RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584781.5

SLC16A3-220, Transcript of solute carrier family 16 member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SLC16A3, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A3-220ENST00000584781 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.28■■■■■ 6.6
SLC16A3-220ENST00000584781 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.33■■■■■ 5.65
SLC16A3-220ENST00000584781 ABCC9O60706 1549 aa50.06■■■■■ 5.6
SLC16A3-220ENST00000584781 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.79■■■■■ 5.24
SLC16A3-220ENST00000584781 NACADO15069 1562 aa47.58■■■■■ 5.21
SLC16A3-220ENST00000584781 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.37■■■■■ 5.17
SLC16A3-220ENST00000584781 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.07■■■■■ 5.13
SLC16A3-220ENST00000584781 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.73■■■■■ 5.07
SLC16A3-220ENST00000584781 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
SLC16A3-220ENST00000584781 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.67■■■■■ 5.06
SLC16A3-220ENST00000584781 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.57■■■■■ 5.05
SLC16A3-220ENST00000584781 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.55■■■■■ 5.04
SLC16A3-220ENST00000584781 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.36■■■■■ 5.01
SLC16A3-220ENST00000584781 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.88■■■■■ 4.94
SLC16A3-220ENST00000584781 SCRIBQ14160 1630 aa45.83■■■■■ 4.93
SLC16A3-220ENST00000584781 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
SLC16A3-220ENST00000584781 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.21■■■■■ 4.83
SLC16A3-220ENST00000584781 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
SLC16A3-220ENST00000584781 NCAPD3P42695 1498 aa43.96■■■■■ 4.63
SLC16A3-220ENST00000584781 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.83■■■■■ 4.61
SLC16A3-220ENST00000584781 SMARCA4P51532 1647 aa43.8■■■■■ 4.6
SLC16A3-220ENST00000584781 SMARCA2P51531 1590 aa43.71■■■■■ 4.59
SLC16A3-220ENST00000584781 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
SLC16A3-220ENST00000584781 HMGXB3Q12766 1538 aa43.61■■■■■ 4.57
SLC16A3-220ENST00000584781 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.42■■■■■ 4.54
SLC16A3-220ENST00000584781 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
SLC16A3-220ENST00000584781 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.33■■■■■ 4.53
SLC16A3-220ENST00000584781 ERCC6Q03468 1493 aa43.22■■■■■ 4.51
SLC16A3-220ENST00000584781 CUX2O14529 1486 aa43.09■■■■■ 4.49
SLC16A3-220ENST00000584781 NESP48681 1621 aa43.07■■■■■ 4.48
SLC16A3-220ENST00000584781 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.86■■■■■ 4.45
SLC16A3-220ENST00000584781 WIZO95785 1651 aa42.77■■■■■ 4.44
SLC16A3-220ENST00000584781 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.76■■■■■ 4.44
SLC16A3-220ENST00000584781 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.65■■■■■ 4.42
SLC16A3-220ENST00000584781 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.63■■■■■ 4.41
SLC16A3-220ENST00000584781 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
SLC16A3-220ENST00000584781 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
SLC16A3-220ENST00000584781 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.46■■■■■ 4.39
SLC16A3-220ENST00000584781 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
SLC16A3-220ENST00000584781 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.23■■■■■ 4.35
SLC16A3-220ENST00000584781 CFTRP13569 1480 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC16A3-220ENST00000584781 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.11■■■■■ 4.33
SLC16A3-220ENST00000584781 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.1■■■■■ 4.33
SLC16A3-220ENST00000584781 WDR62O43379 1518 aa42.1■■■■■ 4.33
SLC16A3-220ENST00000584781 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.85■■■■■ 4.29
SLC16A3-220ENST00000584781 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
SLC16A3-220ENST00000584781 PRDM2Q13029 1718 aa41.64■■■■■ 4.26
SLC16A3-220ENST00000584781 TOPBP1Q92547 1522 aa41.33■■■■■ 4.21
