RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622474.4

HYOU1-222, Transcript of hypoxia up-regulated 1, human

TSL 2

Gene HYOU1, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HYOU1-222	ENST00000622474	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.03	■■■■■ 4
HYOU1-222	ENST00000622474	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.75	■■■■□ 3.31
HYOU1-222	ENST00000622474	ABCC9	O60706	1549 aa		35.21	■■■■□ 3.23
HYOU1-222	ENST00000622474	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.75	■■■□□ 2.99
HYOU1-222	ENST00000622474	NACAD	O15069	1562 aa		33.64	■■■□□ 2.98
HYOU1-222	ENST00000622474	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.45	■■■□□ 2.95
HYOU1-222	ENST00000622474	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.36	■■■□□ 2.93
HYOU1-222	ENST00000622474	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.29	■■■□□ 2.92
HYOU1-222	ENST00000622474	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.12	■■■□□ 2.89
HYOU1-222	ENST00000622474	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.1	■■■□□ 2.89
HYOU1-222	ENST00000622474	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.82	■■■□□ 2.84
HYOU1-222	ENST00000622474	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HYOU1-222	ENST00000622474	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.6	■■■□□ 2.81
HYOU1-222	ENST00000622474	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.58	■■■□□ 2.81
HYOU1-222	ENST00000622474	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.36	■■■□□ 2.77
HYOU1-222	ENST00000622474	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
HYOU1-222	ENST00000622474	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.87	■■■□□ 2.69
HYOU1-222	ENST00000622474	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.66	■■■□□ 2.66
HYOU1-222	ENST00000622474	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.14	■■■□□ 2.58
HYOU1-222	ENST00000622474	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.04	■■■□□ 2.56
HYOU1-222	ENST00000622474	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
HYOU1-222	ENST00000622474	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.02	■■■□□ 2.56
HYOU1-222	ENST00000622474	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.96	■■■□□ 2.55
HYOU1-222	ENST00000622474	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.88	■■■□□ 2.53
HYOU1-222	ENST00000622474	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.86	■■■□□ 2.53
HYOU1-222	ENST00000622474	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.85	■■■□□ 2.53
HYOU1-222	ENST00000622474	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.73	■■■□□ 2.51
HYOU1-222	ENST00000622474	WIZ	O95785	1651 aa		30.53	■■■□□ 2.48
HYOU1-222	ENST00000622474	NES	P48681	1621 aa		30.4	■■■□□ 2.46
HYOU1-222	ENST00000622474	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.38	■■■□□ 2.45
HYOU1-222	ENST00000622474	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.33	■■■□□ 2.45
HYOU1-222	ENST00000622474	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.28	■■■□□ 2.44
HYOU1-222	ENST00000622474	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.17	■■■□□ 2.42
HYOU1-222	ENST00000622474	CUX2	O14529	1486 aa		30.15	■■■□□ 2.42
HYOU1-222	ENST00000622474	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.1	■■■□□ 2.41
HYOU1-222	ENST00000622474	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.09	■■■□□ 2.41
HYOU1-222	ENST00000622474	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.04	■■■□□ 2.4
HYOU1-222	ENST00000622474	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.04	■■■□□ 2.4
HYOU1-222	ENST00000622474	CFTR	P13569	1480 aa		29.88	■■■□□ 2.37
HYOU1-222	ENST00000622474	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.8	■■■□□ 2.36
HYOU1-222	ENST00000622474	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HYOU1-222	ENST00000622474	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.77	■■■□□ 2.36
HYOU1-222	ENST00000622474	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HYOU1-222	ENST00000622474	WDR62	O43379	1518 aa		29.72	■■■□□ 2.35
HYOU1-222	ENST00000622474	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.72	■■■□□ 2.35
HYOU1-222	ENST00000622474	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.55	■■■□□ 2.32
HYOU1-222	ENST00000622474	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
HYOU1-222	ENST00000622474	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
HYOU1-222	ENST00000622474	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.28	■■■□□ 2.28
HYOU1-222	ENST00000622474	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.22	■■■□□ 2.27
HYOU1-222	ENST00000622474	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.22	■■■□□ 2.27
HYOU1-222	ENST00000622474	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.14	■■■□□ 2.26
HYOU1-222	ENST00000622474	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
HYOU1-222	ENST00000622474	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
HYOU1-222	ENST00000622474	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
HYOU1-222	ENST00000622474	CUX1	P39880	1505 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HYOU1-222	ENST00000622474	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
HYOU1-222	ENST00000622474	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.89	■■■□□ 2.22
HYOU1-222	ENST00000622474	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.88	■■■□□ 2.21
HYOU1-222	ENST00000622474	SOGA1	O94964	1423 aa		28.85	■■■□□ 2.21
HYOU1-222	ENST00000622474	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21	9e-8	■■■■■ 27.4
HYOU1-222	ENST00000622474	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.8	■■■□□ 2.2
HYOU1-222	ENST00000622474	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HYOU1-222	ENST00000622474	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
HYOU1-222	ENST00000622474	CHD1	O14646	1710 aa		28.68	■■■□□ 2.18
HYOU1-222	ENST00000622474	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.66	■■■□□ 2.18
HYOU1-222	ENST00000622474	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.64	■■■□□ 2.18
HYOU1-222	ENST00000622474	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.63	■■■□□ 2.17
HYOU1-222	ENST00000622474	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.62	■■■□□ 2.17	4e-7	■■■□□ 16.7
HYOU1-222	ENST00000622474	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.6	■■■□□ 2.17
HYOU1-222	ENST00000622474	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.57	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.56	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
HYOU1-222	ENST00000622474	FBLN2	P98095	1184 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HYOU1-222	ENST00000622474	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HYOU1-222	ENST00000622474	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HYOU1-222	ENST00000622474	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HYOU1-222	ENST00000622474	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.41	■■■□□ 2.14
HYOU1-222	ENST00000622474	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.41	■■■□□ 2.14
HYOU1-222	ENST00000622474	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.4	■■■□□ 2.14
HYOU1-222	ENST00000622474	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
HYOU1-222	ENST00000622474	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.33	■■■□□ 2.13
HYOU1-222	ENST00000622474	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.28	■■■□□ 2.12
HYOU1-222	ENST00000622474	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.25	■■■□□ 2.11
HYOU1-222	ENST00000622474	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.21	■■■□□ 2.11
HYOU1-222	ENST00000622474	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.18	■■■□□ 2.1
HYOU1-222	ENST00000622474	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.15	■■■□□ 2.1
HYOU1-222	ENST00000622474	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.11	■■■□□ 2.09
HYOU1-222	ENST00000622474	NUP160	Q12769	1436 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HYOU1-222	ENST00000622474	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.09	■■■□□ 2.09
HYOU1-222	ENST00000622474	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.04	■■■□□ 2.08
HYOU1-222	ENST00000622474	IGF1R	P08069	1367 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HYOU1-222	ENST00000622474	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HYOU1-222	ENST00000622474	CUL7	Q14999	1698 aa		27.96	■■■□□ 2.07
HYOU1-222	ENST00000622474	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.93	■■■□□ 2.06
HYOU1-222	ENST00000622474	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HYOU1-222	ENST00000622474	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.79	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.3 ms