Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 D2HGDH-205ENST00000432449 566 ntTSL 521.87■■□□□ 1.099e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 D2HGDH-211ENST00000467427 555 ntTSL 321.87■■□□□ 1.099e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAD1L1-213ENST00000455998 557 ntTSL 421.81■■□□□ 1.089e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.059e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 NUDT14-205ENST00000550912 541 ntTSL 319.9■□□□□ 0.789e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-206ENST00000563980 546 ntTSL 419.9■□□□□ 0.789e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-217ENST00000568705 659 ntTSL 319.46■□□□□ 0.719e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-213ENST00000565957 549 ntTSL 418.81■□□□□ 0.69e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-213ENST00000568411 599 ntTSL 317.97■□□□□ 0.479e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-203ENST00000434376 3342 ntTSL 1 (best)17.87■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-209ENST00000576012 3292 ntTSL 217.37■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.289e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.269e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-204ENST00000561855 672 ntTSL 516.01■□□□□ 0.159e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-213ENST00000509388 569 ntTSL 315.75■□□□□ 0.119e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 315.65■□□□□ 0.19e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.089e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.049e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-202ENST00000502316 855 ntTSL 215.22■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-208ENST00000507247 616 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.019e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RAB4B-EGLN2-202ENST00000596216 624 ntTSL 314.84□□□□□ -0.039e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-215ENST00000511843 586 ntTSL 514.78□□□□□ -0.049e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.059e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 MAZ-206ENST00000562557 475 ntTSL 314.49□□□□□ -0.099e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.139e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 INPP5A-205ENST00000445580 610 ntTSL 514.19□□□□□ -0.149e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.149e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.249e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-218ENST00000513284 517 ntTSL 413.24□□□□□ -0.299e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)13.04□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 CLCF1-202ENST00000533438 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-212ENST00000509258 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.449e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-216ENST00000568664 341 ntTSL 511.43□□□□□ -0.589e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 GAS8-205ENST00000561675 486 ntTSL 310.94□□□□□ -0.669e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-221ENST00000513643 516 ntTSL 310.67□□□□□ -0.79e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.089e-9■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 CLK2-205ENST00000476983 1885 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.897e-31■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.667e-31■■■■■ 35.7
GTF2F1P35269 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.137e-8■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 527.53■■■□□ 21e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 322.35■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 E4F1-209ENST00000569796 5931 ntTSL 219.59■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 ABCA2-209ENST00000463603 655 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 GIPR-206ENST00000591224 782 ntTSL 217.36■□□□□ 0.373e-7■■■■■ 35.6
GTF2F1P35269 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)12.71□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 310.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 CLOCK-203ENST00000435527 746 ntTSL 319.95■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 MLLT10-207ENST00000430455 184 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.032e-11■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 MLLT10-209ENST00000462999 344 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 MLLT10-212ENST00000476557 490 ntTSL 1 (best)7.28□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 513.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.929e-10■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 PRPF19-202ENST00000535326 779 ntTSL 514.16□□□□□ -0.149e-10■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 PRPF19-205ENST00000540473 169 ntTSL 57.59□□□□□ -1.199e-10■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-215ENST00000624193 463 ntTSL 417.62■□□□□ 0.416e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-217ENST00000624668 583 ntTSL 517.6■□□□□ 0.416e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-211ENST00000623321 1860 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-208ENST00000622960 628 ntTSL 514.49□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-214ENST00000624166 4272 ntTSL 1 (best)13.8□□□□□ -0.26e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-213ENST00000624032 3071 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.236e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.366e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.56e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)4.39□□□□□ -1.716e-9■■■■■ 35.5
GTF2F1P35269 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-63■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 IRF3-214ENST00000596788 447 ntTSL 321.92■■□□□ 1.19e-10■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.569e-10■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 IRF3-210ENST00000595240 567 ntTSL 217.81■□□□□ 0.449e-10■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 DDX3X-214ENST00000622373 2129 nt23.77■■□□□ 1.44e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 DDX3X-210ENST00000615313 568 ntTSL 421.46■■□□□ 1.034e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 DDX3X-208ENST00000611546 442 ntTSL 518.46■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 DDX3X-213ENST00000622198 409 ntTSL 418.46■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 NAT10-202ENST00000527971 1600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 NAT10-205ENST00000531159 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.723e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 NAT10-210ENST00000615292 3329 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -13e-7■■■■■ 35.4
GTF2F1P35269 MBOAT7-210ENST00000474910 629 ntTSL 221.56■■□□□ 1.041e-8■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 TMC6-209ENST00000588087 2384 ntTSL 225.09■■□□□ 1.614e-8■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.494e-8■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 RAB1A-205ENST00000494188 771 ntTSL 224.97■■□□□ 1.598e-9■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.278e-9■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.218e-9■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.748e-9■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.218e-9■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 ZNF580-204ENST00000590190 335 ntTSL 321.33■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 35.3
GTF2F1P35269 FTCD-208ENST00000480950 318 ntTSL 327.73■■■□□ 2.036e-14■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 FTCD-207ENST00000469240 458 ntTSL 323.46■■□□□ 1.353e-17■■■■■ 35.2
GTF2F1P35269 CDC42BPA-203ENST00000366766 10610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.243e-27■■■■■ 35.2
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 101.6 ms