RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.85■■■■■ 5.41
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.54■■■■■ 4.56
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC9O60706 1549 aa42.71■■■■■ 4.43
EFTUD2-217ENST00000590124 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.03■■■■■ 4.16
EFTUD2-217ENST00000590124 NACADO15069 1562 aa40.95■■■■■ 4.15
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.75■■■■■ 4.11
EFTUD2-217ENST00000590124 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.68■■■■■ 4.1
EFTUD2-217ENST00000590124 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
EFTUD2-217ENST00000590124 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.44■■■■■ 4.06
EFTUD2-217ENST00000590124 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.16■■■■■ 4.02
EFTUD2-217ENST00000590124 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.85■■■■□ 3.97
EFTUD2-217ENST00000590124 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.85■■■■□ 3.978e-8■□□□□ 11.2
EFTUD2-217ENST00000590124 SCRIBQ14160 1630 aa39.66■■■■□ 3.94
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.41■■■■□ 3.9
EFTUD2-217ENST00000590124 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.39■■■■□ 3.9
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
EFTUD2-217ENST00000590124 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.67■■■■□ 3.78
EFTUD2-217ENST00000590124 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
EFTUD2-217ENST00000590124 SMARCA4P51532 1647 aa37.95■■■■□ 3.67
EFTUD2-217ENST00000590124 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
EFTUD2-217ENST00000590124 NCAPD3P42695 1498 aa37.79■■■■□ 3.64
EFTUD2-217ENST00000590124 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.78■■■■□ 3.64
EFTUD2-217ENST00000590124 SMARCA2P51531 1590 aa37.72■■■■□ 3.63
EFTUD2-217ENST00000590124 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.65■■■■□ 3.62
EFTUD2-217ENST00000590124 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.61■■■■□ 3.61
EFTUD2-217ENST00000590124 HMGXB3Q12766 1538 aa37.6■■■■□ 3.61
EFTUD2-217ENST00000590124 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
EFTUD2-217ENST00000590124 WIZO95785 1651 aa37.23■■■■□ 3.55
EFTUD2-217ENST00000590124 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
EFTUD2-217ENST00000590124 NESP48681 1621 aa36.93■■■■□ 3.5
EFTUD2-217ENST00000590124 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.83■■■■□ 3.49
EFTUD2-217ENST00000590124 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
EFTUD2-217ENST00000590124 ERCC6Q03468 1493 aa36.8■■■■□ 3.48
EFTUD2-217ENST00000590124 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.66■■■■□ 3.46
EFTUD2-217ENST00000590124 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.54■■■■□ 3.44
EFTUD2-217ENST00000590124 CUX2O14529 1486 aa36.53■■■■□ 3.44
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.51■■■■□ 3.44
EFTUD2-217ENST00000590124 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
EFTUD2-217ENST00000590124 CFTRP13569 1480 aa36.43■■■■□ 3.42
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.38■■■■□ 3.41
EFTUD2-217ENST00000590124 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.24■■■■□ 3.39
EFTUD2-217ENST00000590124 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.2■■■■□ 3.39
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.2■■■■□ 3.39
EFTUD2-217ENST00000590124 PRDM2Q13029 1718 aa36.17■■■■□ 3.38
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR62O43379 1518 aa36.12■■■■□ 3.37
EFTUD2-217ENST00000590124 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
EFTUD2-217ENST00000590124 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
EFTUD2-217ENST00000590124 TOPBP1Q92547 1522 aa35.66■■■■□ 3.3
EFTUD2-217ENST00000590124 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.62■■■■□ 3.29
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCC8Q09428 1581 aa35.62■■■■□ 3.29
EFTUD2-217ENST00000590124 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.59■■■■□ 3.29
EFTUD2-217ENST00000590124 IFT140Q96RY7 1462 aa35.46■■■■□ 3.27
EFTUD2-217ENST00000590124 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
EFTUD2-217ENST00000590124 CUX1P39880 1505 aa35.33■■■■□ 3.25
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
EFTUD2-217ENST00000590124 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
EFTUD2-217ENST00000590124 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.22■■■■□ 3.23
EFTUD2-217ENST00000590124 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
EFTUD2-217ENST00000590124 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.17■■■■□ 3.22
EFTUD2-217ENST00000590124 SOGA1O94964 1423 aa35.15■■■■□ 3.22
EFTUD2-217ENST00000590124 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.211e-6■■■■□ 21.1
EFTUD2-217ENST00000590124 WDR97A6NE52 1622 aa35.01■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.99■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.99■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 TOP2BQ02880 1626 aa34.98■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 SYNJ1O43426 1573 aa34.96■■■■□ 3.19
EFTUD2-217ENST00000590124 OSCARQ8IYS5 282 aa34.93■■■■□ 3.18
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.88■■■■□ 3.17
EFTUD2-217ENST00000590124 CHD1O14646 1710 aa34.8■■■■□ 3.16
EFTUD2-217ENST00000590124 GRIN2BQ13224 1484 aa34.78■■■■□ 3.16
EFTUD2-217ENST00000590124 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.78■■■■□ 3.16
EFTUD2-217ENST00000590124 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.77■■■■□ 3.16
EFTUD2-217ENST00000590124 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.76■■■■□ 3.15
EFTUD2-217ENST00000590124 PBRM1Q86U86 1689 aa34.73■■■■□ 3.15
EFTUD2-217ENST00000590124 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
EFTUD2-217ENST00000590124 FBLN2P98095 1184 aa34.62■■■■□ 3.13
EFTUD2-217ENST00000590124 SYNJ2O15056 1496 aa34.58■■■■□ 3.13
EFTUD2-217ENST00000590124 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
EFTUD2-217ENST00000590124 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.46■■■■□ 3.11
EFTUD2-217ENST00000590124 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.46■■■■□ 3.11
EFTUD2-217ENST00000590124 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.46■■■■□ 3.11
EFTUD2-217ENST00000590124 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.46■■■■□ 3.11
EFTUD2-217ENST00000590124 ADAMTS12P58397 1594 aa34.45■■■■□ 3.11
EFTUD2-217ENST00000590124 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.43■■■■□ 3.1
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGEF11O15085 1522 aa34.42■■■■□ 3.1
EFTUD2-217ENST00000590124 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.36■■■■□ 3.09
EFTUD2-217ENST00000590124 GRIN2AQ12879 1464 aa34.34■■■■□ 3.09
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM41Q8WV44 630 aa34.29■■■■□ 3.08
EFTUD2-217ENST00000590124 KIF27Q86VH2 1401 aa34.26■■■■□ 3.07
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP160Q12769 1436 aa34.22■■■■□ 3.07
EFTUD2-217ENST00000590124 CEP170Q5SW79 1584 aa34.21■■■■□ 3.07
EFTUD2-217ENST00000590124 IGF1RP08069 1367 aa34.18■■■■□ 3.06
EFTUD2-217ENST00000590124 ARAP1Q96P48 1450 aa34.14■■■■□ 3.06
EFTUD2-217ENST00000590124 CUL7Q14999 1698 aa34.11■■■■□ 3.05
EFTUD2-217ENST00000590124 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.04■■■■□ 3.04
EFTUD2-217ENST00000590124 SHROOM2Q13796 1616 aa34.01■■■■□ 3.04
EFTUD2-217ENST00000590124 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.95■■■■□ 3.03
EFTUD2-217ENST00000590124 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.95■■■■□ 3.02
EFTUD2-217ENST00000590124 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms