Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 AMT-240ENST00000636871 2076 ntTSL 517.97■□□□□ 0.472e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-254ENST00000637982 2330 ntTSL 517.88■□□□□ 0.452e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-234ENST00000636587 2040 ntTSL 517.58■□□□□ 0.42e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-225ENST00000635889 2260 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-227ENST00000635936 2223 ntTSL 517.19■□□□□ 0.342e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.292e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-244ENST00000637114 1991 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-257ENST00000638092 2448 ntTSL 516.75■□□□□ 0.272e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-255ENST00000637994 2468 ntTSL 516.75■□□□□ 0.272e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-211ENST00000476127 2152 ntTSL 516.5■□□□□ 0.232e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-229ENST00000636070 1827 ntTSL 216.5■□□□□ 0.232e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-246ENST00000637291 2662 ntTSL 516.22■□□□□ 0.192e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-212ENST00000476226 2379 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.152e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-214ENST00000478594 2110 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-222ENST00000635772 2768 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.12e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-248ENST00000637457 2815 ntTSL 515.61■□□□□ 0.092e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-241ENST00000636978 1613 ntTSL 515.61■□□□□ 0.092e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.062e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-237ENST00000636725 2677 ntTSL 514.78□□□□□ -0.042e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.12e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AMT-217ENST00000491800 3780 nt12.45□□□□□ -0.422e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 AMT-219ENST00000495436 843 ntTSL 212.04□□□□□ -0.482e-10■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 AMT-208ENST00000462048 546 ntTSL 412.02□□□□□ -0.492e-10■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.538e-9■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.118e-9■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 10.6
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PRPF4O43172 RTN3-211ENST00000542238 735 ntTSL 314.71□□□□□ -0.053e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.113e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-214ENST00000545432 545 ntTSL 413.96□□□□□ -0.173e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-214ENST00000524651 914 ntTSL 312.99□□□□□ -0.333e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-207ENST00000536011 992 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-212ENST00000543123 712 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-213ENST00000543552 529 ntTSL 412.56□□□□□ -0.43e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.443e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-204ENST00000377499 3472 ntTSL 211.68□□□□□ -0.543e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.593e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-201ENST00000338850 493 ntTSL 211.36□□□□□ -0.593e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-209ENST00000538995 814 ntTSL 211.04□□□□□ -0.643e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-204ENST00000354497 1407 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.713e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-201ENST00000321797 5647 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.853e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-218ENST00000526202 4121 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.923e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-206ENST00000447038 3165 ntTSL 29.26□□□□□ -0.933e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.973e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-8■□□□□ 10.6
PRPF4O43172 LMO7-211ENST00000485987 1087 ntTSL 58.16□□□□□ -1.13e-8■□□□□ 10.6
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