RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578528.1

RPL17-201, Transcript of ribosomal protein L17, humanhuman

TSL 3

Gene RPL17, Length 481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-201ENST00000578528 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
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RPL17-201ENST00000578528 ABCC9O60706 1549 aa47.3■■■■■ 5.16
RPL17-201ENST00000578528 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
RPL17-201ENST00000578528 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.12■■■■■ 4.97
RPL17-201ENST00000578528 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.07■■■■■ 4.97
RPL17-201ENST00000578528 NACADO15069 1562 aa46.04■■■■■ 4.96
RPL17-201ENST00000578528 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.98■■■■■ 4.95
RPL17-201ENST00000578528 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.89■■■■■ 4.94
RPL17-201ENST00000578528 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
RPL17-201ENST00000578528 SCRIBQ14160 1630 aa44.83■■■■■ 4.77
RPL17-201ENST00000578528 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.51■■■■■ 4.72
RPL17-201ENST00000578528 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.28■■■■■ 4.68
RPL17-201ENST00000578528 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.21■■■■■ 4.67
RPL17-201ENST00000578528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
RPL17-201ENST00000578528 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.21■■■■■ 4.51
RPL17-201ENST00000578528 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
RPL17-201ENST00000578528 SMARCA4P51532 1647 aa43■■■■■ 4.47
RPL17-201ENST00000578528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.87■■■■■ 4.45
RPL17-201ENST00000578528 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.86■■■■■ 4.45
RPL17-201ENST00000578528 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.76■■■■■ 4.44
RPL17-201ENST00000578528 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.63■■■■■ 4.41
RPL17-201ENST00000578528 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.41
RPL17-201ENST00000578528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.58■■■■■ 4.41
RPL17-201ENST00000578528 SMARCA2P51531 1590 aa42.57■■■■■ 4.41
RPL17-201ENST00000578528 NCAPD3P42695 1498 aa42.48■■■■■ 4.39
RPL17-201ENST00000578528 WIZO95785 1651 aa42.43■■■■■ 4.38
RPL17-201ENST00000578528 HMGXB3Q12766 1538 aa42.34■■■■■ 4.37
RPL17-201ENST00000578528 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
RPL17-201ENST00000578528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
RPL17-201ENST00000578528 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
RPL17-201ENST00000578528 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.52■■■■■ 4.24
RPL17-201ENST00000578528 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.24■■■■■ 4.19
RPL17-201ENST00000578528 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.23■■■■■ 4.19
RPL17-201ENST00000578528 CFTRP13569 1480 aa41.17■■■■■ 4.18
RPL17-201ENST00000578528 NESP48681 1621 aa41.16■■■■■ 4.18
RPL17-201ENST00000578528 PRDM2Q13029 1718 aa40.96■■■■■ 4.15
RPL17-201ENST00000578528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.89■■■■■ 4.14
RPL17-201ENST00000578528 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.75■■■■■ 4.11
RPL17-201ENST00000578528 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.73■■■■■ 4.11
RPL17-201ENST00000578528 ERCC6Q03468 1493 aa40.7■■■■■ 4.11
RPL17-201ENST00000578528 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.64■■■■■ 4.1
RPL17-201ENST00000578528 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
RPL17-201ENST00000578528 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.44■■■■■ 4.06
RPL17-201ENST00000578528 WDR62O43379 1518 aa40.32■■■■■ 4.04
RPL17-201ENST00000578528 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
RPL17-201ENST00000578528 ABCC8Q09428 1581 aa40.26■■■■■ 4.04
RPL17-201ENST00000578528 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.23■■■■■ 4.03
