RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636978.1

AMT-241, Transcript of aminomethyltransferase, humanhuman

TSL 5

Gene AMT, Length 1,613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMT-241ENST00000636978 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.89■■■■□ 3.5
AMT-241ENST00000636978 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.5■■■□□ 2.79
AMT-241ENST00000636978 ABCC9O60706 1549 aa31.05■■■□□ 2.56
AMT-241ENST00000636978 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
AMT-241ENST00000636978 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.59■■■□□ 2.49
AMT-241ENST00000636978 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.58■■■□□ 2.49
AMT-241ENST00000636978 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.44■■■□□ 2.46
AMT-241ENST00000636978 NACADO15069 1562 aa30.39■■■□□ 2.45
AMT-241ENST00000636978 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.25■■■□□ 2.43
AMT-241ENST00000636978 SCRIBQ14160 1630 aa29.71■■■□□ 2.35
AMT-241ENST00000636978 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.62■■■□□ 2.33
AMT-241ENST00000636978 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.48■■■□□ 2.31
AMT-241ENST00000636978 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.2■■■□□ 2.26
AMT-241ENST00000636978 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.253e-6■■■■□ 23.3
AMT-241ENST00000636978 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.61■■■□□ 2.17
AMT-241ENST00000636978 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
AMT-241ENST00000636978 SMARCA4P51532 1647 aa28.48■■■□□ 2.15
AMT-241ENST00000636978 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
AMT-241ENST00000636978 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.42■■■□□ 2.14
AMT-241ENST00000636978 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
AMT-241ENST00000636978 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.34■■■□□ 2.13
AMT-241ENST00000636978 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
AMT-241ENST00000636978 SMARCA2P51531 1590 aa28.18■■■□□ 2.1
AMT-241ENST00000636978 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.18■■■□□ 2.1
AMT-241ENST00000636978 WIZO95785 1651 aa28.16■■■□□ 2.1
AMT-241ENST00000636978 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.12■■■□□ 2.09
AMT-241ENST00000636978 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.12■■■□□ 2.09
AMT-241ENST00000636978 NCAPD3P42695 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
AMT-241ENST00000636978 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
AMT-241ENST00000636978 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
AMT-241ENST00000636978 HMGXB3Q12766 1538 aa27.95■■■□□ 2.07
AMT-241ENST00000636978 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.58■■■□□ 2.01
AMT-241ENST00000636978 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.24■■□□□ 1.95
AMT-241ENST00000636978 CFTRP13569 1480 aa27.22■■□□□ 1.95
AMT-241ENST00000636978 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.18■■□□□ 1.94
AMT-241ENST00000636978 PRDM2Q13029 1718 aa27.1■■□□□ 1.93
AMT-241ENST00000636978 NESP48681 1621 aa27.06■■□□□ 1.92
AMT-241ENST00000636978 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.99■■□□□ 1.91
AMT-241ENST00000636978 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.93■■□□□ 1.9
AMT-241ENST00000636978 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.86■■□□□ 1.89
AMT-241ENST00000636978 ABCC8Q09428 1581 aa26.81■■□□□ 1.88
AMT-241ENST00000636978 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
AMT-241ENST00000636978 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.79■■□□□ 1.88
AMT-241ENST00000636978 ERCC6Q03468 1493 aa26.79■■□□□ 1.88
AMT-241ENST00000636978 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.79■■□□□ 1.88
AMT-241ENST00000636978 TRIM41Q8WV44 630 aa26.72■■□□□ 1.87
AMT-241ENST00000636978 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.64■■□□□ 1.86
AMT-241ENST00000636978 SYNJ1O43426 1573 aa26.63■■□□□ 1.85
AMT-241ENST00000636978 TOP2BQ02880 1626 aa26.63■■□□□ 1.85
AMT-241ENST00000636978 CUX1P39880 1505 aa26.63■■□□□ 1.85
AMT-241ENST00000636978 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.63■■□□□ 1.85
AMT-241ENST00000636978 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.61■■□□□ 1.85
AMT-241ENST00000636978 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
AMT-241ENST00000636978 TOPBP1Q92547 1522 aa26.57■■□□□ 1.84
AMT-241ENST00000636978 WDR62O43379 1518 aa26.51■■□□□ 1.83
AMT-241ENST00000636978 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
AMT-241ENST00000636978 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.45■■□□□ 1.82
AMT-241ENST00000636978 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
AMT-241ENST00000636978 SOGA1O94964 1423 aa26.33■■□□□ 1.8
AMT-241ENST00000636978 IFT140Q96RY7 1462 aa26.25■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.25■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 CUX2O14529 1486 aa26.23■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.23■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 EEA1Q15075 1411 aa26.23■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.21■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 KIF27Q86VH2 1401 aa26.21■■□□□ 1.79
AMT-241ENST00000636978 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
AMT-241ENST00000636978 WDR97A6NE52 1622 aa26.17■■□□□ 1.78
AMT-241ENST00000636978 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
AMT-241ENST00000636978 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.08■■□□□ 1.76
AMT-241ENST00000636978 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
AMT-241ENST00000636978 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.05■■□□□ 1.76
AMT-241ENST00000636978 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.04■■□□□ 1.76
AMT-241ENST00000636978 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.03■■□□□ 1.76
AMT-241ENST00000636978 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
AMT-241ENST00000636978 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
AMT-241ENST00000636978 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.758e-7■■■■□ 24.7
AMT-241ENST00000636978 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.96■■□□□ 1.75
AMT-241ENST00000636978 GRIN2BQ13224 1484 aa25.94■■□□□ 1.74
AMT-241ENST00000636978 IGF1RP08069 1367 aa25.92■■□□□ 1.74
AMT-241ENST00000636978 PBRM1Q86U86 1689 aa25.92■■□□□ 1.74
AMT-241ENST00000636978 CUL7Q14999 1698 aa25.89■■□□□ 1.74
AMT-241ENST00000636978 KIF21BO75037 1637 aa25.84■■□□□ 1.73
AMT-241ENST00000636978 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.84■■□□□ 1.73
AMT-241ENST00000636978 PRXQ9BXM0 1461 aa25.83■■□□□ 1.73
AMT-241ENST00000636978 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
AMT-241ENST00000636978 GOLGA3Q08378 1498 aa25.79■■□□□ 1.72
AMT-241ENST00000636978 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.79■■□□□ 1.72
AMT-241ENST00000636978 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.78■■□□□ 1.72
AMT-241ENST00000636978 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.77■■□□□ 1.72
AMT-241ENST00000636978 ADAMTS12P58397 1594 aa25.76■■□□□ 1.71
AMT-241ENST00000636978 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.71■■□□□ 1.71
AMT-241ENST00000636978 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.68■■□□□ 1.7
AMT-241ENST00000636978 SYNJ2O15056 1496 aa25.68■■□□□ 1.7
AMT-241ENST00000636978 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
AMT-241ENST00000636978 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
AMT-241ENST00000636978 FBLN2P98095 1184 aa25.59■■□□□ 1.69
AMT-241ENST00000636978 GRIN2AQ12879 1464 aa25.59■■□□□ 1.69
AMT-241ENST00000636978 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.57■■□□□ 1.68
AMT-241ENST00000636978 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms