Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TARDBPQ13148 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.781e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 43.81□□□□□ -1.81e-40■■■■■ 68.7
TARDBPQ13148 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.054e-18■■■■■ 68.7
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TARDBPQ13148 TMEM39A-202ENST00000438581 4393 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.172e-19■■■■■ 68.6
TARDBPQ13148 TMEM39A-206ENST00000473684 3043 ntTSL 55.22□□□□□ -1.572e-19■■■■■ 68.6
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