RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.28■■□□□ 1.32
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RABGEF1-208ENST00000510829 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.84■□□□□ 0.77
RABGEF1-208ENST00000510829 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
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RABGEF1-208ENST00000510829 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.02■□□□□ 0.63
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RABGEF1-208ENST00000510829 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.58■□□□□ 0.56
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RABGEF1-208ENST00000510829 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.32■□□□□ 0.52
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RABGEF1-208ENST00000510829 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
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RABGEF1-208ENST00000510829 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.07■□□□□ 0.48
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RABGEF1-208ENST00000510829 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.8■□□□□ 0.44
RABGEF1-208ENST00000510829 SMARCA4P51532 1647 aa17.76■□□□□ 0.43
RABGEF1-208ENST00000510829 BICRAQ9NZM4 1560 aa17.69■□□□□ 0.42
RABGEF1-208ENST00000510829 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
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RABGEF1-208ENST00000510829 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
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RABGEF1-208ENST00000510829 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
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RABGEF1-208ENST00000510829 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.35■□□□□ 0.37
RABGEF1-208ENST00000510829 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 SOGA1O94964 1423 aa17.31■□□□□ 0.36
RABGEF1-208ENST00000510829 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1-208ENST00000510829 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.2■□□□□ 0.34
RABGEF1-208ENST00000510829 EEA1Q15075 1411 aa17.19■□□□□ 0.34
RABGEF1-208ENST00000510829 NCAPD3P42695 1498 aa17.15■□□□□ 0.34
RABGEF1-208ENST00000510829 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP162Q5TB80 1403 aa17.11■□□□□ 0.33
RABGEF1-208ENST00000510829 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.1■□□□□ 0.33
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RABGEF1-208ENST00000510829 GOLGA3Q08378 1498 aa17.07■□□□□ 0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 HMGXB3Q12766 1538 aa17.06■□□□□ 0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
RABGEF1-208ENST00000510829 CEP164Q9UPV0 1460 aa17■□□□□ 0.31
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RABGEF1-208ENST00000510829 CADPSQ9ULU8 1353 aa16.88■□□□□ 0.29
RABGEF1-208ENST00000510829 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa16.87■□□□□ 0.29
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF27Q86VH2 1401 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-208ENST00000510829 CUX1P39880 1505 aa16.84■□□□□ 0.29
RABGEF1-208ENST00000510829 KIF21BO75037 1637 aa16.84■□□□□ 0.29
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RABGEF1-208ENST00000510829 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
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RABGEF1-208ENST00000510829 FANCD2Q9BXW9 1451 aa16.7■□□□□ 0.26
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RABGEF1-208ENST00000510829 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.45■□□□□ 0.22
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RABGEF1-208ENST00000510829 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
RABGEF1-208ENST00000510829 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 FHOD3Q2V2M9 1422 aa16.33■□□□□ 0.2
RABGEF1-208ENST00000510829 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.32■□□□□ 0.2
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RABGEF1-208ENST00000510829 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.31■□□□□ 0.2
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