RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

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Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.02■■□□□ 1.92
NFIC-211ENST00000641145 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
NFIC-211ENST00000641145 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.74■■□□□ 1.71
NFIC-211ENST00000641145 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
NFIC-211ENST00000641145 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
NFIC-211ENST00000641145 APLP2Q06481 763 aa25.31■■□□□ 1.64
NFIC-211ENST00000641145 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.27■■□□□ 1.64
NFIC-211ENST00000641145 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NFIC-211ENST00000641145 MYT1Q01538 1121 aa24.75■■□□□ 1.55
NFIC-211ENST00000641145 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NFIC-211ENST00000641145 NEFLP07196 543 aa24.6■■□□□ 1.53
NFIC-211ENST00000641145 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
NFIC-211ENST00000641145 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
NFIC-211ENST00000641145 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
NFIC-211ENST00000641145 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
NFIC-211ENST00000641145 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.25■■□□□ 1.47
NFIC-211ENST00000641145 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.24■■□□□ 1.47
NFIC-211ENST00000641145 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
NFIC-211ENST00000641145 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
NFIC-211ENST00000641145 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.89■■□□□ 1.42
NFIC-211ENST00000641145 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
NFIC-211ENST00000641145 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.72■■□□□ 1.39
NFIC-211ENST00000641145 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
NFIC-211ENST00000641145 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.64■■□□□ 1.38
NFIC-211ENST00000641145 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NFIC-211ENST00000641145 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.56■■□□□ 1.36
NFIC-211ENST00000641145 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NFIC-211ENST00000641145 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NFIC-211ENST00000641145 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NFIC-211ENST00000641145 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
NFIC-211ENST00000641145 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NFIC-211ENST00000641145 TRIM41Q8WV44 630 aa23.25■■□□□ 1.31
NFIC-211ENST00000641145 SLC24A1O60721 1099 aa23.13■■□□□ 1.29
NFIC-211ENST00000641145 ITGAEP38570 1179 aa23.05■■□□□ 1.28
NFIC-211ENST00000641145 BCL11AQ9H165 835 aa22.94■■□□□ 1.26
NFIC-211ENST00000641145 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NFIC-211ENST00000641145 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.76■■□□□ 1.23
NFIC-211ENST00000641145 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NFIC-211ENST00000641145 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NFIC-211ENST00000641145 NEFMP07197 916 aa22.71■■□□□ 1.23
NFIC-211ENST00000641145 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
NFIC-211ENST00000641145 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
NFIC-211ENST00000641145 BCANQ96GW7 911 aa22.62■■□□□ 1.21
NFIC-211ENST00000641145 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.55■■□□□ 1.2
NFIC-211ENST00000641145 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
NFIC-211ENST00000641145 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
NFIC-211ENST00000641145 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
NFIC-211ENST00000641145 TRIM52Q96A61 297 aa22.41■■□□□ 1.18
NFIC-211ENST00000641145 HRCP23327 699 aa22.39■■□□□ 1.18
NFIC-211ENST00000641145 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NFIC-211ENST00000641145 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NFIC-211ENST00000641145 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
NFIC-211ENST00000641145 ANP32CO43423 234 aa22.26■■□□□ 1.15
NFIC-211ENST00000641145 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NFIC-211ENST00000641145 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NFIC-211ENST00000641145 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NFIC-211ENST00000641145 NEUROD1Q13562 356 aa22.19■■□□□ 1.14
NFIC-211ENST00000641145 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
NFIC-211ENST00000641145 A0A0G2JS52 829 aa21.98■■□□□ 1.11
NFIC-211ENST00000641145 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
NFIC-211ENST00000641145 ARXQ96QS3 562 aa21.95■■□□□ 1.1
NFIC-211ENST00000641145 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
NFIC-211ENST00000641145 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.91■■□□□ 1.1
NFIC-211ENST00000641145 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.9■■□□□ 1.1
NFIC-211ENST00000641145 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
NFIC-211ENST00000641145 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NFIC-211ENST00000641145 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-211ENST00000641145 FBLN2P98095 1184 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-211ENST00000641145 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NFIC-211ENST00000641145 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NFIC-211ENST00000641145 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.74■■□□□ 1.07
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NFIC-211ENST00000641145 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NFIC-211ENST00000641145 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NFIC-211ENST00000641145 NBR1Q14596 966 aa21.65■■□□□ 1.06
NFIC-211ENST00000641145 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NFIC-211ENST00000641145 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
NFIC-211ENST00000641145 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.56■■□□□ 1.04
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.53■■□□□ 1.04
NFIC-211ENST00000641145 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 CLSTN1O94985 981 aa21.5■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.46■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 NPHP1O15259 732 aa21.46■■□□□ 1.03
NFIC-211ENST00000641145 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.45■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 BECN1Q14457 450 aa21.45■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.44■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.43■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 PLEKHG5O94827 1062 aa21.43■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 C14orf37Q86TY3 774 aa21.42■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 FKBP8Q14318 412 aa21.41■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.41■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 CASC1Q6TDU7 716 aa21.4■■□□□ 1.02
NFIC-211ENST00000641145 ARID3CA6NKF2 412 aa21.37■■□□□ 1.01
NFIC-211ENST00000641145 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.35■■□□□ 1.01
NFIC-211ENST00000641145 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.34■■□□□ 1.01
NFIC-211ENST00000641145 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.01
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