RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.81■■■■■ 4.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.19■■■■□ 3.38
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC9O60706 1549 aa35.38■■■■□ 3.25
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.09■■■■□ 3.05
RABGEF1-204ENST00000442563 NACADO15069 1562 aa34.09■■■■□ 3.05
RABGEF1-204ENST00000442563 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.08■■■■□ 3.05
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
RABGEF1-204ENST00000442563 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.95■■■■□ 3.03
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.8■■■■□ 3
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.18■■■□□ 2.9
RABGEF1-204ENST00000442563 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.13■■■□□ 2.89
RABGEF1-204ENST00000442563 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.03■■■□□ 2.88
RABGEF1-204ENST00000442563 SCRIBQ14160 1630 aa32.98■■■□□ 2.87
RABGEF1-204ENST00000442563 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.76■■■□□ 2.84
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.52■■■□□ 2.8
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
RABGEF1-204ENST00000442563 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32■■■□□ 2.71
RABGEF1-204ENST00000442563 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.82■■■□□ 2.68
RABGEF1-204ENST00000442563 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
RABGEF1-204ENST00000442563 SMARCA4P51532 1647 aa31.59■■■□□ 2.65
RABGEF1-204ENST00000442563 NCAPD3P42695 1498 aa31.51■■■□□ 2.63
RABGEF1-204ENST00000442563 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.48■■■□□ 2.63
RABGEF1-204ENST00000442563 SMARCA2P51531 1590 aa31.43■■■□□ 2.62
RABGEF1-204ENST00000442563 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.42■■■□□ 2.62
RABGEF1-204ENST00000442563 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.34■■■□□ 2.61
RABGEF1-204ENST00000442563 HMGXB3Q12766 1538 aa31.27■■■□□ 2.6
RABGEF1-204ENST00000442563 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
RABGEF1-204ENST00000442563 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
RABGEF1-204ENST00000442563 WIZO95785 1651 aa31.03■■■□□ 2.56
RABGEF1-204ENST00000442563 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
RABGEF1-204ENST00000442563 NESP48681 1621 aa30.62■■■□□ 2.49
RABGEF1-204ENST00000442563 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.59■■■□□ 2.49
RABGEF1-204ENST00000442563 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.58■■■□□ 2.49
RABGEF1-204ENST00000442563 ERCC6Q03468 1493 aa30.5■■■□□ 2.47
RABGEF1-204ENST00000442563 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.45■■■□□ 2.46
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.42■■■□□ 2.46
RABGEF1-204ENST00000442563 CFTRP13569 1480 aa30.38■■■□□ 2.45
RABGEF1-204ENST00000442563 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
RABGEF1-204ENST00000442563 CUX2O14529 1486 aa30.21■■■□□ 2.43
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.18■■■□□ 2.42
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.17■■■□□ 2.42
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.12■■■□□ 2.41
RABGEF1-204ENST00000442563 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
RABGEF1-204ENST00000442563 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.07■■■□□ 2.4
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM2Q13029 1718 aa29.99■■■□□ 2.39
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR62O43379 1518 aa29.96■■■□□ 2.39
RABGEF1-204ENST00000442563 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCC8Q09428 1581 aa29.77■■■□□ 2.36
RABGEF1-204ENST00000442563 TOPBP1Q92547 1522 aa29.69■■■□□ 2.34
RABGEF1-204ENST00000442563 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.64■■■□□ 2.33
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT140Q96RY7 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
RABGEF1-204ENST00000442563 CUX1P39880 1505 aa29.46■■■□□ 2.31
RABGEF1-204ENST00000442563 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
RABGEF1-204ENST00000442563 SOGA1O94964 1423 aa29.37■■■□□ 2.29
RABGEF1-204ENST00000442563 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.36■■■□□ 2.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
RABGEF1-204ENST00000442563 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
RABGEF1-204ENST00000442563 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.31■■■□□ 2.28
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.29■■■□□ 2.28
RABGEF1-204ENST00000442563 TOP2BQ02880 1626 aa29.22■■■□□ 2.27
RABGEF1-204ENST00000442563 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.27
RABGEF1-204ENST00000442563 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.19■■■□□ 2.26
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNJ1O43426 1573 aa29.18■■■□□ 2.26
RABGEF1-204ENST00000442563 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR97A6NE52 1622 aa29.15■■■□□ 2.26
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.12■■■□□ 2.25
RABGEF1-204ENST00000442563 OSCARQ8IYS5 282 aa29.05■■■□□ 2.24
RABGEF1-204ENST00000442563 GRIN2BQ13224 1484 aa29■■■□□ 2.23
RABGEF1-204ENST00000442563 GAPVD1Q14C86 1478 aa29■■■□□ 2.23
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.92■■■□□ 2.22
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RABGEF1-204ENST00000442563 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.91■■■□□ 2.22
RABGEF1-204ENST00000442563 FBLN2P98095 1184 aa28.86■■■□□ 2.21
RABGEF1-204ENST00000442563 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
RABGEF1-204ENST00000442563 PBRM1Q86U86 1689 aa28.8■■■□□ 2.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNJ2O15056 1496 aa28.79■■■□□ 2.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.76■■■□□ 2.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CHD1O14646 1710 aa28.75■■■□□ 2.19
RABGEF1-204ENST00000442563 KIF27Q86VH2 1401 aa28.74■■■□□ 2.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM41Q8WV44 630 aa28.71■■■□□ 2.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.69■■■□□ 2.18
RABGEF1-204ENST00000442563 IGF1RP08069 1367 aa28.65■■■□□ 2.18
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS12P58397 1594 aa28.63■■■□□ 2.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GRIN2AQ12879 1464 aa28.6■■■□□ 2.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.53■■■□□ 2.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NUP160Q12769 1436 aa28.51■■■□□ 2.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.47■■■□□ 2.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CUL7Q14999 1698 aa28.45■■■□□ 2.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF11O15085 1522 aa28.45■■■□□ 2.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.43■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP170Q5SW79 1584 aa28.41■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.41■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.39■■■□□ 2.14
RABGEF1-204ENST00000442563 JPH4Q96JJ6 628 aa28.28■■■□□ 2.12
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.27■■■□□ 2.12
RABGEF1-204ENST00000442563 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.27■■■□□ 2.12
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