RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248450.8

AAMP-201, Transcript of angio associated migratory cell protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene AAMP, Length 1,886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAMP-201ENST00000248450 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.28■■■■□ 3.24
AAMP-201ENST00000248450 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.74■■■□□ 2.51
AAMP-201ENST00000248450 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
AAMP-201ENST00000248450 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.22■■■□□ 2.27
AAMP-201ENST00000248450 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.13■■■□□ 2.25
AAMP-201ENST00000248450 ABCC9O60706 1549 aa29.04■■■□□ 2.24
AAMP-201ENST00000248450 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.94■■■□□ 2.22
AAMP-201ENST00000248450 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.74■■■□□ 2.19
AAMP-201ENST00000248450 NACADO15069 1562 aa28.59■■■□□ 2.17
AAMP-201ENST00000248450 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.36■■■□□ 2.13
AAMP-201ENST00000248450 SCRIBQ14160 1630 aa28.34■■■□□ 2.13
AAMP-201ENST00000248450 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
AAMP-201ENST00000248450 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.84■■■□□ 2.05
AAMP-201ENST00000248450 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.49■■□□□ 1.99
AAMP-201ENST00000248450 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.43■■□□□ 1.98
AAMP-201ENST00000248450 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.985e-7■■■□□ 17.3
AAMP-201ENST00000248450 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
AAMP-201ENST00000248450 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.29■■□□□ 1.96
AAMP-201ENST00000248450 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
AAMP-201ENST00000248450 SMARCA4P51532 1647 aa27.13■■□□□ 1.93
AAMP-201ENST00000248450 WIZO95785 1651 aa27.11■■□□□ 1.93
AAMP-201ENST00000248450 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
AAMP-201ENST00000248450 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.75■■□□□ 1.87
AAMP-201ENST00000248450 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.68■■□□□ 1.86
AAMP-201ENST00000248450 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
AAMP-201ENST00000248450 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.64■■□□□ 1.85
AAMP-201ENST00000248450 SMARCA2P51531 1590 aa26.63■■□□□ 1.85
AAMP-201ENST00000248450 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
AAMP-201ENST00000248450 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.52■■□□□ 1.84
AAMP-201ENST00000248450 NCAPD3P42695 1498 aa26.37■■□□□ 1.81
AAMP-201ENST00000248450 HMGXB3Q12766 1538 aa26.36■■□□□ 1.81
AAMP-201ENST00000248450 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.27■■□□□ 1.8
AAMP-201ENST00000248450 TRIM41Q8WV44 630 aa26.18■■□□□ 1.78
AAMP-201ENST00000248450 ABCC8Q09428 1581 aa26.04■■□□□ 1.76
AAMP-201ENST00000248450 CFTRP13569 1480 aa25.82■■□□□ 1.72
AAMP-201ENST00000248450 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
AAMP-201ENST00000248450 PRDM2Q13029 1718 aa25.76■■□□□ 1.71
AAMP-201ENST00000248450 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
AAMP-201ENST00000248450 SYNJ1O43426 1573 aa25.72■■□□□ 1.71
AAMP-201ENST00000248450 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.72■■□□□ 1.71
AAMP-201ENST00000248450 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.7■■□□□ 1.7
AAMP-201ENST00000248450 TOP2BQ02880 1626 aa25.59■■□□□ 1.69
AAMP-201ENST00000248450 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.57■■□□□ 1.68
AAMP-201ENST00000248450 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.57■■□□□ 1.68
AAMP-201ENST00000248450 SOGA1O94964 1423 aa25.54■■□□□ 1.68
AAMP-201ENST00000248450 NESP48681 1621 aa25.52■■□□□ 1.68
AAMP-201ENST00000248450 CUX1P39880 1505 aa25.5■■□□□ 1.67
AAMP-201ENST00000248450 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.5■■□□□ 1.67
AAMP-201ENST00000248450 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.46■■□□□ 1.67
AAMP-201ENST00000248450 EEA1Q15075 1411 aa25.46■■□□□ 1.67
AAMP-201ENST00000248450 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.44■■□□□ 1.66
AAMP-201ENST00000248450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.44■■□□□ 1.66
AAMP-201ENST00000248450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.34■■□□□ 1.65
AAMP-201ENST00000248450 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.32■■□□□ 1.64
AAMP-201ENST00000248450 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.3■■□□□ 1.64
AAMP-201ENST00000248450 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.25■■□□□ 1.63
AAMP-201ENST00000248450 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
AAMP-201ENST00000248450 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.23■■□□□ 1.63
AAMP-201ENST00000248450 TOPBP1Q92547 1522 aa25.2■■□□□ 1.62
AAMP-201ENST00000248450 KIF27Q86VH2 1401 aa25.15■■□□□ 1.62
AAMP-201ENST00000248450 GOLGA3Q08378 1498 aa25.15■■□□□ 1.62
AAMP-201ENST00000248450 KIF21BO75037 1637 aa25.15■■□□□ 1.62
AAMP-201ENST00000248450 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
AAMP-201ENST00000248450 CUX2O14529 1486 aa25.09■■□□□ 1.61
AAMP-201ENST00000248450 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AAMP-201ENST00000248450 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
AAMP-201ENST00000248450 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.06■■□□□ 1.6
AAMP-201ENST00000248450 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.02■■□□□ 1.6
AAMP-201ENST00000248450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.01■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 PRXQ9BXM0 1461 aa24.98■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.98■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 CEP162Q5TB80 1403 aa24.97■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.97■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.96■■□□□ 1.59
AAMP-201ENST00000248450 ERCC6Q03468 1493 aa24.93■■□□□ 1.58
AAMP-201ENST00000248450 WDR97A6NE52 1622 aa24.92■■□□□ 1.58
AAMP-201ENST00000248450 IGF1RP08069 1367 aa24.89■■□□□ 1.58
AAMP-201ENST00000248450 WDR62O43379 1518 aa24.83■■□□□ 1.57
AAMP-201ENST00000248450 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
AAMP-201ENST00000248450 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.79■■□□□ 1.56
AAMP-201ENST00000248450 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.79■■□□□ 1.56
AAMP-201ENST00000248450 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
AAMP-201ENST00000248450 CLIP1P30622 1438 aa24.76■■□□□ 1.55
AAMP-201ENST00000248450 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
AAMP-201ENST00000248450 CUL7Q14999 1698 aa24.74■■□□□ 1.55
AAMP-201ENST00000248450 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.73■■□□□ 1.55
AAMP-201ENST00000248450 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AAMP-201ENST00000248450 IFT140Q96RY7 1462 aa24.67■■□□□ 1.54
AAMP-201ENST00000248450 PBRM1Q86U86 1689 aa24.63■■□□□ 1.53
AAMP-201ENST00000248450 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.63■■□□□ 1.53
AAMP-201ENST00000248450 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.531e-8■■■■■ 34
AAMP-201ENST00000248450 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
AAMP-201ENST00000248450 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
AAMP-201ENST00000248450 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
AAMP-201ENST00000248450 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.54■■□□□ 1.52
AAMP-201ENST00000248450 GRIN2BQ13224 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
AAMP-201ENST00000248450 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.51■■□□□ 1.51
AAMP-201ENST00000248450 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
AAMP-201ENST00000248450 ARAP1Q96P48 1450 aa24.49■■□□□ 1.51
AAMP-201ENST00000248450 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms