Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 PLCB1-213ENST00000626114 598 ntTSL 57.84□□□□□ -1.156e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 MELK-204ENST00000489766 551 ntTSL 37.79□□□□□ -1.166e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 MELK-205ENST00000495529 794 ntTSL 57.79□□□□□ -1.166e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-205ENST00000454964 598 ntTSL 27.78□□□□□ -1.164e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ROGDI-206ENST00000586504 651 ntTSL 57.65□□□□□ -1.182e-12■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-235ENST00000556082 660 ntTSL 1 (best)7.45□□□□□ -1.224e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-227ENST00000636825 3020 ntTSL 57.38□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-203ENST00000393287 6770 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.234e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.266e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-221ENST00000635830 3237 ntTSL 57.04□□□□□ -1.286e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-219ENST00000630495 759 ntTSL 56.85□□□□□ -1.316e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-221ENST00000553498 911 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.354e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 26.46□□□□□ -1.386e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.414e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-219ENST00000553488 1065 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.574e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-236ENST00000556220 692 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.634e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-230ENST00000554673 981 ntTSL 54.88□□□□□ -1.634e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-224ENST00000554040 592 ntTSL 1 (best)4.88□□□□□ -1.634e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-226ENST00000554350 943 ntTSL 1 (best)4.77□□□□□ -1.654e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.664e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-212ENST00000515746 619 ntTSL 54.71□□□□□ -1.664e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-202ENST00000359366 2584 ntTSL 1 (best)4.49□□□□□ -1.694e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-247ENST00000557311 562 ntTSL 1 (best)4.44□□□□□ -1.74e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-244ENST00000556898 990 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.714e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-209ENST00000506466 637 ntTSL 34.35□□□□□ -1.714e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-246ENST00000557030 807 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.714e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-218ENST00000553309 1022 ntTSL 1 (best)4.33□□□□□ -1.724e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.724e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-227ENST00000554491 1064 ntTSL 1 (best)4.33□□□□□ -1.724e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.736e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.764e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-241ENST00000556374 1083 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.764e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-225ENST00000554214 771 ntTSL 1 (best)4.08□□□□□ -1.764e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-210ENST00000507965 708 ntTSL 24.04□□□□□ -1.764e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-245ENST00000556958 769 ntTSL 1 (best)3.98□□□□□ -1.774e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-223ENST00000553686 869 ntTSL 1 (best)3.98□□□□□ -1.774e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-243ENST00000556671 921 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-220ENST00000553491 857 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-238ENST00000556288 901 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-222ENST00000553570 757 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-237ENST00000556274 913 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-231ENST00000554994 922 ntTSL 1 (best)3.57□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-233ENST00000555816 760 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-242ENST00000556644 372 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-228ENST00000554592 1010 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-240ENST00000556339 525 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-239ENST00000556315 924 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.844e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.854e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-229ENST00000554672 759 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.854e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-232ENST00000555381 803 ntTSL 1 (best)3.47□□□□□ -1.854e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.884e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 PLCB1-226ENST00000636784 100 ntTSL 53.08□□□□□ -1.926e-10■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-217ENST00000553287 726 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.934e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-234ENST00000555958 857 ntTSL 1 (best)2.98□□□□□ -1.934e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-211ENST00000511362 591 ntTSL 32.95□□□□□ -1.944e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 ATXN3-208ENST00000504047 426 ntTSL 32.09□□□□□ -2.074e-18■■■■■ 40.6
PTBP1P26599 SSUH2-210ENST00000466215 492 ntTSL 38.31□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-215ENST00000483021 539 ntTSL 314.61□□□□□ -0.075e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-213ENST00000463230 2241 ntTSL 210.14□□□□□ -0.795e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-208ENST00000438014 582 ntTSL 56.26□□□□□ -1.415e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.565e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.715e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.735e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.775e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-207ENST00000436436 601 ntTSL 42.2□□□□□ -2.065e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 32.13□□□□□ -2.075e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 310.74□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.22e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 ADAMTS6-205ENST00000464680 2742 ntTSL 59.97□□□□□ -0.811e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 ADAMTS6-206ENST00000470597 2850 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.291e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 ADAMTS6-202ENST00000381052 6956 ntTSL 26.94□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 LINC00894-204ENST00000444489 2951 ntTSL 510.55□□□□□ -0.726e-9■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 58.49□□□□□ -1.056e-9■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 VPS13A-212ENST00000493341 2001 ntTSL 23.87□□□□□ -1.796e-9■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 VPS13A-208ENST00000423463 2702 ntTSL 21.91□□□□□ -2.16e-9■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 MAGI2-230ENST00000636989 666 ntTSL 53.21□□□□□ -1.99e-11■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.835e-12■■■■■ 40.5
PTBP1P26599 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 CEP126-203ENST00000532529 4533 ntTSL 51.7□□□□□ -2.148e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.726e-9■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-206ENST00000510711 3126 ntTSL 28.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 37.19□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.986e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.016e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 RICTOR-207ENST00000511516 7312 ntTSL 1 (best)2.5□□□□□ -2.016e-8■■■■■ 40.4
PTBP1P26599 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.6□□□□□ -0.079e-8■■■■■ 40.4
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 312.5 ms