Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.962e-27■■■■■ 383
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SUB1P53999 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.691e-13■■■■■ 309.5
SUB1P53999 ATP5L-203ENST00000527186 1582 ntTSL 23.42□□□□□ -1.866e-35■■■■■ 280.2
SUB1P53999 LDHB-206ENST00000470985 678 ntTSL 1 (best)3.84□□□□□ -1.795e-11■■■■■ 273.7
SUB1P53999 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 510.81□□□□□ -0.681e-13■■■■■ 263.4
SUB1P53999 CCT2-211ENST00000550653 567 ntTSL 23.78□□□□□ -1.87e-7■■■■■ 249
SUB1P53999 ACLY-207ENST00000590151 4309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 238
SUB1P53999 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 238
SUB1P53999 ACLY-201ENST00000352035 4339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 238
SUB1P53999 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.531e-48■■■■■ 211.6
SUB1P53999 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-48■■■■■ 211.6
SUB1P53999 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 59.65□□□□□ -0.861e-48■■■■■ 211.6
SUB1P53999 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-48■■■■■ 211.6
SUB1P53999 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.281e-48■■■■■ 211.6
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SUB1P53999 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.213e-22■■■■■ 207.6
SUB1P53999 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)6.48□□□□□ -1.373e-22■■■■■ 207.6
SUB1P53999 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 34.12□□□□□ -1.753e-22■■■■■ 207.6
SUB1P53999 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 33.13□□□□□ -1.914e-57■■■■■ 205.6
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SUB1P53999 LRPPRC-204ENST00000419884 888 ntTSL 52.48□□□□□ -2.017e-19■■■■■ 201.5
SUB1P53999 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.142e-57■■■■■ 200.7
SUB1P53999 CKS1B-206ENST00000474215 739 ntTSL 38.4□□□□□ -1.062e-57■■■■■ 200.7
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SUB1P53999 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.623e-39■■■■■ 181.7
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SUB1P53999 UQCRH-204ENST00000489056 553 ntTSL 23.34□□□□□ -1.872e-37■■■■■ 175.3
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SUB1P53999 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.838e-37■■■■■ 172.7
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SUB1P53999 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)7.51□□□□□ -1.211e-17■■■■■ 171.3
SUB1P53999 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 56.07□□□□□ -1.441e-17■■■■■ 171.3
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SUB1P53999 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-7■■■■■ 155
SUB1P53999 COX6C-211ENST00000606245 646 nt8.79□□□□□ -11e-95■■■■■ 153.4
SUB1P53999 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.424e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.564e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.594e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.774e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 RPL13-206ENST00000472354 631 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-21■■■■■ 150.6
SUB1P53999 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 150.6
SUB1P53999 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 149.4
SUB1P53999 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-205ENST00000497075 1313 ntTSL 29.91□□□□□ -0.828e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 ATP5G3-203ENST00000409194 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.178e-8■■■■■ 143.1
SUB1P53999 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 23.41□□□□□ -1.866e-10■■■■■ 140.8
SUB1P53999 RBMX-207ENST00000562646 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.24e-19■■■■■ 137.6
SUB1P53999 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.833e-61■■■■■ 137.5
SUB1P53999 GRHPR-204ENST00000480596 1893 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-209ENST00000494290 1593 ntTSL 511.78□□□□□ -0.521e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 GRHPR-210ENST00000497693 4762 ntTSL 211.5□□□□□ -0.571e-15■■■■■ 137.4
SUB1P53999 HSP90AB1-202ENST00000371554 2674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.131e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-323■■■■■ 136.8
SUB1P53999 FHOD1-207ENST00000567752 4321 ntTSL 212.7□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 136
SUB1P53999 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.723e-6■■■■■ 136
SUB1P53999 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC11.75□□□□□ -0.538e-25■■■■■ 136
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