SLC16A3-220ENST00000584781 ABCC8Q09428 1581 aa41.32■■■■■ 4.2
SLC16A3-220ENST00000584781 IFT140Q96RY7 1462 aa41.29■■■■■ 4.2
SLC16A3-220ENST00000584781 OSCARQ8IYS5 282 aa41.2■■■■■ 4.19
SLC16A3-220ENST00000584781 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.19■■■■■ 4.18
SLC16A3-220ENST00000584781 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.13■■■■■ 4.18
SLC16A3-220ENST00000584781 TRIM41Q8WV44 630 aa40.93■■■■■ 4.14
SLC16A3-220ENST00000584781 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SLC16A3-220ENST00000584781 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
SLC16A3-220ENST00000584781 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC16A3-220ENST00000584781 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.89■■■■■ 4.14
SLC16A3-220ENST00000584781 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.134e-7■■■■■ 44.1
SLC16A3-220ENST00000584781 SOGA1O94964 1423 aa40.77■■■■■ 4.12
SLC16A3-220ENST00000584781 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.75■■■■■ 4.11
SLC16A3-220ENST00000584781 CUX1P39880 1505 aa40.7■■■■■ 4.11
SLC16A3-220ENST00000584781 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.7■■■■■ 4.11
SLC16A3-220ENST00000584781 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
SLC16A3-220ENST00000584781 WDR97A6NE52 1622 aa40.57■■■■■ 4.09
SLC16A3-220ENST00000584781 FBLN2P98095 1184 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC16A3-220ENST00000584781 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC16A3-220ENST00000584781 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC16A3-220ENST00000584781 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.51■■■■■ 4.08
SLC16A3-220ENST00000584781 CHD1O14646 1710 aa40.48■■■■■ 4.07
SLC16A3-220ENST00000584781 ARHGEF11O15085 1522 aa40.46■■■■■ 4.07
SLC16A3-220ENST00000584781 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.41■■■■■ 4.06
SLC16A3-220ENST00000584781 GRIN2BQ13224 1484 aa40.39■■■■■ 4.06
SLC16A3-220ENST00000584781 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
SLC16A3-220ENST00000584781 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
SLC16A3-220ENST00000584781 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC16A3-220ENST00000584781 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC16A3-220ENST00000584781 SYNJ2O15056 1496 aa40.21■■■■■ 4.03
SLC16A3-220ENST00000584781 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.2■■■■■ 4.03
SLC16A3-220ENST00000584781 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.18■■■■■ 4.02
SLC16A3-220ENST00000584781 SYNJ1O43426 1573 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC16A3-220ENST00000584781 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.13■■■■■ 4.02
SLC16A3-220ENST00000584781 TOP2BQ02880 1626 aa40.13■■■■■ 4.01
SLC16A3-220ENST00000584781 PBRM1Q86U86 1689 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC16A3-220ENST00000584781 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.11■■■■■ 4.01
SLC16A3-220ENST00000584781 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.1■■■■■ 4.01
SLC16A3-220ENST00000584781 ARAP1Q96P48 1450 aa40.08■■■■■ 4.01
SLC16A3-220ENST00000584781 GRIN2AQ12879 1464 aa39.85■■■■□ 3.97
SLC16A3-220ENST00000584781 ADAMTS12P58397 1594 aa39.82■■■■□ 3.97
SLC16A3-220ENST00000584781 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.8■■■■□ 3.96
SLC16A3-220ENST00000584781 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.79■■■■□ 3.96
SLC16A3-220ENST00000584781 NUP160Q12769 1436 aa39.74■■■■□ 3.95
SLC16A3-220ENST00000584781 CEP170Q5SW79 1584 aa39.64■■■■□ 3.94
SLC16A3-220ENST00000584781 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.63■■■■□ 3.93
SLC16A3-220ENST00000584781 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.46■■■■□ 3.91
SLC16A3-220ENST00000584781 SHROOM2Q13796 1616 aa39.46■■■■□ 3.91
SLC16A3-220ENST00000584781 KIF27Q86VH2 1401 aa39.42■■■■□ 3.9
SLC16A3-220ENST00000584781 IGF1RP08069 1367 aa39.37■■■■□ 3.89
SLC16A3-220ENST00000584781 JPH4Q96JJ6 628 aa39.35■■■■□ 3.89
SLC16A3-220ENST00000584781 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.31■■■■□ 3.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms