Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ACACA-225ENST00000612120 566 ntTSL 46.23□□□□□ -1.412e-9■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 ACACA-233ENST00000614450 591 ntTSL 45.64□□□□□ -1.512e-9■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.351e-7■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 SHOX2-206ENST00000554685 439 ntTSL 513.51□□□□□ -0.251e-7■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 SHOX2-205ENST00000490689 4184 ntTSL 512.47□□□□□ -0.411e-7■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 CABIN1-208ENST00000467937 593 ntTSL 318.29■□□□□ 0.521e-7■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 STIP1-209ENST00000540736 399 ntTSL 25.58□□□□□ -1.523e-11■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 G3BP1-205ENST00000518726 869 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.751e-6■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 PICALM-217ENST00000531930 703 ntTSL 57.12□□□□□ -1.272e-7■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 PICALM-223ENST00000534412 811 ntTSL 56.3□□□□□ -1.42e-7■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.021e-6■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 214.6□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 C16orf58-208ENST00000567673 766 ntTSL 211.96□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 CMSS1-206ENST00000491299 881 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.961e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 15.9
TARDBPQ13148 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 15.9
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TARDBPQ13148 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-12■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.876e-10■■■□□ 15.8
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TARDBPQ13148 MARCH3-202ENST00000502289 764 ntTSL 419.39■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 15.8
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TARDBPQ13148 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.789e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 15.8
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TARDBPQ13148 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ATP2A2-202ENST00000313432 5575 ntTSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.121e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ATP2A2-212ENST00000553144 264 ntTSL 1 (best)4.4□□□□□ -1.711e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 TTC17-201ENST00000039989 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.141e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 210.97□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 37.14□□□□□ -1.271e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.67e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 LRRC8B-204ENST00000449440 763 ntTSL 324.08■■□□□ 1.451e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.131e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 LRRC8B-205ENST00000639264 7736 ntAPPRIS P1 TSL 56.13□□□□□ -1.431e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.61e-7■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.14e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.384e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.44e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 LARP4B-201ENST00000316157 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■□□ 15.8
TARDBPQ13148 RAP1GAP-203ENST00000374757 1328 ntTSL 524.27■■□□□ 1.484e-6■■■□□ 15.7
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