RPL17-201ENST00000578528 TOPBP1Q92547 1522 aa40.2■■■■■ 4.03
RPL17-201ENST00000578528 CUX1P39880 1505 aa40.16■■■■■ 4.02
RPL17-201ENST00000578528 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.16■■■■■ 4.02
RPL17-201ENST00000578528 CUX2O14529 1486 aa40.09■■■■■ 4.01
RPL17-201ENST00000578528 SYNJ1O43426 1573 aa40.04■■■■■ 4
RPL17-201ENST00000578528 TOP2BQ02880 1626 aa40.04■■■■■ 4
RPL17-201ENST00000578528 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.04■■■■■ 4
RPL17-201ENST00000578528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
RPL17-201ENST00000578528 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.9■■■■□ 3.98
RPL17-201ENST00000578528 IFT140Q96RY7 1462 aa39.77■■■■□ 3.96
RPL17-201ENST00000578528 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.73■■■■□ 3.95
RPL17-201ENST00000578528 SOGA1O94964 1423 aa39.73■■■■□ 3.95
RPL17-201ENST00000578528 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.68■■■■□ 3.94
RPL17-201ENST00000578528 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.66■■■■□ 3.94
RPL17-201ENST00000578528 TRIM41Q8WV44 630 aa39.63■■■■□ 3.93
RPL17-201ENST00000578528 WDR97A6NE52 1622 aa39.6■■■■□ 3.93
RPL17-201ENST00000578528 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.59■■■■□ 3.93
RPL17-201ENST00000578528 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.5■■■■□ 3.91
RPL17-201ENST00000578528 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.4■■■■□ 3.9
RPL17-201ENST00000578528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.39■■■■□ 3.9
RPL17-201ENST00000578528 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.37■■■■□ 3.89
RPL17-201ENST00000578528 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.35■■■■□ 3.895e-7■■■■■ 34.9
RPL17-201ENST00000578528 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.3■■■■□ 3.88
RPL17-201ENST00000578528 KIF27Q86VH2 1401 aa39.26■■■■□ 3.88
RPL17-201ENST00000578528 GRIN2BQ13224 1484 aa39.2■■■■□ 3.87
RPL17-201ENST00000578528 PBRM1Q86U86 1689 aa39.19■■■■□ 3.86
RPL17-201ENST00000578528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
RPL17-201ENST00000578528 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.11■■■■□ 3.85
RPL17-201ENST00000578528 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
RPL17-201ENST00000578528 EEA1Q15075 1411 aa39.04■■■■□ 3.84
RPL17-201ENST00000578528 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.03■■■■□ 3.84
RPL17-201ENST00000578528 IGF1RP08069 1367 aa39.02■■■■□ 3.84
RPL17-201ENST00000578528 ADAMTS12P58397 1594 aa38.93■■■■□ 3.82
RPL17-201ENST00000578528 CUL7Q14999 1698 aa38.92■■■■□ 3.82
RPL17-201ENST00000578528 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.89■■■■□ 3.82
RPL17-201ENST00000578528 SYNJ2O15056 1496 aa38.86■■■■□ 3.81
RPL17-201ENST00000578528 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.81■■■■□ 3.8
RPL17-201ENST00000578528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.79■■■■□ 3.8
RPL17-201ENST00000578528 CHD1O14646 1710 aa38.77■■■■□ 3.8
RPL17-201ENST00000578528 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
RPL17-201ENST00000578528 PRXQ9BXM0 1461 aa38.73■■■■□ 3.79
RPL17-201ENST00000578528 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
RPL17-201ENST00000578528 GRIN2AQ12879 1464 aa38.7■■■■□ 3.79
RPL17-201ENST00000578528 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.66■■■■□ 3.78
RPL17-201ENST00000578528 FBLN2P98095 1184 aa38.65■■■■□ 3.78
RPL17-201ENST00000578528 KIF21BO75037 1637 aa38.58■■■■□ 3.77
RPL17-201ENST00000578528 NUP160Q12769 1436 aa38.53■■■■□ 3.76
RPL17-201ENST00000578528 OSCARQ8IYS5 282 aa38.5■■■■□ 3.75
RPL17-201ENST00000578528 CEP170Q5SW79 1584 aa38.48■■■■□ 3.75
RPL17-201ENST00000578528 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.4■■■■□ 3.74
RPL17-201ENST00000578528 GOLGA3Q08378 1498 aa38.36■■■■□ 3.73
RPL17-201ENST00000578528 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.33■■■■□ 3.73
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