RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533708.1

RAB30-AS1-207, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RAB30-AS1, Length 825 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.65■■■■□ 3.62
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 NACADO15069 1562 aa31.09■■■□□ 2.57
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.08■■■□□ 2.57
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.99■■■□□ 2.55
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SCRIBQ14160 1630 aa30.38■■■□□ 2.45
RAB30-AS1-207ENST00000533708 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.32■■■□□ 2.44
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.11■■■□□ 2.41
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.09■■■□□ 2.41
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.32■■■□□ 2.28
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.05■■■□□ 2.24
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.99■■■□□ 2.23
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.83■■■□□ 2.21
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.8■■■□□ 2.2
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SMARCA2P51531 1590 aa28.76■■■□□ 2.19
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WIZO95785 1651 aa28.74■■■□□ 2.19
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NCAPD3P42695 1498 aa28.72■■■□□ 2.19
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CFTRP13569 1480 aa27.86■■■□□ 2.05
RAB30-AS1-207ENST00000533708 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.84■■■□□ 2.05
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.63■■■□□ 2.01
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PRDM2Q13029 1718 aa27.62■■■□□ 2.01
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.58■■■□□ 2.01
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.55■■■□□ 2
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ERCC6Q03468 1493 aa27.53■■■□□ 2
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.48■■□□□ 1.99
RAB30-AS1-207ENST00000533708 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
RAB30-AS1-207ENST00000533708 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.34■■□□□ 1.97
RAB30-AS1-207ENST00000533708 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCC8Q09428 1581 aa27.29■■□□□ 1.96
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WDR62O43379 1518 aa27.25■■□□□ 1.95
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CUX1P39880 1505 aa27.22■■□□□ 1.95
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TOPBP1Q92547 1522 aa27.21■■□□□ 1.95
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.95
RAB30-AS1-207ENST00000533708 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.2■■□□□ 1.94
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SYNJ1O43426 1573 aa27.14■■□□□ 1.94
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TOP2BQ02880 1626 aa27.09■■□□□ 1.93
RAB30-AS1-207ENST00000533708 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.08■■□□□ 1.93
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CUX2O14529 1486 aa27.06■■□□□ 1.92
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.03■■□□□ 1.92
RAB30-AS1-207ENST00000533708 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.97■■□□□ 1.91
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.92■■□□□ 1.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TRIM41Q8WV44 630 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 SOGA1O94964 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IFT140Q96RY7 1462 aa26.88■■□□□ 1.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.79■■□□□ 1.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 WDR97A6NE52 1622 aa26.77■■□□□ 1.88
RAB30-AS1-207ENST00000533708 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.63■■□□□ 1.85
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.6■■□□□ 1.85
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.58■■□□□ 1.85
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KIF27Q86VH2 1401 aa26.57■■□□□ 1.84
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GRIN2BQ13224 1484 aa26.51■■□□□ 1.83
RAB30-AS1-207ENST00000533708 PBRM1Q86U86 1689 aa26.49■■□□□ 1.83
RAB30-AS1-207ENST00000533708 IGF1RP08069 1367 aa26.46■■□□□ 1.83
RAB30-AS1-207ENST00000533708 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.45■■□□□ 1.83
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.31■■□□□ 1.8
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.29■■□□□ 1.8
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RAB30-AS1-207ENST00000533708 PRXQ9BXM0 1461 aa26.24■■□□□ 1.79
RAB30-AS1-207ENST00000533708 FBLN2P98095 1184 aa26.21■■□□□ 1.79
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CHD1O14646 1710 aa26.2■■□□□ 1.79
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GRIN2AQ12879 1464 aa26.19■■□□□ 1.78
RAB30-AS1-207ENST00000533708 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.17■■□□□ 1.78
RAB30-AS1-207ENST00000533708 KIF21BO75037 1637 aa26.1■■□□□ 1.77
RAB30-AS1-207ENST00000533708 NUP160Q12769 1436 aa26.06■■□□□ 1.76
RAB30-AS1-207ENST00000533708 CEP170Q5SW79 1584 aa26.06■■□□□ 1.76
RAB30-AS1-207ENST00000533708 OSCARQ8IYS5 282 aa26.02■■□□□ 1.76
RAB30-AS1-207ENST00000533708 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26■■□□□ 1.75
RAB30-AS1-207ENST00000533708 GOLGA3Q08378 1498 aa25.99■■□□□ 1.75
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