RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.72■□□□□ 0.91
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa18.64■□□□□ 0.57
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.05■□□□□ 0.48
EFTUD2-202ENST00000426333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
EFTUD2-202ENST00000426333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
EFTUD2-202ENST00000426333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
EFTUD2-202ENST00000426333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.33■□□□□ 0.37
EFTUD2-202ENST00000426333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa17.24■□□□□ 0.35
EFTUD2-202ENST00000426333 APLP2Q06481 763 aa17.17■□□□□ 0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.15■□□□□ 0.34
EFTUD2-202ENST00000426333 PCGF6Q9BYE7 350 aa16.91■□□□□ 0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.9■□□□□ 0.3
EFTUD2-202ENST00000426333 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 ERICH6Q7L0X2 663 aa16.87■□□□□ 0.29
EFTUD2-202ENST00000426333 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC9O60706 1549 aa16.82■□□□□ 0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
EFTUD2-202ENST00000426333 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
EFTUD2-202ENST00000426333 NACADO15069 1562 aa16.68■□□□□ 0.26
EFTUD2-202ENST00000426333 SCRIBQ14160 1630 aa16.57■□□□□ 0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 NEFLP07196 543 aa16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 MYT1Q01538 1121 aa16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.54■□□□□ 0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM41Q8WV44 630 aa16.48■□□□□ 0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.47■□□□□ 0.23
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-202ENST00000426333 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
EFTUD2-202ENST00000426333 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.27■□□□□ 0.2
EFTUD2-202ENST00000426333 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.16■□□□□ 0.18
EFTUD2-202ENST00000426333 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
EFTUD2-202ENST00000426333 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.07■□□□□ 0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 HRCP23327 699 aa16.04■□□□□ 0.16
EFTUD2-202ENST00000426333 WIZO95785 1651 aa15.98■□□□□ 0.15
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCA4P51532 1647 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGAEP38570 1179 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
EFTUD2-202ENST00000426333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.83■□□□□ 0.128e-8■□□□□ 11.2
EFTUD2-202ENST00000426333 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.79■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.74■□□□□ 0.11
EFTUD2-202ENST00000426333 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.7■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.66■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 SMARCA2P51531 1590 aa15.65■□□□□ 0.1
EFTUD2-202ENST00000426333 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.59■□□□□ 0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.56■□□□□ 0.08
EFTUD2-202ENST00000426333 BCANQ96GW7 911 aa15.44■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.44■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGXB3Q12766 1538 aa15.44■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAPD3P42695 1498 aa15.42■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM52Q96A61 297 aa15.39■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 ANP32CO43423 234 aa15.37■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 NEUROD1Q13562 356 aa15.37■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.36■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCC8Q09428 1581 aa15.31■□□□□ 0.04
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.03
EFTUD2-202ENST00000426333 PRDM2Q13029 1718 aa15.21■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 CANXP27824 592 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 SYNJ1O43426 1573 aa15.18■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL11AQ9H165 835 aa15.16■□□□□ 0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 CFTRP13569 1480 aa15.14■□□□□ 0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 NEFMP07197 916 aa15.13■□□□□ 0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC24A1O60721 1099 aa15.09■□□□□ 0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.09■□□□□ 0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.08■□□□□ 0
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
EFTUD2-202ENST00000426333 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
EFTUD2-202ENST00000426333 TOP2BQ02880 1626 aa15.05■□□□□ -0
EFTUD2-202ENST00000426333 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.03■□□□□ -0
EFTUD2-202ENST00000426333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 CUX1P39880 1505 aa15.01□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 SOGA1O94964 1423 aa15□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 FKBP8Q14318 412 aa14.97□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
EFTUD2-202ENST00000426333 NESP48681 1621 aa14.95□□□□□ -0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.95□□□□□ -0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 FBLN2P98095 1184 aa14.93□□□□□ -0.02
EFTUD2-202ENST00000426333 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms