RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1-202ENST00000380828 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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RABGEF1-202ENST00000380828 APLP2Q06481 763 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-202ENST00000380828 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.06□□□□□ -0.48
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RABGEF1-202ENST00000380828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.06□□□□□ -0.64
RABGEF1-202ENST00000380828 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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RABGEF1-202ENST00000380828 C14orf37Q86TY3 774 aa10.25□□□□□ -0.77
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZMYND15Q9H091 742 aa10.09□□□□□ -0.79
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RABGEF1-202ENST00000380828 PRDM2Q13029 1718 aa10.07□□□□□ -0.8
RABGEF1-202ENST00000380828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-202ENST00000380828 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.03□□□□□ -0.8
RABGEF1-202ENST00000380828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP6R1Q9UPN7 881 aa10.02□□□□□ -0.81
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.01□□□□□ -0.81
RABGEF1-202ENST00000380828 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa10.01□□□□□ -0.81
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