Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SUB1P53999 ACSM3-210ENST00000567006 520 ntTSL 22.25□□□□□ -2.053e-22■■■■■ 135.9
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SUB1P53999 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.666e-13■■■■■ 133.3
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SUB1P53999 NUP93-206ENST00000563465 458 ntTSL 28.15□□□□□ -1.18e-7■■■■■ 132.3
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SUB1P53999 NUP93-218ENST00000569322 410 ntTSL 36.94□□□□□ -1.38e-7■■■■■ 132.3
SUB1P53999 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.358e-7■■■■■ 132.3
SUB1P53999 NUP93-209ENST00000564278 588 ntTSL 24.8□□□□□ -1.648e-7■■■■■ 132.3
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SUB1P53999 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.866e-47■■■■■ 127.9
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SUB1P53999 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-38■■■■■ 119.5
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SUB1P53999 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 114.6
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SUB1P53999 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 114
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SUB1P53999 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 515.49■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 113
SUB1P53999 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)13.69□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 113
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SUB1P53999 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-11■■■■■ 113
SUB1P53999 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.31e-11■■■■■ 113
SUB1P53999 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.111e-10■■■■■ 113
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SUB1P53999 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-10■■■■■ 113
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SUB1P53999 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-22■■■■■ 112.2
SUB1P53999 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.222e-22■■■■■ 112.2
SUB1P53999 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.432e-22■■■■■ 112.2
SUB1P53999 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.432e-22■■■■■ 112.2
SUB1P53999 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-41■■■■■ 112.1
SUB1P53999 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.293e-41■■■■■ 112.1
SUB1P53999 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 111.6
SUB1P53999 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-13■■■■■ 111.6
SUB1P53999 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 514.47□□□□□ -0.094e-13■■■■■ 111.6
SUB1P53999 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.184e-13■■■■■ 111.6
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