■■□ 3.54
SCAF8-204ENST00000461219 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.07■■■■□ 3.52
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.06■■■■□ 3.52
SCAF8-204ENST00000461219 CFTRP13569 1480 aa37.03■■■■□ 3.52
SCAF8-204ENST00000461219 PRDM2Q13029 1718 aa37■■■■□ 3.51
SCAF8-204ENST00000461219 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.94■■■■□ 3.5
SCAF8-204ENST00000461219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.94■■■■□ 3.5
SCAF8-204ENST00000461219 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
SCAF8-204ENST00000461219 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.88■■■■□ 3.5
SCAF8-204ENST00000461219 WDR62O43379 1518 aa36.74■■■■□ 3.47
SCAF8-204ENST00000461219 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
SCAF8-204ENST00000461219 ABCC8Q09428 1581 aa36.36■■■■□ 3.41
SCAF8-204ENST00000461219 TOPBP1Q92547 1522 aa36.32■■■■□ 3.4
SCAF8-204ENST00000461219 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.31■■■■□ 3.4
SCAF8-204ENST00000461219 IFT140Q96RY7 1462 aa36.13■■■■□ 3.37
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.13■■■■□ 3.37
SCAF8-204ENST00000461219 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
SCAF8-204ENST00000461219 CUX1P39880 1505 aa35.97■■■■□ 3.35
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SCAF8-204ENST00000461219 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
SCAF8-204ENST00000461219 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.91■■■■□ 3.34
SCAF8-204ENST00000461219 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
SCAF8-204ENST00000461219 SOGA1O94964 1423 aa35.87■■■■□ 3.33
SCAF8-204ENST00000461219 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.84■■■■□ 3.33
SCAF8-204ENST00000461219 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.74■■■■□ 3.314e-15■■■■■ 47.2
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SCAF8-204ENST00000461219 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.69■■■■□ 3.3
SCAF8-204ENST00000461219 WDR97A6NE52 1622 aa35.68■■■■□ 3.3
SCAF8-204ENST00000461219 TOP2BQ02880 1626 aa35.67■■■■□ 3.3
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
SCAF8-204ENST00000461219 SYNJ1O43426 1573 aa35.64■■■■□ 3.3
SCAF8-204ENST00000461219 OSCARQ8IYS5 282 aa35.63■■■■□ 3.29
SCAF8-204ENST00000461219 CHD1O14646 1710 aa35.54■■■■□ 3.28
SCAF8-204ENST00000461219 PBRM1Q86U86 1689 aa35.52■■■■□ 3.28
SCAF8-204ENST00000461219 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.52■■■■□ 3.28
SCAF8-204ENST00000461219 FBLN2P98095 1184 aa35.5■■■■□ 3.27
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN2BQ13224 1484 aa35.47■■■■□ 3.27
SCAF8-204ENST00000461219 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.47■■■■□ 3.27
SCAF8-204ENST00000461219 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.45■■■■□ 3.27
SCAF8-204ENST00000461219 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.43■■■■□ 3.26
SCAF8-204ENST00000461219 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
SCAF8-204ENST00000461219 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
SCAF8-204ENST00000461219 SYNJ2O15056 1496 aa35.25■■■■□ 3.23
SCAF8-204ENST00000461219 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.13■■■■□ 3.21
SCAF8-204ENST00000461219 ADAMTS12P58397 1594 aa35.12■■■■□ 3.21
SCAF8-204ENST00000461219 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
SCAF8-204ENST00000461219 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
SCAF8-204ENST00000461219 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.1■■■■□ 3.21
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM41Q8WV44 630 aa35.07■■■■□ 3.2
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGEF11O15085 1522 aa35.03■■■■□ 3.2
SCAF8-204ENST00000461219 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.03■■■■□ 3.2
SCAF8-204ENST00000461219 KIF27Q86VH2 1401 aa35.02■■■■□ 3.2
SCAF8-204ENST00000461219 GRIN2AQ12879 1464 aa35■■■■□ 3.19
SCAF8-204ENST00000461219 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.99■■■■□ 3.19
SCAF8-204ENST00000461219 CUL7Q14999 1698 aa34.88■■■■□ 3.17
SCAF8-204ENST00000461219 CEP170Q5SW79 1584 aa34.83■■■■□ 3.17
SCAF8-204ENST00000461219 NUP160Q12769 1436 aa34.78■■■■□ 3.16
SCAF8-204ENST00000461219 IGF1RP08069 1367 aa34.77■■■■□ 3.16
SCAF8-204ENST00000461219 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.76■■■■□ 3.16
SCAF8-204ENST00000461219 ARAP1Q96P48 1450 aa34.71■■■■□ 3.15
SCAF8-204ENST00000461219 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.65■■■■□ 3.14
SCAF8-204ENST00000461219 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.6■■■■□ 3.13
SCAF8-204ENST00000461219 SHROOM2Q13796 1616 aa34.59■■■■□ 3.13
SCAF8-204ENST00000461219 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.5■■■■□ 3.11
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